126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3464 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  100 
 
 		 649 aa  1307    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3719  exo-poly-alpha-D-galacturonosidase precursor  29.7 
 
 		 537 aa  186  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1170  glycoside hydrolase family protein  29.87 
 
 		 548 aa  171  4e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3754  Endopygalactorunase  31.76 
 
 		 983 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3115  glycoside hydrolase family protein  26.17 
 
 		 509 aa  146  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1710  glycoside hydrolase family 28  26.68 
 
 		 518 aa  139  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190203  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3113  glycoside hydrolase family 28  28.24 
 
 		 524 aa  136  9e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00001805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2888  glycoside hydrolase family 28  24.9 
 
 		 530 aa  135  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.022046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  55.2 
 
 		 809 aa  127  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1579  glycoside hydrolase family 28  26.59 
 
 		 492 aa  123  8e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0814382 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0717  glycoside hydrolase family 28  28.74 
 
 		 559 aa  123  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1008  Pectate disaccharide-lyase  48.8 
 
 		 540 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8075  Carbohydrate binding family 6  49.58 
 
 		 401 aa  115  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1581  glycoside hydrolase family 28  22.98 
 
 		 489 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0871574 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3977  glycoside hydrolase family 28  26.26 
 
 		 543 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.722531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  41.46 
 
 		 554 aa  105  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  37.59 
 
 		 831 aa  105  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  37.5 
 
 		 820 aa  99.8  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2655  Carbohydrate binding family 6  47.93 
 
 		 847 aa  99  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3114  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 479 aa  96.7  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2818  glycoside hydrolase family 28  24.8 
 
 		 542 aa  96.7  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0824  glycoside hydrolase family 28  23.62 
 
 		 444 aa  93.2  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0972  glycoside hydrolase family 28  25.06 
 
 		 448 aa  90.5  8e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  37.24 
 
 		 789 aa  88.6  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3217  glycoside hydrolase family protein  26.56 
 
 		 491 aa  87.8  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1051  Serine O-acetyltransferase  42.2 
 
 		 700 aa  86.3  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2380  Galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  25.84 
 
 		 447 aa  85.9  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0943  ribosomal protein S5  41.09 
 
 		 1316 aa  85.1  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215001 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2115  glycoside hydrolase family protein  26.08 
 
 		 460 aa  85.5  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4790  glycoside hydrolase family 28  23.31 
 
 		 541 aa  84.7  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0680897  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6865  glycoside hydrolase family 31  40.82 
 
 		 1016 aa  84.7  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1650  pseudouridine synthase, Rsu  41.8 
 
 		 914 aa  83.2  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  33.33 
 
 		 2073 aa  82  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2308  hypothetical protein  37.84 
 
 		 511 aa  81.6  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819182 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6877  hypothetical protein  27.32 
 
 		 543 aa  79.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0249011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2947  hypothetical protein  38.98 
 
 		 574 aa  78.6  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00368039  normal  0.813372 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3030  glycoside hydrolase family 28  25.72 
 
 		 467 aa  78.2  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3371  glycoside hydrolase family 28  23.26 
 
 		 444 aa  77  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0942  ribosomal protein L18  41.67 
 
 		 769 aa  75.9  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000113865  hitchhiker  0.00163221 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6953  glycoside hydrolase family 28  27.36 
 
 		 390 aa  75.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1092  glycoside hydrolase family 28  24.79 
 
 		 460 aa  75.9  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2311  hypothetical protein  37.61 
 
 		 772 aa  75.1  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699121  normal  0.0238538 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2736  glycoside hydrolase family protein  23.75 
 
 		 518 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.835022  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3223  glycoside hydrolase family 28  24.5 
 
 		 460 aa  72  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.362624  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2391  glycoside hydrolase family 28  24.92 
 
 		 470 aa  72  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880928  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3881  Pectate lyase-like  35.59 
 
 		 747 aa  70.1  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000360789  normal  0.117799 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  32.11 
 
 		 922 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3707  Carbohydrate binding family 6  36.69 
 
 		 1000 aa  69.7  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176968  normal  0.212982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2300  glycoside hydrolase family 28  24.66 
 
 		 455 aa  68.9  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3932  glycoside hydrolase family 43  27.57 
 
 		 456 aa  68.2  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6906  glycoside hydrolase family 16  42.42 
 
