174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4270 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  100 
 
 		 865 aa  1793    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2391  glycoside hydrolase family 28  56.58 
 
 		 470 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880928  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0953  glycoside hydrolase family protein  49.35 
 
 		 463 aa  462  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.161663  hitchhiker  0.000000205432 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4256  glycoside hydrolase family protein  41.51 
 
 		 475 aa  392  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4251  glycosy hydrolase family protein  46.91 
 
 		 401 aa  370  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166912  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2841  glycosyl hydrolase family 88  46.97 
 
 		 612 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.137267  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2470  glycosyl hydrolase family 88  49.74 
 
 		 393 aa  372  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0483  glycoside hydrolase family protein  41.63 
 
 		 446 aa  365  2e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1024  glycosyl hydrolase family 88  46.77 
 
 		 644 aa  364  3e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0498  glycoside hydrolase family protein  41.63 
 
 		 446 aa  364  3e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.446578  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4250  glycosy hydrolase family protein  45.11 
 
 		 397 aa  358  1.9999999999999998e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.478117  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2381  glycosyl hydrolase family 88  45.36 
 
 		 373 aa  343  9e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5505  glycosyl hydrolase family 88  45.55 
 
 		 629 aa  340  5.9999999999999996e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0777464  hitchhiker  0.00601524 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0951  DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit  43.6 
 
 		 827 aa  322  9.999999999999999e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607652  hitchhiker  0.00000495983 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4285  glycoside hydrolase family protein  41.78 
 
 		 543 aa  318  2e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2741  glycosyl hydrolase family 88  43.84 
 
 		 639 aa  307  7e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.578666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4247  glycoside hydrolase family protein  39.39 
 
 		 448 aa  292  2e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.783037  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2300  glycoside hydrolase family 28  43.49 
 
 		 455 aa  291  5.0000000000000004e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4252  glycosy hydrolase family protein  34.66 
 
 		 399 aa  285  2.0000000000000002e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239169  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1158  glycoside hydrolase family 28  38.77 
 
 		 554 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1253  glycoside hydrolase family 28  38.97 
 
 		 544 aa  281  4e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.80507  normal  0.501453 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0610  glycoside hydrolase family 28  38.73 
 
 		 528 aa  278  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4784  glycoside hydrolase family 28  36.14 
 
 		 551 aa  272  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.821545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4088  glycoside hydrolase family protein  38.1 
 
 		 522 aa  268  4e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.59776  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2818  glycoside hydrolase family 28  35.46 
 
 		 542 aa  267  7e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0696  glycosyl hydrolase family 88  39.43 
 
 		 362 aa  260  6e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2540  glycosyl hydrolase family 88  36.63 
 
 		 402 aa  250  6e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4115  glycoside hydrolase family protein  32.98 
 
 		 560 aa  249  1e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0203  glycosy hydrolase family protein  36.54 
 
 		 375 aa  249  1e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000431819  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2380  Galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  35.93 
 
 		 447 aa  249  1e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2567  glycoside hydrolase family protein  35.48 
 
 		 474 aa  248  2e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5506  lipolytic protein G-D-S-L family  31.29 
 
 		 727 aa  246  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00398864  hitchhiker  0.00322716 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4790  glycoside hydrolase family 28  35.37 
 
 		 541 aa  237  7e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0680897  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0230  glycoside hydrolase family protein  32.65 
 
 		 462 aa  236  1.0000000000000001e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4858  glycoside hydrolase family 28  30.98 
 
 		 671 aa  233  9e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0653045  normal  0.492882 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5903  glycoside hydrolase family 28  32.79 
 
 		 521 aa  226  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.672596 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5453  glycoside hydrolase family protein  31.76 
 
 		 664 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.34591 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4904  glycoside hydrolase family protein  31.76 
 
 		 665 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4603  glycoside hydrolase family protein  30.08 
 
 		 665 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.039982  hitchhiker  0.000685896 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3221  glycoside hydrolase family protein  31.57 
 
 		 665 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.301284  normal  0.0580699 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09383  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  35.54 
 
 		 378 aa  219  2e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.318478 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29200  endopolygalacturonase  35.28 
 
 		 431 aa  214  3.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0833  polygalacturonase transmembrane protein  32.4 
 
 		 680 aa  210  8e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00798361 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07828  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  33.84 
 
 		 383 aa  205  3e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.091215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2532  glycoside hydrolase family 28  38.89 
 
 		 459 aa  200  1.0000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5981  di-transpoly-cis-decaprenylcistransferase  34.33 
 
 		 371 aa  199  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2736  glycoside hydrolase family protein  29.98 
 
 		 518 aa  194  6e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.835022  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0700  glycoside hydrolase family 28  30.88 
 
 		 509 aa  191  7e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5387  glycosyl hydrolase family 88  32.17 
 
