34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0438 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0438  hypothetical protein  100 
 
 		 426 aa  859    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0154  hypothetical protein  63.4 
 
 		 424 aa  525  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3642  hypothetical protein  33.43 
 
 		 826 aa  159  7e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3730  hypothetical protein  40 
 
 		 681 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  25.95 
 
 		 407 aa  77.8  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  26.95 
 
 		 490 aa  72.4  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4005  putative polysaccharide degradation protein  27.68 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4334  putative polysaccharide degradation protein  29.23 
 
 		 322 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00591589  hitchhiker  0.00216824 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0404  endoglucanase family protein  27.02 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0413  endoglucanase family protein  27.02 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0980  glycoside hydrolase family 26  30.86 
 
 		 409 aa  63.9  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268802 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0392  endoglucanase family protein  26.67 
 
 		 285 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.564061 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1778  hypothetical protein  25.77 
 
 		 429 aa  59.7  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290923  normal  0.113414 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06050  hypothetical protein  26.3 
 
 		 314 aa  58.9  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2423  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2956  beta-mannanase-like protein  29.36 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4187  Beta-mannanase-like protein  30.58 
 
 		 334 aa  54.7  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2139  Beta-mannanase-like  29.17 
 
 		 519 aa  54.3  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.926185 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3259  glycoside hydrolase family protein  30.43 
 
 		 330 aa  53.5  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0478  endoglucanase family protein  24.68 
 
 		 314 aa  52.8  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.634525  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3669  putative cellulase H precursor protein  24.76 
 
 		 325 aa  52.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  hitchhiker  0.00741413 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1791  beta-mannanase  27.75 
 
 		 302 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0568404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7663  hypothetical protein  25.44 
 
 		 366 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0547  endoglucanase family protein  25 
 
 		 314 aa  52.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0157  Beta-mannanase  27.75 
 
 		 299 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3193  glycoside hydrolase family 26  30.58 
 
 		 519 aa  51.2  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000819014 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2073  copper amine oxidase-like  30.23 
 
 		 652 aa  51.2  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.195333 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4412  endoglucanase family protein  24.3 
 
 		 314 aa  50.1  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239026  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1162  putative endoglucanase  28.91 
 
 		 520 aa  48.5  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  23.79 
 
 		 900 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1334  Beta-mannanase-like protein  26.06 
 
 		 307 aa  48.5  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.65985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0871  Beta-mannanase-like protein  27.31 
 
 		 442 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4957  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  28.1 
 
 		 409 aa  44.3  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283853  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3531  glycoside hydrolase family 26  32.06 
 
 		 313 aa  43.5  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3766  glycosyltransferase  25.45 
 
 		 880 aa  43.1  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.028255 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>