39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6518 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6518  hypothetical protein  100 
 
 		 427 aa  860    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0293  hypothetical protein  64.43 
 
 		 443 aa  500  1e-140  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.753993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0801  hypothetical protein  45.23 
 
 		 901 aa  332  9e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0459133 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3929  hypothetical protein  50.96 
 
 		 580 aa  322  7e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3671  hypothetical protein  44.71 
 
 		 613 aa  274  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0687047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0795  hypothetical protein  47.44 
 
 		 417 aa  256  4e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.578649  normal  0.0307748 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1060  hypothetical protein  46.8 
 
 		 351 aa  256  7e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.177161  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0207  hypothetical protein  46.26 
 
 		 376 aa  255  8e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1061  FHA domain-containing protein  44.9 
 
 		 605 aa  255  9e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00105103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6864  hypothetical protein  43.2 
 
 		 533 aa  248  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5502  hypothetical protein  42.81 
 
 		 496 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0681729  normal  0.325123 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3458  hypothetical protein  41.8 
 
 		 649 aa  201  3e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0558  hypothetical protein  29.75 
 
 		 380 aa  114  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.161142  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1778  hypothetical protein  34.87 
 
 		 429 aa  99.8  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290923  normal  0.113414 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0565  hypothetical protein  29.41 
 
 		 524 aa  86.7  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.333932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4623  hypothetical protein  27.24 
 
 		 680 aa  71.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  32.08 
 
 		 490 aa  60.1  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1162  putative endoglucanase  27.67 
 
 		 520 aa  59.3  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0980  glycoside hydrolase family 26  34.58 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268802 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3201  hypothetical protein  28 
 
 		 289 aa  55.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00013826  hitchhiker  0.000976632 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  32.41 
 
 		 407 aa  53.9  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2956  beta-mannanase-like protein  31.53 
 
 		 415 aa  51.2  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0404  endoglucanase family protein  31.25 
 
 		 300 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3193  glycoside hydrolase family 26  25.63 
 
 		 519 aa  50.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000819014 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0413  endoglucanase family protein  31.25 
 
 		 285 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0392  endoglucanase family protein  31.25 
 
 		 285 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.564061 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0209  endoglucanase  31.03 
 
 		 351 aa  49.7  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.405756  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4957  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  36.71 
 
 		 409 aa  48.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283853  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0871  Beta-mannanase-like protein  31.15 
 
 		 442 aa  47  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1791  beta-mannanase  29.52 
 
 		 302 aa  46.6  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0568404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1334  Beta-mannanase-like protein  30.84 
 
 		 307 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.65985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3203  hypothetical protein  26.05 
 
 		 367 aa  46.6  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0157  Beta-mannanase  29.52 
 
 		 299 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0467  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  30.23 
 
 		 380 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1756  hypothetical protein  24.42 
 
 		 358 aa  44.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0425875 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4187  Beta-mannanase-like protein  28.93 
 
 		 334 aa  44.3  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0547  endoglucanase family protein  34.15 
 
 		 314 aa  43.5  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2729  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  27.27 
 
 		 383 aa  43.5  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3259  glycoside hydrolase family protein  29.41 
 
 		 330 aa  43.1  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>