19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6864 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6864  hypothetical protein  100 
 
 
533 aa  1067    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0795  hypothetical protein  58.94 
 
 
417 aa  429  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.578649  normal  0.0307748 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0207  hypothetical protein  52.45 
 
 
376 aa  377  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1060  hypothetical protein  59.61 
 
 
351 aa  376  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.177161  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1061  FHA domain-containing protein  45.55 
 
 
605 aa  269  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00105103  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3929  hypothetical protein  39.22 
 
 
580 aa  251  2e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3671  hypothetical protein  41.72 
 
 
613 aa  249  7e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0687047  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0801  hypothetical protein  43.39 
 
 
901 aa  241  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0459133 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6518  hypothetical protein  43.79 
 
 
427 aa  239  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0293  hypothetical protein  43.46 
 
 
443 aa  229  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.753993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5502  hypothetical protein  39.73 
 
 
496 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0681729  normal  0.325123 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3458  hypothetical protein  34.26 
 
 
649 aa  159  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0558  hypothetical protein  32.88 
 
 
380 aa  113  8.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.161142  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0565  hypothetical protein  28.21 
 
 
524 aa  84.3  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.333932  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4623  hypothetical protein  27.11 
 
 
680 aa  77.8  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1778  hypothetical protein  31.9 
 
 
429 aa  77  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290923  normal  0.113414 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  28.68 
 
 
407 aa  44.7  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3201  hypothetical protein  27.14 
 
 
289 aa  43.9  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00013826  hitchhiker  0.000976632 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2364  hypothetical protein  33.33 
 
 
148 aa  43.9  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.111037 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>