 		 628 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00349487  hitchhiker  0.000227833 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  31.94 
 
 		 1091 aa  66.2  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5759  polygalacturonase  25 
 
 		 416 aa  65.1  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  38.58 
 
 		 1207 aa  65.1  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3334  galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  23.53 
 
 		 478 aa  64.3  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4088  glycoside hydrolase family protein  24.16 
 
 		 522 aa  63.9  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.59776  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1884  glycoside hydrolase family protein  35.11 
 
 		 606 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1569  glycoside hydrolase family 28  24.03 
 
 		 443 aa  63.5  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0124  Endopygalactorunase-like protein  24.36 
 
 		 641 aa  63.5  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.778802  normal  0.020189 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1396  Endopygalactorunase-like protein  25.74 
 
 		 642 aa  61.2  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4535  carbohydrate-binding family 6 protein  34.96 
 
 		 898 aa  60.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.334196  normal  0.875686 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2137  cellulosome enzyme, dockerin type I  34.51 
 
 		 790 aa  59.3  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0700  glycoside hydrolase family 28  22.97 
 
 		 509 aa  59.7  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1253  glycoside hydrolase family 28  23.24 
 
 		 544 aa  58.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.80507  normal  0.501453 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2125  glycoside hydrolase family 28  26.4 
 
 		 437 aa  58.9  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3331  carbohydrate-binding family 6 protein  33.07 
 
 		 747 aa  58.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  35.66 
 
 		 1128 aa  58.2  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1922  Endopygalactorunase-like protein  30.88 
 
 		 669 aa  57.8  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.449199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46668  predicted protein  22.48 
 
 		 451 aa  57  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000812304  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7020  hypothetical protein  26.58 
 
 		 449 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361507  normal  0.742896 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0432  hypothetical protein  39.18 
 
 		 495 aa  55.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.435778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5079  Parallel beta-helix repeat protein  21.67 
 
 		 454 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416725  normal  0.142328 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0153  glycoside hydrolase family 28  25.26 
 
 		 604 aa  55.5  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.90665  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4247  glycoside hydrolase family protein  21.33 
 
 		 448 aa  54.7  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.783037  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5359  putative polygalacturonase protein  22.65 
 
 		 454 aa  54.7  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071082  normal  0.281824 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29200  endopolygalacturonase  23.36 
 
 		 431 aa  54.3  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0230  glycoside hydrolase family protein  32.48 
 
 		 462 aa  53.9  0.000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4784  glycoside hydrolase family 28  32.2 
 
 		 551 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.821545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0125  Endopygalactorunase-like protein  26.18 
 
 		 633 aa  52.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300956  normal  0.0208856 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4285  glycoside hydrolase family protein  22.46 
 
 		 543 aa  52.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  30.67 
 
 		 1403 aa  52.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51200  Secreted mannuronan C-5 epimerase  29.6 
 
 		 553 aa  53.1  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227069  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0200  glycoside hydrolase family 28  35.42 
 
 		 605 aa  52.8  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1158  glycoside hydrolase family 28  28.81 
 
 		 554 aa  52.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0127  PKD domain containing protein  25 
 
 		 931 aa  52.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00188311 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4256  glycoside hydrolase family protein  26.96 
 
 		 475 aa  52  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3656  hypothetical protein  26.37 
 
 		 708 aa  52  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16052  predicted protein  26.81 
 
 		 271 aa  51.2  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.032394  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3862  hypothetical protein  44.07 
 
 		 582 aa  50.8  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00590592  normal  0.508788 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0152  glycoside hydrolase family 28  35.43 
 
 		 602 aa  50.4  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1580  Endopygalactorunase  29.38 
 
 		 246 aa  50.8  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0687608 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0953  glycoside hydrolase family protein  31.3 
 
 		 463 aa  50.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.161663  hitchhiker  0.000000205432 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  35.78 
 
 		 815 aa  50.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5374  glycoside hydrolase family 28  22.42 
 
 		 442 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.558216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  30.94 
 
 		 1839 aa  50.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  28.02 
 
 		 1610 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0498  glycoside hydrolase family protein  19.19 
 
 		 446 aa  49.7  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.446578  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  20.97 
 
 		 865 aa  48.5  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3321  glycoside hydrolase family 28  23.05 
 
 		 402 aa  48.1  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3618  hypothetical protein  46.51 
 
 		 547 aa  47.8  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.216975 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>