43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4334 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4334  putative polysaccharide degradation protein  100 
 
 		 322 aa  660    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00591589  hitchhiker  0.00216824 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4005  putative polysaccharide degradation protein  89.44 
 
 		 322 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4412  endoglucanase family protein  52.56 
 
 		 314 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239026  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0478  endoglucanase family protein  50.31 
 
 		 314 aa  328  6e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.634525  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0547  endoglucanase family protein  50.31 
 
 		 314 aa  326  3e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0206  putative cellulase H precursor protein  55.11 
 
 		 321 aa  322  7e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147392 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3669  putative cellulase H precursor protein  49.68 
 
 		 325 aa  314  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  hitchhiker  0.00741413 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0157  Beta-mannanase  48.65 
 
 		 299 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1791  beta-mannanase  48.65 
 
 		 302 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0568404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1334  Beta-mannanase-like protein  48.26 
 
 		 307 aa  269  5e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.65985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3766  glycosyltransferase  37.11 
 
 		 880 aa  168  9e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.028255 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0865  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  36.26 
 
 		 886 aa  152  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3043  Beta-mannanase-like protein  28.85 
 
 		 558 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0756266 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0404  endoglucanase family protein  27.92 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0392  endoglucanase family protein  27.92 
 
 		 285 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.564061 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0413  endoglucanase family protein  27.92 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0986  hypothetical protein  32.52 
 
 		 335 aa  77.8  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3259  glycoside hydrolase family protein  26.32 
 
 		 330 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1311  Beta-mannanase  29.69 
 
 		 348 aa  69.7  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0780804 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06050  hypothetical protein  26.07 
 
 		 314 aa  67.8  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2423  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0980  glycoside hydrolase family 26  25.88 
 
 		 409 aa  67.4  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268802 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2752  PKD domain containing protein  26.88 
 
 		 620 aa  66.2  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.215191  hitchhiker  0.0000249109 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0438  hypothetical protein  29.23 
 
 		 426 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  30.85 
 
 		 490 aa  65.1  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7663  hypothetical protein  29.44 
 
 		 366 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2073  copper amine oxidase-like  37.86 
 
 		 652 aa  63.9  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.195333 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0209  endoglucanase  28.46 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.405756  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  26.35 
 
 		 407 aa  60.8  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2956  beta-mannanase-like protein  30.08 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3203  hypothetical protein  24.51 
 
 		 367 aa  57.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3975  hypothetical protein  25 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0154  hypothetical protein  23.08 
 
 		 424 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0602  hypothetical protein  26.79 
 
 		 360 aa  53.9  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  25.24 
 
 		 1231 aa  53.5  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2139  Beta-mannanase-like  28.7 
 
 		 519 aa  53.1  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.926185 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0871  Beta-mannanase-like protein  23.19 
 
 		 442 aa  53.1  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1016  hypothetical protein  27.33 
 
 		 345 aa  52.8  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4187  Beta-mannanase-like protein  30.56 
 
 		 334 aa  52.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3193  glycoside hydrolase family 26  27.04 
 
 		 519 aa  52.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000819014 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0016  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  31.13 
 
 		 558 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.929015  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1756  hypothetical protein  23 
 
 		 358 aa  45.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0425875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0801  hypothetical protein  28.57 
 
 		 901 aa  43.1  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0459133 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8589  hypothetical protein  21.82 
 
 		 357 aa  42.4  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321522  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>