59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0871 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0871  Beta-mannanase-like protein  100 
 
 		 442 aa  874    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2956  beta-mannanase-like protein  77.89 
 
 		 415 aa  576  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0980  glycoside hydrolase family 26  74.07 
 
 		 409 aa  569  1e-161  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268802 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  57.49 
 
 		 407 aa  431  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0392  endoglucanase family protein  44.98 
 
 		 285 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.564061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0404  endoglucanase family protein  44.98 
 
 		 300 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0413  endoglucanase family protein  44.98 
 
 		 285 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  42.38 
 
 		 490 aa  179  8e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  41.83 
 
 		 900 aa  177  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3193  glycoside hydrolase family 26  37.54 
 
 		 519 aa  166  5e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000819014 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1162  putative endoglucanase  32.49 
 
 		 520 aa  155  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4187  Beta-mannanase-like protein  38.16 
 
 		 334 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3259  glycoside hydrolase family protein  36.14 
 
 		 330 aa  145  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06050  hypothetical protein  40.36 
 
 		 314 aa  144  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2423  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1517  endoglucanase  32.4 
 
 		 375 aa  138  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.966231 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0209  endoglucanase  32.07 
 
 		 351 aa  133  7.999999999999999e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.405756  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  34.48 
 
 		 1231 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2139  Beta-mannanase-like  30.29 
 
 		 519 aa  116  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.926185 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1096  hypothetical protein  22.39 
 
 		 533 aa  97.8  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1016  hypothetical protein  26.72 
 
 		 345 aa  82.4  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1791  beta-mannanase  30.08 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0568404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0157  Beta-mannanase  30.08 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3975  hypothetical protein  28.25 
 
 		 374 aa  77.8  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1311  Beta-mannanase  27.34 
 
 		 348 aa  77.8  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0780804 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3766  glycosyltransferase  31.3 
 
 		 880 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.028255 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1756  hypothetical protein  29.74 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0425875 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0986  hypothetical protein  29.51 
 
 		 335 aa  70.9  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  28.69 
 
 		 644 aa  68.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3669  putative cellulase H precursor protein  27.8 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  hitchhiker  0.00741413 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0865  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.43 
 
 		 886 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3043  Beta-mannanase-like protein  27.78 
 
 		 558 aa  66.6  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0756266 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2752  PKD domain containing protein  29.51 
 
 		 620 aa  65.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.215191  hitchhiker  0.0000249109 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3458  hypothetical protein  33.94 
 
 		 649 aa  63.9  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1334  Beta-mannanase-like protein  27.31 
 
 		 307 aa  62.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.65985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0206  putative cellulase H precursor protein  24.58 
 
 		 321 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147392 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0547  endoglucanase family protein  33.33 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0478  endoglucanase family protein  32.35 
 
 		 314 aa  56.6  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.634525  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4412  endoglucanase family protein  25 
 
 		 314 aa  55.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239026  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3203  hypothetical protein  21.88 
 
 		 367 aa  54.7  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0154  hypothetical protein  26.45 
 
 		 424 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7663  hypothetical protein  24 
 
 		 366 aa  53.9  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5502  hypothetical protein  33.04 
 
 		 496 aa  53.9  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0681729  normal  0.325123 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0438  hypothetical protein  26.67 
 
 		 426 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3714  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  30.95 
 
 		 506 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1778  hypothetical protein  35.14 
 
 		 429 aa  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290923  normal  0.113414 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4005  putative polysaccharide degradation protein  29.32 
 
 		 322 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4334  putative polysaccharide degradation protein  26.47 
 
 		 322 aa  51.2  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00591589  hitchhiker  0.00216824 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0565  hypothetical protein  27.54 
 
 		 524 aa  50.4  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.333932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2043  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  23.33 
 
 		 364 aa  50.1  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89512  normal  0.955908 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3531  glycoside hydrolase family 26  35.8 
 
 		 313 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4957  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  31.33 
 
 		 409 aa  48.9  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283853  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6518  hypothetical protein  31.15 
 
 		 427 aa  46.6  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0602  hypothetical protein  25.97 
 
 		 360 aa  46.6  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0801  hypothetical protein  29.09 
 
 		 901 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0459133 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3929  hypothetical protein  31.86 
 
 		 580 aa  44.3  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2729  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  18.89 
 
 		 383 aa  44.3  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0293  hypothetical protein  24.55 
 
 		 443 aa  44.3  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.753993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8589  hypothetical protein  25.73 
 
 		 357 aa  43.5  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4371  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  35.11 
 
 		 561 aa  43.1  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000045691  normal  0.581959 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>