30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0207 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0207  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  771    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1060  hypothetical protein  62.88 
 
 		 351 aa  440  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.177161  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0795  hypothetical protein  57.74 
 
 		 417 aa  394  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.578649  normal  0.0307748 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6864  hypothetical protein  57.59 
 
 		 533 aa  379  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3929  hypothetical protein  45.82 
 
 		 580 aa  262  6.999999999999999e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1061  FHA domain-containing protein  47.28 
 
 		 605 aa  262  8.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00105103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3671  hypothetical protein  44.14 
 
 		 613 aa  257  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0687047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6518  hypothetical protein  46.23 
 
 		 427 aa  255  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0801  hypothetical protein  44.56 
 
 		 901 aa  247  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0459133 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0293  hypothetical protein  43.97 
 
 		 443 aa  235  8e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.753993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5502  hypothetical protein  40.53 
 
 		 496 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0681729  normal  0.325123 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3458  hypothetical protein  38.91 
 
 		 649 aa  179  4.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0558  hypothetical protein  31.21 
 
 		 380 aa  119  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.161142  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0565  hypothetical protein  28.85 
 
 		 524 aa  97.4  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.333932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1778  hypothetical protein  29.27 
 
 		 429 aa  88.2  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290923  normal  0.113414 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4623  hypothetical protein  26.18 
 
 		 680 aa  71.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3201  hypothetical protein  29.73 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00013826  hitchhiker  0.000976632 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  33.33 
 
 		 490 aa  59.7  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1162  putative endoglucanase  25.24 
 
 		 520 aa  59.3  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4957  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  24.03 
 
 		 409 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283853  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  26.88 
 
 		 900 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  30.26 
 
 		 407 aa  50.8  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2956  beta-mannanase-like protein  25.6 
 
 		 415 aa  50.4  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0392  endoglucanase family protein  26.24 
 
 		 285 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.564061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0404  endoglucanase family protein  25.86 
 
 		 300 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0209  endoglucanase  27.59 
 
 		 351 aa  46.2  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.405756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0413  endoglucanase family protein  25.86 
 
 		 285 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1311  Beta-mannanase  28.68 
 
 		 348 aa  44.3  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0780804 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0157  Beta-mannanase  34.33 
 
 		 299 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1791  beta-mannanase  34.33 
 
 		 302 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0568404  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>