38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3691 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3691  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  100 
 
 		 506 aa  1033    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000437019  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2276  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  32.03 
 
 		 532 aa  232  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000457486  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1071  glycoside hydrolase family protein  33.47 
 
 		 728 aa  230  5e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.535323  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0277  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  37.28 
 
 		 469 aa  207  5e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0031  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  34.51 
 
 		 701 aa  199  9e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166776 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  32.54 
 
 		 815 aa  197  3e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6532  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  35.06 
 
 		 584 aa  189  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0016  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  31.85 
 
 		 558 aa  189  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.929015  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  34.6 
 
 		 591 aa  186  8e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0752  glycoside hydrolase family 26  31.65 
 
 		 577 aa  179  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000240761  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07413  endomannanase (Eurofung)  36.83 
 
 		 355 aa  177  3e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1551  glycoside hydrolase family 26  32.56 
 
 		 583 aa  176  6e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000398696  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  32.38 
 
 		 590 aa  169  9e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0629  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  31.59 
 
 		 417 aa  162  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.286201  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03336  conserved hypothetical protein  30.65 
 
 		 315 aa  145  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.139072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2128  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  28.57 
 
 		 857 aa  127  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00114643  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3714  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  29.62 
 
 		 506 aa  123  9e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5393  glycoside hydrolase family 26  27.46 
 
 		 342 aa  114  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000752871  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  30.96 
 
 		 694 aa  113  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1626  glycoside hydrolase family protein  28.18 
 
 		 506 aa  104  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000010667  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  29.37 
 
 		 711 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3531  glycoside hydrolase family 26  31.44 
 
 		 313 aa  94.7  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03326  conserved hypothetical protein  30.32 
 
 		 341 aa  94.7  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4957  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  26.9 
 
 		 409 aa  85.5  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283853  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2043  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  26.35 
 
 		 364 aa  81.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89512  normal  0.955908 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4953  glycoside hydrolase family protein  27.5 
 
 		 376 aa  78.2  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0519766  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3032  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  25.59 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0467  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  24.75 
 
 		 380 aa  74.3  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2729  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  27.12 
 
 		 383 aa  71.2  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2491  glycoside hydrolase family protein  24.24 
 
 		 458 aa  64.7  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2228  glycoside hydrolase family 5  37.88 
 
 		 403 aa  48.5  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0980  glycoside hydrolase family 26  32.98 
 
 		 409 aa  46.6  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268802 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0656  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.68 
 
 		 507 aa  46.6  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  30 
 
 		 900 aa  45.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  32.56 
 
 		 407 aa  45.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4187  Beta-mannanase-like protein  30.7 
 
 		 334 aa  45.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1096  hypothetical protein  27.47 
 
 		 533 aa  44.7  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2956  beta-mannanase-like protein  30 
 
 		 415 aa  43.9  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>