37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0801 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0801  hypothetical protein  100 
 
 		 901 aa  1748    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0459133 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3929  hypothetical protein  63.96 
 
 		 580 aa  478  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6518  hypothetical protein  45.65 
 
 		 427 aa  347  4e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0293  hypothetical protein  47.74 
 
 		 443 aa  335  2e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.753993 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3671  hypothetical protein  42.03 
 
 		 613 aa  256  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0687047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1060  hypothetical protein  46.76 
 
 		 351 aa  253  9.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.177161  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0207  hypothetical protein  40.93 
 
 		 376 aa  250  1e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6864  hypothetical protein  41.02 
 
 		 533 aa  249  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1061  FHA domain-containing protein  40.67 
 
 		 605 aa  242  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00105103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0795  hypothetical protein  41.95 
 
 		 417 aa  234  6e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.578649  normal  0.0307748 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5502  hypothetical protein  40.27 
 
 		 496 aa  201  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0681729  normal  0.325123 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3458  hypothetical protein  40.86 
 
 		 649 aa  187  8e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0558  hypothetical protein  33.92 
 
 		 380 aa  131  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.161142  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1778  hypothetical protein  30.75 
 
 		 429 aa  91.3  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290923  normal  0.113414 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0565  hypothetical protein  27.05 
 
 		 524 aa  82.8  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.333932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  33.33 
 
 		 407 aa  58.5  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  25.08 
 
 		 2914 aa  58.2  0.0000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4623  hypothetical protein  23.57 
 
 		 680 aa  55.5  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2956  beta-mannanase-like protein  33.33 
 
 		 415 aa  53.1  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  34.51 
 
 		 490 aa  53.5  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  30.77 
 
 		 2851 aa  50.4  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0980  glycoside hydrolase family 26  29.36 
 
 		 409 aa  50.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268802 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0467  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  24.67 
 
 		 380 aa  48.9  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0404  endoglucanase family protein  38.27 
 
 		 300 aa  49.3  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0413  endoglucanase family protein  38.27 
 
 		 285 aa  48.9  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2729  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  29.13 
 
 		 383 aa  48.1  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1756  hypothetical protein  30 
 
 		 358 aa  48.1  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0425875 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1162  putative endoglucanase  24.17 
 
 		 520 aa  47.8  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4957  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  36.84 
 
 		 409 aa  47.8  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283853  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0392  endoglucanase family protein  37.97 
 
 		 285 aa  47.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.564061 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3201  hypothetical protein  27.52 
 
 		 289 aa  47  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00013826  hitchhiker  0.000976632 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0871  Beta-mannanase-like protein  29.09 
 
 		 442 aa  46.6  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 590 aa  45.8  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2073  copper amine oxidase-like  33.72 
 
 		 652 aa  46.2  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.195333 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32124  predicted protein  49.09 
 
 		 312 aa  45.4  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.099626  normal  0.0197604 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1334  Beta-mannanase-like protein  31.71 
 
 		 307 aa  45.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.65985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4187  Beta-mannanase-like protein  30.15 
 
 		 334 aa  44.3  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>