81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3719 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3719  exo-poly-alpha-D-galacturonosidase precursor  100 
 
 		 537 aa  1095    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1170  glycoside hydrolase family protein  54.75 
 
 		 548 aa  480  1e-134  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3977  glycoside hydrolase family 28  29.05 
 
 		 543 aa  194  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.722531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3113  glycoside hydrolase family 28  30.81 
 
 		 524 aa  191  4e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00001805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  29.7 
 
 		 649 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1579  glycoside hydrolase family 28  29.41 
 
 		 492 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0814382 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3115  glycoside hydrolase family protein  29.8 
 
 		 509 aa  183  8.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1710  glycoside hydrolase family 28  30.45 
 
 		 518 aa  163  9e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190203  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2888  glycoside hydrolase family 28  27.76 
 
 		 530 aa  155  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.022046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1581  glycoside hydrolase family 28  26.74 
 
 		 489 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0871574 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2818  glycoside hydrolase family 28  26.58 
 
 		 542 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3754  Endopygalactorunase  24.96 
 
 		 983 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0717  glycoside hydrolase family 28  27.34 
 
 		 559 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2380  Galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  27.6 
 
 		 447 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4088  glycoside hydrolase family protein  27.06 
 
 		 522 aa  119  9e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.59776  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3217  glycoside hydrolase family protein  25.86 
 
 		 491 aa  118  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4784  glycoside hydrolase family 28  28.12 
 
 		 551 aa  117  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.821545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3371  glycoside hydrolase family 28  24.42 
 
 		 444 aa  114  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0972  glycoside hydrolase family 28  24.53 
 
 		 448 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1253  glycoside hydrolase family 28  26.51 
 
 		 544 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.80507  normal  0.501453 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29200  endopolygalacturonase  28.14 
 
 		 431 aa  106  9e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1158  glycoside hydrolase family 28  26.1 
 
 		 554 aa  106  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1569  glycoside hydrolase family 28  25.4 
 
 		 443 aa  106  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4256  glycoside hydrolase family protein  25.11 
 
 		 475 aa  105  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4790  glycoside hydrolase family 28  25 
 
 		 541 aa  104  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0680897  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4115  glycoside hydrolase family protein  25.21 
 
 		 560 aa  100  8e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3114  glycoside hydrolase family protein  23.49 
 
 		 479 aa  99.8  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4285  glycoside hydrolase family protein  27.97 
 
 		 543 aa  97.8  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0824  glycoside hydrolase family 28  21.59 
 
 		 444 aa  91.7  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2567  glycoside hydrolase family protein  25.05 
 
 		 474 aa  90.9  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2532  glycoside hydrolase family 28  24.74 
 
 		 459 aa  90.5  7e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0953  glycoside hydrolase family protein  25.83 
 
 		 463 aa  89.4  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.161663  hitchhiker  0.000000205432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2300  glycoside hydrolase family 28  24.38 
 
 		 455 aa  86.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3334  galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  26.24 
 
 		 478 aa  82  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0230  glycoside hydrolase family protein  24.05 
 
 		 462 aa  81.3  0.00000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2391  glycoside hydrolase family 28  26.33 
 
 		 470 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880928  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  25.23 
 
 		 865 aa  76.3  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6953  glycoside hydrolase family 28  23.5 
 
 		 390 aa  75.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0610  glycoside hydrolase family 28  23.67 
 
 		 528 aa  73.9  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0700  glycoside hydrolase family 28  24.07 
 
 		 509 aa  72.4  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4247  glycoside hydrolase family protein  22.17 
 
 		 448 aa  72  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.783037  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2125  glycoside hydrolase family 28  30.2 
 
 		 437 aa  70.5  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5359  putative polygalacturonase protein  24.71 
 
 		 454 aa  70.1  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071082  normal  0.281824 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2736  glycoside hydrolase family protein  24.32 
 
 		 518 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.835022  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1884  glycoside hydrolase family protein  24.06 
 
 		 606 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5506  lipolytic protein G-D-S-L family  23.81 
 
 		 727 aa  68.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00398864  hitchhiker  0.00322716 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5079  Parallel beta-helix repeat protein  25.58 
 
 		 454 aa  68.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416725  normal  0.142328 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5903  glycoside hydrolase family 28  25.98 
 
 		 521 aa  68.2  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.672596 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2115  glycoside hydrolase family protein  24.33 
 
 		 460 aa  67.8  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0483  glycoside hydrolase family protein  22.99 
 
 		 446 aa  66.2  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0498  glycoside hydrolase family protein  22.99 
 
 		 446 aa  66.2  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.446578  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1580  Endopygalactorunase  36.52 
 
 		 246 aa  65.5  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0687608 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2457  glycoside hydrolase family 28  25 
 
 		 508 aa  63.9  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140372  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0153  glycoside hydrolase family 28  26.63 
 
 		 604 aa  63.2  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.90665  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5759  polygalacturonase  22.51 
 
 		 416 aa  63.2  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3223  glycoside hydrolase family 28  24.66 
 
 		 460 aa  62  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.362624  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0200  glycoside hydrolase family 28  27.02 
 
 		 605 aa  62.4  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1092  glycoside hydrolase family 28  24.66 
 
 		 460 aa  60.8  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2862  Fibronectin type III domain protein  21.92 
 
 		 659 aa  58.9  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5374  glycoside hydrolase family 28  24.66 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.558216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0124  Endopygalactorunase-like protein  37.5 
 
 		 641 aa  57.4  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.778802  normal  0.020189 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3030  glycoside hydrolase family 28  35.54 
 
 		 467 aa  57.4  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4228  glycoside hydrolase family protein  25.47 
 
 		 442 aa  57  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0152  glycoside hydrolase family 28  25.37 
 
 		 602 aa  55.1  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1396  Endopygalactorunase-like protein  36.44 
 
 		 642 aa  55.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46668  predicted protein  23.03 
 
 		 451 aa  53.9  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000812304  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1410  Fibronectin type III domain protein  22.12 
 
 		 659 aa  53.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3618  hypothetical protein  59.52 
 
 		 547 aa  49.3  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.216975 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0125  Endopygalactorunase-like protein  32.39 
 
 		 633 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300956  normal  0.0208856 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1756  exo-poly-galacturonase signal peptide protein  24.59 
 
 		 702 aa  48.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0518728  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4755  hypothetical protein  40.58 
 
 		 496 aa  47.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0667593 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0640  cellulosome enzyme, dockerin type I  44.12 
 
 		 582 aa  47.4  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00550  conserved hypothetical protein  46.67 
 
 		 1380 aa  46.6  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.487463 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08480  conserved hypothetical protein  46.67 
 
 		 1380 aa  47  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.1497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6877  hypothetical protein  35.14 
 
 		 543 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0249011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0127  PKD domain containing protein  34.78 
 
 		 931 aa  46.2  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00188311 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00779  exo-beta-1,3-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11980)  50.98 
 
 		 781 aa  45.8  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.913287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16052  predicted protein  27.42 
 
 		 271 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.032394  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1529  glycoside hydrolase family 28  23.77 
 
 		 442 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.604094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1922  Endopygalactorunase-like protein  33.62 
 
 		 669 aa  44.7  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.449199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1183  hypothetical protein  48.08 
 
 		 632 aa  43.9  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>