65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2956 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2956  beta-mannanase-like protein  100 
 
 
415 aa  819    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0871  Beta-mannanase-like protein  75.06 
 
 
442 aa  574  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0980  glycoside hydrolase family 26  71.26 
 
 
409 aa  551  1e-155  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268802 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  55.15 
 
 
407 aa  415  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0392  endoglucanase family protein  47.06 
 
 
285 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.564061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0404  endoglucanase family protein  47.06 
 
 
300 aa  240  4e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0413  endoglucanase family protein  46.1 
 
 
285 aa  239  5e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  43.8 
 
 
490 aa  193  5e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3193  glycoside hydrolase family 26  37.99 
 
 
519 aa  180  4.999999999999999e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000819014 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  41.6 
 
 
900 aa  170  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3259  glycoside hydrolase family protein  37.76 
 
 
330 aa  161  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1162  putative endoglucanase  32.3 
 
 
520 aa  160  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4187  Beta-mannanase-like protein  38.43 
 
 
334 aa  150  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06050  hypothetical protein  35.25 
 
 
314 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2423  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1517  endoglucanase  34.03 
 
 
375 aa  143  7e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.966231 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0209  endoglucanase  36.63 
 
 
351 aa  142  9e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.405756  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2139  Beta-mannanase-like  33.89 
 
 
519 aa  129  7.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.926185 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  34.36 
 
 
1231 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1096  hypothetical protein  23.53 
 
 
533 aa  107  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1016  hypothetical protein  27.34 
 
 
345 aa  94.7  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1791  beta-mannanase  30.71 
 
 
302 aa  87  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0568404  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0157  Beta-mannanase  30.71 
 
 
299 aa  86.7  7e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1756  hypothetical protein  30.97 
 
 
358 aa  83.2  0.000000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0425875 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1311  Beta-mannanase  28.38 
 
 
348 aa  77.4  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0780804 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3975  hypothetical protein  27.27 
 
 
374 aa  77  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125368  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0986  hypothetical protein  31.89 
 
 
335 aa  75.5  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3766  glycosyltransferase  30.9 
 
 
880 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.028255 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3669  putative cellulase H precursor protein  25.87 
 
 
325 aa  73.2  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  hitchhiker  0.00741413 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1334  Beta-mannanase-like protein  27.95 
 
 
307 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.65985  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3043  Beta-mannanase-like protein  27.75 
 
 
558 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0756266 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  28.69 
 
 
644 aa  67.8  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2752  PKD domain containing protein  29.65 
 
 
620 aa  67.4  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.215191  hitchhiker  0.0000249109 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3458  hypothetical protein  35.78 
 
 
649 aa  66.6  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0547  endoglucanase family protein  34.31 
 
 
314 aa  65.9  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3203  hypothetical protein  22.75 
 
 
367 aa  63.9  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4412  endoglucanase family protein  26.36 
 
 
314 aa  61.6  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239026  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7663  hypothetical protein  26 
 
 
366 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0206  putative cellulase H precursor protein  24.6 
 
 
321 aa  61.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.147392 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0154  hypothetical protein  26.67 
 
 
424 aa  60.1  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0478  endoglucanase family protein  33.09 
 
 
314 aa  60.1  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.634525  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0293  hypothetical protein  30.91 
 
 
443 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.753993 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0865  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  37.33 
 
 
886 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4005  putative polysaccharide degradation protein  30.83 
 
 
322 aa  57.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4334  putative polysaccharide degradation protein  30.08 
 
 
322 aa  57.4  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00591589  hitchhiker  0.00216824 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0438  hypothetical protein  27.84 
 
 
426 aa  57.4  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4957  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  30.25 
 
 
409 aa  56.2  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283853  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5502  hypothetical protein  31.86 
 
 
496 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0681729  normal  0.325123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1778  hypothetical protein  36.04 
 
 
429 aa  54.7  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290923  normal  0.113414 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0602  hypothetical protein  26.99 
 
 
360 aa  54.7  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3714  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  29.5 
 
 
506 aa  54.7  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2043  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  24.67 
 
 
364 aa  54.3  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89512  normal  0.955908 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0565  hypothetical protein  29.38 
 
 
524 aa  54.3  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.333932  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0801  hypothetical protein  33.33 
 
 
901 aa  53.1  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0459133 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6518  hypothetical protein  30.33 
 
 
427 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0207  hypothetical protein  25.6 
 
 
376 aa  50.1  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8589  hypothetical protein  26.75 
 
 
357 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321522  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3531  glycoside hydrolase family 26  37.04 
 
 
313 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2729  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  20.86 
 
 
383 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3138  hypothetical protein  24.71 
 
 
344 aa  47  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.368738  normal  0.136262 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4953  glycoside hydrolase family protein  27.71 
 
 
376 aa  46.6  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0519766  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3929  hypothetical protein  32.46 
 
 
580 aa  46.2  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  27.74 
 
 
591 aa  43.5  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0277  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  30.43 
 
 
469 aa  43.5  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2073  copper amine oxidase-like  26.1 
 
 
652 aa  43.5  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.195333 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5393  glycoside hydrolase family 26  32.35 
 
 
342 aa  43.1  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000752871  normal  0.295957 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>