29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3929 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3929  hypothetical protein  100 
 
 		 580 aa  1154    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0801  hypothetical protein  64.05 
 
 		 901 aa  465  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0459133 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6518  hypothetical protein  52.92 
 
 		 427 aa  321  3e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0293  hypothetical protein  49.05 
 
 		 443 aa  320  6e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.753993 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1060  hypothetical protein  47.96 
 
 		 351 aa  265  1e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.177161  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0207  hypothetical protein  45.48 
 
 		 376 aa  262  1e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3671  hypothetical protein  45.27 
 
 		 613 aa  262  1e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0687047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6864  hypothetical protein  40.86 
 
 		 533 aa  250  6e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1061  FHA domain-containing protein  45.39 
 
 		 605 aa  248  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00105103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0795  hypothetical protein  38.48 
 
 		 417 aa  245  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.578649  normal  0.0307748 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5502  hypothetical protein  41.64 
 
 		 496 aa  213  7e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0681729  normal  0.325123 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3458  hypothetical protein  40.24 
 
 		 649 aa  200  7.999999999999999e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0558  hypothetical protein  35.48 
 
 		 380 aa  130  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.161142  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0565  hypothetical protein  29.74 
 
 		 524 aa  90.5  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.333932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1778  hypothetical protein  32.07 
 
 		 429 aa  80.1  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290923  normal  0.113414 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4623  hypothetical protein  23.29 
 
 		 680 aa  60.5  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  34.62 
 
 		 490 aa  58.5  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4957  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  36.36 
 
 		 409 aa  52.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283853  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3201  hypothetical protein  27.2 
 
 		 289 aa  49.3  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00013826  hitchhiker  0.000976632 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1791  beta-mannanase  29.89 
 
 		 302 aa  47.8  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0568404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0157  Beta-mannanase  29.89 
 
 		 299 aa  47.8  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  30.63 
 
 		 407 aa  46.2  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0980  glycoside hydrolase family 26  31.25 
 
 		 409 aa  45.8  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268802 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4187  Beta-mannanase-like protein  30.36 
 
 		 334 aa  46.2  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2956  beta-mannanase-like protein  32.46 
 
 		 415 aa  45.4  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1162  putative endoglucanase  25.23 
 
 		 520 aa  45.1  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1334  Beta-mannanase-like protein  31.25 
 
 		 307 aa  44.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.65985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0871  Beta-mannanase-like protein  31.86 
 
 		 442 aa  45.1  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2073  copper amine oxidase-like  32.56 
 
 		 652 aa  43.5  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.195333 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>