 		 391 aa  187  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0230208 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2808  hypothetical protein  32.02 
 
 		 402 aa  177  5e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000299929 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3334  galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  30.23 
 
 		 478 aa  168  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2457  glycoside hydrolase family 28  28.76 
 
 		 508 aa  154  7e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140372  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2115  glycoside hydrolase family protein  29.86 
 
 		 460 aa  152  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1092  glycoside hydrolase family 28  29.38 
 
 		 460 aa  149  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10505  cell wall glycosyl hydrolase YteR, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14630)  31.8 
 
 		 367 aa  148  4.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.841717 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3030  glycoside hydrolase family 28  32.53 
 
 		 467 aa  148  5e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3223  glycoside hydrolase family 28  29.38 
 
 		 460 aa  148  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.362624  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6953  glycoside hydrolase family 28  28.47 
 
 		 390 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1579  glycoside hydrolase family 28  29.18 
 
 		 492 aa  143  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0814382 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1569  glycoside hydrolase family 28  30.96 
 
 		 443 aa  143  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2125  glycoside hydrolase family 28  30.29 
 
 		 437 aa  138  4e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0449  glycosyl hydrolase family 88  27.22 
 
 		 410 aa  137  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3217  glycoside hydrolase family protein  27.94 
 
 		 491 aa  134  9e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1710  glycoside hydrolase family 28  25.94 
 
 		 518 aa  132  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190203  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3977  glycoside hydrolase family 28  26.35 
 
 		 543 aa  131  5.0000000000000004e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.722531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5374  glycoside hydrolase family 28  27.44 
 
 		 442 aa  126  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.558216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3113  glycoside hydrolase family 28  27.27 
 
 		 524 aa  125  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00001805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46668  predicted protein  25.44 
 
 		 451 aa  124  5e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000812304  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3108  glycosyl hydrolase family 88  28.85 
 
 		 574 aa  124  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285148  normal  0.618959 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4228  glycoside hydrolase family protein  28.09 
 
 		 442 aa  124  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0200  glycoside hydrolase family 28  27.34 
 
 		 605 aa  123  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5079  Parallel beta-helix repeat protein  29.58 
 
 		 454 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416725  normal  0.142328 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1884  glycoside hydrolase family protein  28.05 
 
 		 606 aa  122  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5359  putative polygalacturonase protein  30.52 
 
 		 454 aa  120  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071082  normal  0.281824 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0456  glycosyl hydrolase family 88  29.92 
 
 		 462 aa  118  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1344  glycosy hydrolase family protein  31.92 
 
 		 473 aa  117  6.9999999999999995e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1529  glycoside hydrolase family 28  26.89 
 
 		 442 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.604094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0153  glycoside hydrolase family 28  29.31 
 
 		 604 aa  115  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.90665  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0152  glycoside hydrolase family 28  28 
 
 		 602 aa  115  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2882  glycosyl hydrolase family 88  24.31 
 
 		 392 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0717  glycoside hydrolase family 28  26.98 
 
 		 559 aa  110  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5759  polygalacturonase  29.89 
 
 		 416 aa  109  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4685  glycosyl hydrolase family 88  28.16 
 
 		 349 aa  105  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.558962  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1410  Fibronectin type III domain protein  26.62 
 
 		 659 aa  101  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3115  glycoside hydrolase family protein  24.75 
 
 		 509 aa  100  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2888  glycoside hydrolase family 28  25.97 
 
 		 530 aa  98.2  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.022046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7020  hypothetical protein  25.18 
 
 		 449 aa  97.4  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361507  normal  0.742896 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0972  glycoside hydrolase family 28  24.91 
 
 		 448 aa  97.4  9e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2862  Fibronectin type III domain protein  25.65 
 
 		 659 aa  96.3  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2071  glycosyl hydrolase, family 88  27.01 
 
 		 379 aa  93.6  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000233336 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3321  glycoside hydrolase family 28  29.78 
 
 		 402 aa  93.2  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1360  glycosy hydrolase family protein  27.86 
 
 		 753 aa  92.4  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576113  normal  0.691294 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2126  glycosyl hydrolase, family 88  26.69 
 
 		 379 aa  92.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000763601 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0824  glycoside hydrolase family 28  23.85 
 
 		 444 aa  92  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1211  glycosyl hydrolase, family 88  26.69 
 
 		 379 aa  92  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2066  glycosyl hydrolase, family 88  26.69 
 
 		 379 aa  91.7  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  0.0470712 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0989  glycoside hydrolase family 28  28.93 
 
 		 402 aa  90.9  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1170  glycoside hydrolase family protein  27.71 
 
 		 548 aa  90.5  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1335  glycosyl hydrolase, family 88  26.69 
 
 		 379 aa  90.1  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103644 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0846  hypothetical protein  28.23 
 
 		 374 aa  89.7  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>