66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4187 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4187  Beta-mannanase-like protein  100 
 
 
334 aa  671    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3193  glycoside hydrolase family 26  33.23 
 
 
519 aa  165  8e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000819014 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1162  putative endoglucanase  31.19 
 
 
520 aa  152  8.999999999999999e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2956  beta-mannanase-like protein  38.43 
 
 
415 aa  150  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  31.83 
 
 
407 aa  149  6e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3259  glycoside hydrolase family protein  32.06 
 
 
330 aa  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0871  Beta-mannanase-like protein  38.21 
 
 
442 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0392  endoglucanase family protein  34.01 
 
 
285 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.564061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0404  endoglucanase family protein  34.01 
 
 
300 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0413  endoglucanase family protein  34.01 
 
 
285 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0980  glycoside hydrolase family 26  39.53 
 
 
409 aa  139  6e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268802 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  32.57 
 
 
490 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06050  hypothetical protein  29.14 
 
 
314 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2423  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  28.73 
 
 
900 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2139  Beta-mannanase-like  28.51 
 
 
519 aa  99.8  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.926185 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0209  endoglucanase  28.92 
 
 
351 aa  97.4  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.405756  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  32.47 
 
 
1231 aa  96.7  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1517  endoglucanase  28.97 
 
 
375 aa  95.5  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.966231 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1311  Beta-mannanase  32.28 
 
 
348 aa  85.9  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0780804 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0986  hypothetical protein  30.73 
 
 
335 aa  84  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7663  hypothetical protein  28.32 
 
 
366 aa  82.8  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1096  hypothetical protein  25.4 
 
 
533 aa  82  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1016  hypothetical protein  28.2 
 
 
345 aa  78.6  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3975  hypothetical protein  31.14 
 
 
374 aa  77  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125368  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3203  hypothetical protein  29.1 
 
 
367 aa  74.7  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0602  hypothetical protein  29.96 
 
 
360 aa  72  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1756  hypothetical protein  30.69 
 
 
358 aa  64.7  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0425875 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3138  hypothetical protein  25.46 
 
 
344 aa  64.3  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.368738  normal  0.136262 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2752  PKD domain containing protein  27.42 
 
 
620 aa  61.6  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.215191  hitchhiker  0.0000249109 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1791  beta-mannanase  24.75 
 
 
302 aa  59.7  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0568404  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0157  Beta-mannanase  24.47 
 
 
299 aa  59.3  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3458  hypothetical protein  30.43 
 
 
649 aa  56.6  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3043  Beta-mannanase-like protein  27.86 
 
 
558 aa  56.2  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0756266 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4412  endoglucanase family protein  29.21 
 
 
314 aa  55.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239026  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1334  Beta-mannanase-like protein  23.56 
 
 
307 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.65985  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0438  hypothetical protein  31.4 
 
 
426 aa  54.3  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0547  endoglucanase family protein  27.68 
 
 
314 aa  53.9  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3669  putative cellulase H precursor protein  28.8 
 
 
325 aa  53.9  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  hitchhiker  0.00741413 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0478  endoglucanase family protein  27.98 
 
 
314 aa  53.5  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.634525  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3714  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  26.67 
 
 
506 aa  53.1  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4334  putative polysaccharide degradation protein  30.56 
 
 
322 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00591589  hitchhiker  0.00216824 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0154  hypothetical protein  25.48 
 
 
424 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4953  glycoside hydrolase family protein  30.23 
 
 
376 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0519766  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  27.06 
 
 
644 aa  51.2  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4005  putative polysaccharide degradation protein  26.06 
 
 
322 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0467  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  26.19 
 
 
380 aa  50.4  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6532  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  26.15 
 
 
584 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2073  copper amine oxidase-like  36.28 
 
 
652 aa  48.9  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.195333 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2729  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  29.03 
 
 
383 aa  48.5  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  24.88 
 
 
591 aa  47.4  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4957  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  31.33 
 
 
409 aa  46.6  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283853  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5502  hypothetical protein  29.31 
 
 
496 aa  46.6  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0681729  normal  0.325123 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3929  hypothetical protein  30.36 
 
 
580 aa  46.2  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3531  glycoside hydrolase family 26  33.33 
 
 
313 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0752  glycoside hydrolase family 26  24.26 
 
 
577 aa  45.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000240761  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0031  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  32.74 
 
 
701 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0166776 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0016  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  30.14 
 
 
558 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.929015  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0293  hypothetical protein  28.7 
 
 
443 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.753993 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0565  hypothetical protein  27.03 
 
 
524 aa  44.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.333932  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6518  hypothetical protein  28.93 
 
 
427 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0801  hypothetical protein  30.83 
 
 
901 aa  44.3  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0459133 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2276  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  21.37 
 
 
532 aa  43.9  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000457486  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3691  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  25 
 
 
506 aa  43.5  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000437019  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2043  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  22.15 
 
 
364 aa  43.5  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89512  normal  0.955908 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03336  conserved hypothetical protein  25.99 
 
 
315 aa  43.1  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.139072  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0206  putative cellulase H precursor protein  25 
 
 
321 aa  43.1  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.147392 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>