63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6877 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6877  hypothetical protein  100 
 
 
543 aa  1103    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0249011  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1569  glycoside hydrolase family 28  24.68 
 
 
443 aa  102  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3217  glycoside hydrolase family protein  30.39 
 
 
491 aa  100  8e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1581  glycoside hydrolase family 28  28.52 
 
 
489 aa  90.9  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0871574 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4790  glycoside hydrolase family 28  26.15 
 
 
541 aa  90.1  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0680897  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0972  glycoside hydrolase family 28  23.7 
 
 
448 aa  90.1  9e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2380  Galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  25.62 
 
 
447 aa  90.1  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1710  glycoside hydrolase family 28  28.9 
 
 
518 aa  87.8  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190203  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2888  glycoside hydrolase family 28  27.68 
 
 
530 aa  85.9  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.022046  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1579  glycoside hydrolase family 28  27.52 
 
 
492 aa  84  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0814382 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0172  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.35 
 
 
685 aa  83.6  0.000000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.238557  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0717  glycoside hydrolase family 28  33.8 
 
 
559 aa  83.6  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0824  glycoside hydrolase family 28  24.4 
 
 
444 aa  82.8  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2115  glycoside hydrolase family protein  27.39 
 
 
460 aa  83.2  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3977  glycoside hydrolase family 28  26.32 
 
 
543 aa  82.4  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.722531  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2818  glycoside hydrolase family 28  25.44 
 
 
542 aa  82  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5759  polygalacturonase  26.22 
 
 
416 aa  81.6  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3115  glycoside hydrolase family protein  25.39 
 
 
509 aa  81.3  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6953  glycoside hydrolase family 28  25.4 
 
 
390 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  28.53 
 
 
649 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1253  glycoside hydrolase family 28  24.92 
 
 
544 aa  79.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.80507  normal  0.501453 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3030  glycoside hydrolase family 28  25.14 
 
 
467 aa  78.2  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0610  glycoside hydrolase family 28  23.36 
 
 
528 aa  77.8  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826253  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5359  putative polygalacturonase protein  25.65 
 
 
454 aa  77.4  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071082  normal  0.281824 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1529  glycoside hydrolase family 28  25.12 
 
 
442 aa  75.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.604094  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1092  glycoside hydrolase family 28  24.34 
 
 
460 aa  75.9  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5506  lipolytic protein G-D-S-L family  22.15 
 
 
727 aa  74.3  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00398864  hitchhiker  0.00322716 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3223  glycoside hydrolase family 28  24.34 
 
 
460 aa  73.6  0.000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.362624  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29200  endopolygalacturonase  27.86 
 
 
431 aa  73.6  0.000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1158  glycoside hydrolase family 28  25.19 
 
 
554 aa  73.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5903  glycoside hydrolase family 28  25.42 
 
 
521 aa  72  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.672596 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5374  glycoside hydrolase family 28  28.18 
 
 
442 aa  71.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.558216  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16052  predicted protein  25.56 
 
 
271 aa  71.6  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.032394  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5079  Parallel beta-helix repeat protein  27.11 
 
 
454 aa  70.9  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416725  normal  0.142328 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4784  glycoside hydrolase family 28  24.56 
 
 
551 aa  70.5  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.821545  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4088  glycoside hydrolase family protein  21.03 
 
 
522 aa  70.5  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.59776  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3113  glycoside hydrolase family 28  27.24 
 
 
524 aa  67.8  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00001805  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4228  glycoside hydrolase family protein  21.46 
 
 
442 aa  67.4  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3371  glycoside hydrolase family 28  25.44 
 
 
444 aa  66.2  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2125  glycoside hydrolase family 28  29.6 
 
 
437 aa  64.7  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  23.36 
 
 
865 aa  63.2  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2300  glycoside hydrolase family 28  23.34 
 
 
455 aa  60.5  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4115  glycoside hydrolase family protein  21.97 
 
 
560 aa  58.9  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4285  glycoside hydrolase family protein  21.1 
 
 
543 aa  58.9  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3114  glycoside hydrolase family protein  22.91 
 
 
479 aa  57.4  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1884  glycoside hydrolase family protein  26.28 
 
 
606 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185674  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0953  glycoside hydrolase family protein  23.02 
 
 
463 aa  57  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.161663  hitchhiker  0.000000205432 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0152  glycoside hydrolase family 28  39.34 
 
 
602 aa  55.1  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3310  hypothetical protein  21.34 
 
 
518 aa  52  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2532  glycoside hydrolase family 28  24.08 
 
 
459 aa  51.2  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0153  glycoside hydrolase family 28  37.5 
 
 
604 aa  50.8  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.90665  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2391  glycoside hydrolase family 28  20.71 
 
 
470 aa  50.8  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880928  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2736  glycoside hydrolase family protein  20.89 
 
 
518 aa  50.8  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.835022  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0230  glycoside hydrolase family protein  25.65 
 
 
462 aa  50.1  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0200  glycoside hydrolase family 28  33.61 
 
 
605 aa  47.4  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4247  glycoside hydrolase family protein  21.16 
 
 
448 aa  46.6  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.783037  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3719  exo-poly-alpha-D-galacturonosidase precursor  35.14 
 
 
537 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3334  galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  21.85 
 
 
478 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3960  polygalacturonase  23.02 
 
 
532 aa  45.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0761528  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1756  exo-poly-galacturonase signal peptide protein  42.86 
 
 
702 aa  44.7  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0518728  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2457  glycoside hydrolase family 28  22.59 
 
 
508 aa  43.9  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140372  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0498  glycoside hydrolase family protein  20.91 
 
 
446 aa  43.5  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.446578  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1580  Endopygalactorunase  39.53 
 
 
246 aa  43.5  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0687608 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>