33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0154 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0154  hypothetical protein  100 
 
 		 424 aa  863    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0438  hypothetical protein  63.88 
 
 		 426 aa  518  1e-146  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3642  hypothetical protein  35.99 
 
 		 826 aa  176  7e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3730  hypothetical protein  38.57 
 
 		 681 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  28.29 
 
 		 407 aa  94.4  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1778  hypothetical protein  28.66 
 
 		 429 aa  69.7  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290923  normal  0.113414 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4005  putative polysaccharide degradation protein  23.92 
 
 		 322 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0980  glycoside hydrolase family 26  28.47 
 
 		 409 aa  63.9  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268802 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  26.07 
 
 		 490 aa  61.2  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2956  beta-mannanase-like protein  26.38 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0404  endoglucanase family protein  28.05 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0413  endoglucanase family protein  28.05 
 
 		 285 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0392  endoglucanase family protein  27.64 
 
 		 285 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.564061 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1162  putative endoglucanase  23.79 
 
 		 520 aa  56.6  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4334  putative polysaccharide degradation protein  22.89 
 
 		 322 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00591589  hitchhiker  0.00216824 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06050  hypothetical protein  24.78 
 
 		 314 aa  55.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2423  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2073  copper amine oxidase-like  24.48 
 
 		 652 aa  55.1  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.195333 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2139  Beta-mannanase-like  23.14 
 
 		 519 aa  54.3  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.926185 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0478  endoglucanase family protein  22.43 
 
 		 314 aa  53.5  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.634525  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0547  endoglucanase family protein  23.57 
 
 		 314 aa  53.1  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4187  Beta-mannanase-like protein  25.48 
 
 		 334 aa  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3193  glycoside hydrolase family 26  26.67 
 
 		 519 aa  50.8  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000819014 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1334  Beta-mannanase-like protein  24.27 
 
 		 307 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.65985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3259  glycoside hydrolase family protein  30.77 
 
 		 330 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0209  endoglucanase  31.62 
 
 		 351 aa  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.405756  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3669  putative cellulase H precursor protein  21.62 
 
 		 325 aa  47.4  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  hitchhiker  0.00741413 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  24.88 
 
 		 900 aa  47.4  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4412  endoglucanase family protein  22.43 
 
 		 314 aa  47.4  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239026  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  20.42 
 
 		 644 aa  46.6  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0871  Beta-mannanase-like protein  32.17 
 
 		 442 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1517  endoglucanase  25.28 
 
 		 375 aa  45.1  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.966231 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0602  hypothetical protein  25.11 
 
 		 360 aa  43.9  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1791  beta-mannanase  22.15 
 
 		 302 aa  43.1  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0568404  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>