55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3458 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3458  hypothetical protein  100 
 
 		 649 aa  1333    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5502  hypothetical protein  55.95 
 
 		 496 aa  527  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0681729  normal  0.325123 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1061  FHA domain-containing protein  43.42 
 
 		 605 aa  222  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00105103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3671  hypothetical protein  41.75 
 
 		 613 aa  212  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0687047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3929  hypothetical protein  40.88 
 
 		 580 aa  211  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6518  hypothetical protein  43.46 
 
 		 427 aa  205  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1060  hypothetical protein  41.35 
 
 		 351 aa  197  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.177161  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0801  hypothetical protein  41.86 
 
 		 901 aa  197  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0459133 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0207  hypothetical protein  39.86 
 
 		 376 aa  192  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0293  hypothetical protein  41.97 
 
 		 443 aa  181  4.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.753993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6864  hypothetical protein  34.54 
 
 		 533 aa  177  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0795  hypothetical protein  34.16 
 
 		 417 aa  172  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.578649  normal  0.0307748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2607  hypothetical protein  35.14 
 
 		 755 aa  157  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.459804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3593  hypothetical protein  32.03 
 
 		 723 aa  116  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.27604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1778  hypothetical protein  34.84 
 
 		 429 aa  97.8  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290923  normal  0.113414 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0558  hypothetical protein  27.4 
 
 		 380 aa  95.9  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.161142  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0565  hypothetical protein  29.74 
 
 		 524 aa  94.4  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.333932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3201  hypothetical protein  28.42 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00013826  hitchhiker  0.000976632 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1082  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.21 
 
 		 517 aa  72.4  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.286531 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6193  glycoside hydrolase family 43  33.1 
 
 		 502 aa  72.4  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4623  hypothetical protein  27.3 
 
 		 680 aa  71.2  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6626  parallel beta-helix repeat protein  27 
 
 		 1011 aa  71.2  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442384  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4311  hypothetical protein  29.54 
 
 		 1405 aa  70.9  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.861205  normal  0.589522 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  37.72 
 
 		 407 aa  69.7  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2051  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.38 
 
 		 491 aa  67.8  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  29.66 
 
 		 932 aa  67.8  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2956  beta-mannanase-like protein  35.78 
 
 		 415 aa  66.2  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3200  polysaccharide deacetylase  30.08 
 
 		 594 aa  65.9  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000473135  hitchhiker  0.00151321 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1843  FucA  28.89 
 
 		 750 aa  64.7  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4312  hypothetical protein  27.47 
 
 		 1413 aa  64.3  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.319357  normal  0.568612 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0871  Beta-mannanase-like protein  33.94 
 
 		 442 aa  63.9  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  29.48 
 
 		 490 aa  62.4  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0980  glycoside hydrolase family 26  35.78 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268802 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1162  putative endoglucanase  29.19 
 
 		 520 aa  62  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3193  glycoside hydrolase family 26  28.65 
 
 		 519 aa  59.7  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000819014 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4187  Beta-mannanase-like protein  30.43 
 
 		 334 aa  56.6  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3259  glycoside hydrolase family protein  31.43 
 
 		 330 aa  55.1  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0441  hypothetical protein  38.54 
 
 		 814 aa  54.7  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1922  Endopygalactorunase-like protein  30.93 
 
 		 669 aa  52.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.449199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0404  endoglucanase family protein  32.41 
 
 		 300 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0392  endoglucanase family protein  32.41 
 
 		 285 aa  51.6  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.564061 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0413  endoglucanase family protein  32.41 
 
 		 285 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0209  endoglucanase  26.64 
 
 		 351 aa  51.2  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.405756  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2060  hypothetical protein  30.17 
 
 		 312 aa  48.5  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.145529  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0127  PKD domain containing protein  30 
 
 		 931 aa  48.5  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00188311 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1629  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.23 
 
 		 482 aa  48.1  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2664  hypothetical protein  29.17 
 
 		 975 aa  48.1  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000490986  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2752  PKD domain containing protein  25.71 
 
 		 620 aa  46.6  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.215191  hitchhiker  0.0000249109 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3517  putative O-antigen related protein  32.61 
 
 		 645 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0419564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2753  hypothetical protein  28.44 
 
 		 1597 aa  45.4  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264647 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  28.83 
 
 		 900 aa  45.8  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1311  Beta-mannanase  27.03 
 
 		 348 aa  45.4  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0780804 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0125  Endopygalactorunase-like protein  30.59 
 
 		 633 aa  45.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300956  normal  0.0208856 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2850  hypothetical protein  27.93 
 
 		 665 aa  44.7  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2995  hypothetical protein  28.71 
 
 		 369 aa  43.9  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>