43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0277 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0277  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  100 
 
 		 469 aa  962    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6532  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  46.06 
 
 		 584 aa  380  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0016  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  40.59 
 
 		 558 aa  339  5e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.929015  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2276  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  42.55 
 
 		 532 aa  335  7e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000457486  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1071  glycoside hydrolase family protein  41.37 
 
 		 728 aa  324  2e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.535323  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  38.51 
 
 		 815 aa  318  1e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  38.37 
 
 		 591 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0752  glycoside hydrolase family 26  36.78 
 
 		 577 aa  293  5e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000240761  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07413  endomannanase (Eurofung)  47.01 
 
 		 355 aa  269  8.999999999999999e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0629  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  38.29 
 
 		 417 aa  249  8e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.286201  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  36.29 
 
 		 590 aa  244  3.9999999999999997e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2128  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  32.44 
 
 		 857 aa  224  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00114643  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1551  glycoside hydrolase family 26  35.01 
 
 		 583 aa  222  9e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000398696  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03336  conserved hypothetical protein  38.96 
 
 		 315 aa  217  4e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.139072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3691  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  36.98 
 
 		 506 aa  203  4e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000437019  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0031  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  34.98 
 
 		 701 aa  202  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166776 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03326  conserved hypothetical protein  40 
 
 		 341 aa  174  2.9999999999999996e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3714  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  30.37 
 
 		 506 aa  148  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5393  glycoside hydrolase family 26  27.83 
 
 		 342 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000752871  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1626  glycoside hydrolase family protein  38.01 
 
 		 506 aa  110  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000010667  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  30.77 
 
 		 694 aa  106  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3032  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  24.93 
 
 		 385 aa  97.8  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2043  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  29.2 
 
 		 364 aa  97.4  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89512  normal  0.955908 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2729  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  27.21 
 
 		 383 aa  97.1  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0467  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  25.07 
 
 		 380 aa  87.4  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3531  glycoside hydrolase family 26  33 
 
 		 313 aa  83.2  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4957  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  28 
 
 		 409 aa  81.3  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283853  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4953  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 376 aa  79.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0519766  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4674  glycoside hydrolase family 5  34.19 
 
 		 443 aa  73.9  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  25.74 
 
 		 711 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2491  glycoside hydrolase family protein  30.32 
 
 		 458 aa  66.6  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3707  Carbohydrate binding family 6  34.26 
 
 		 1000 aa  50.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176968  normal  0.212982 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  30.34 
 
 		 2073 aa  49.3  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2655  Carbohydrate binding family 6  28.47 
 
 		 847 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1096  hypothetical protein  32.56 
 
 		 533 aa  46.6  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3203  hypothetical protein  28.08 
 
 		 367 aa  45.8  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  33.64 
 
 		 1091 aa  45.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  33.61 
 
 		 649 aa  44.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2956  beta-mannanase-like protein  31.3 
 
 		 415 aa  44.7  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  26.89 
 
 		 1231 aa  44.3  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  34.57 
 
 		 407 aa  44.3  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5502  hypothetical protein  31.53 
 
 		 496 aa  43.5  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0681729  normal  0.325123 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2308  hypothetical protein  30.56 
 
 		 511 aa  43.1  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819182 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>