86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0200 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0153  glycoside hydrolase family 28  66.39 
 
 		 604 aa  825    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.90665  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0152  glycoside hydrolase family 28  72.82 
 
 		 602 aa  911    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0200  glycoside hydrolase family 28  100 
 
 		 605 aa  1249    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1884  glycoside hydrolase family protein  52.69 
 
 		 606 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1410  Fibronectin type III domain protein  46.78 
 
 		 659 aa  528  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2862  Fibronectin type III domain protein  46.03 
 
 		 659 aa  528  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1756  exo-poly-galacturonase signal peptide protein  41.29 
 
 		 702 aa  427  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0518728  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1158  glycoside hydrolase family 28  28.51 
 
 		 554 aa  152  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2567  glycoside hydrolase family protein  28.08 
 
 		 474 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4256  glycoside hydrolase family protein  27.88 
 
 		 475 aa  139  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4784  glycoside hydrolase family 28  27.73 
 
 		 551 aa  135  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.821545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0953  glycoside hydrolase family protein  28.72 
 
 		 463 aa  132  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.161663  hitchhiker  0.000000205432 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2380  Galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  28.74 
 
 		 447 aa  131  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4088  glycoside hydrolase family protein  29 
 
 		 522 aa  130  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.59776  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2818  glycoside hydrolase family 28  29.29 
 
 		 542 aa  126  9e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4790  glycoside hydrolase family 28  25.76 
 
 		 541 aa  124  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0680897  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  27.14 
 
 		 865 aa  123  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2736  glycoside hydrolase family protein  26.85 
 
 		 518 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.835022  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1253  glycoside hydrolase family 28  25.79 
 
 		 544 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.80507  normal  0.501453 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4115  glycoside hydrolase family protein  26.14 
 
 		 560 aa  121  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0610  glycoside hydrolase family 28  27.98 
 
 		 528 aa  120  9e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5506  lipolytic protein G-D-S-L family  27.23 
 
 		 727 aa  117  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00398864  hitchhiker  0.00322716 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2391  glycoside hydrolase family 28  24.81 
 
 		 470 aa  114  6e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880928  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0700  glycoside hydrolase family 28  26.76 
 
 		 509 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4247  glycoside hydrolase family protein  25.68 
 
 		 448 aa  110  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.783037  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2457  glycoside hydrolase family 28  28.78 
 
 		 508 aa  109  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140372  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2115  glycoside hydrolase family protein  28.82 
 
 		 460 aa  109  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1092  glycoside hydrolase family 28  26.92 
 
 		 460 aa  107  9e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3030  glycoside hydrolase family 28  29.34 
 
 		 467 aa  105  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5903  glycoside hydrolase family 28  26.52 
 
 		 521 aa  105  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.672596 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3223  glycoside hydrolase family 28  28.2 
 
 		 460 aa  105  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.362624  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0498  glycoside hydrolase family protein  23.64 
 
 		 446 aa  103  8e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.446578  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0483  glycoside hydrolase family protein  23.64 
 
 		 446 aa  103  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3334  galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  26.14 
 
 		 478 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4285  glycoside hydrolase family protein  24.94 
 
 		 543 aa  98.2  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29200  endopolygalacturonase  26.3 
 
 		 431 aa  96.3  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0230  glycoside hydrolase family protein  24.93 
 
 		 462 aa  94.4  6e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2125  glycoside hydrolase family 28  27.27 
 
 		 437 aa  93.6  9e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0717  glycoside hydrolase family 28  31.3 
 
 		 559 aa  92.8  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1579  glycoside hydrolase family 28  24.95 
 
 		 492 aa  92  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0814382 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3115  glycoside hydrolase family protein  28.52 
 
 		 509 aa  90.1  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3113  glycoside hydrolase family 28  30.16 
 
 		 524 aa  87.8  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00001805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3977  glycoside hydrolase family 28  26.76 
 
 		 543 aa  86.3  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.722531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6953  glycoside hydrolase family 28  28.2 
 
 		 390 aa  83.2  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1569  glycoside hydrolase family 28  24.48 
 
 		 443 aa  80.9  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3960  polygalacturonase  25.91 
 
 		 532 aa  80.9  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0761528  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2532  glycoside hydrolase family 28  30.36 
 
 		 459 aa  80.5  0.00000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3114  glycoside hydrolase family protein  25.31 
 
 		 479 aa  78.2  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0989  glycoside hydrolase family 28  29.19 
 
 		 402 aa  78.2  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3321  glycoside hydrolase family 28  29.19 
 
 		 402 aa  76.6  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2888  glycoside hydrolase family 28  26.05 
 
 		 530 aa  76.3  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.022046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1710  glycoside hydrolase family 28  28.9 
 
 		 518 aa  73.9  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190203  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5374  glycoside hydrolase family 28  24.82 
 
 		 442 aa  73.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.558216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2300  glycoside hydrolase family 28  25.53 
 
 		 455 aa  73.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1581  glycoside hydrolase family 28  26.19 
 
 		 489 aa  71.6  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0871574 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4904  glycoside hydrolase family protein  22.72 
 
 		 665 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4603  glycoside hydrolase family protein  25.96 
 
 		 665 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.039982  hitchhiker  0.000685896 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3221  glycoside hydrolase family protein  24.29 
 
 		 665 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.301284  normal  0.0580699 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3217  glycoside hydrolase family protein  25.47 
 
 		 491 aa  68.9  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4228  glycoside hydrolase family protein  39.67 
 
 		 442 aa  67  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4858  glycoside hydrolase family 28  25.29 
 
 		 671 aa  67  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0653045  normal  0.492882 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7020  hypothetical protein  26.58 
 
 		 449 aa  65.5  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361507  normal  0.742896 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1489  Polygalacturonase/Pectinase  26.05 
 
 		 544 aa  64.3  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5453  glycoside hydrolase family protein  23.1 
 
 		 664 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.34591 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1529  glycoside hydrolase family 28  23.91 
 
 		 442 aa  63.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.604094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3719  exo-poly-alpha-D-galacturonosidase precursor  27.02 
 
 		 537 aa  62.4  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1570  glycoside hydrolase family protein  23.58 
 
 		 544 aa  59.7  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3629  glycoside hydrolase family 28  26.18 
 
 		 488 aa  60.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0972  glycoside hydrolase family 28  22.04 
 
 		 448 aa  58.9  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1580  Endopygalactorunase  38.79 
 
 		 246 aa  59.3  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0687608 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3630  glycoside hydrolase family 28  26.11 
 
 		 513 aa  58.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.370863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1170  glycoside hydrolase family protein  23.02 
 
 		 548 aa  58.2  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00376  polygalacturonase  25.3 
 
 		 602 aa  57  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1628  polygalacturonase precursor  23.14 
 
 		 544 aa  55.5  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0880  polygalacturonase precursor (pectinase) signal peptide protein  30.92 
 
 		 531 aa  55.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.609321  normal  0.0402395 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0833  polygalacturonase transmembrane protein  27.53 
 
 		 680 aa  53.5  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00798361 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  35.16 
 
 		 649 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3371  glycoside hydrolase family 28  22.45 
 
 		 444 aa  50.8  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6029  glycoside hydrolase family protein  23.85 
 
 		 725 aa  50.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0491802  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5664  glycoside hydrolase family protein  23.85 
 
 		 725 aa  50.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6877  hypothetical protein  33.61 
 
 		 543 aa  47.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0249011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3754  Endopygalactorunase  28.09 
 
 		 983 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46668  predicted protein  18.72 
 
 		 451 aa  46.6  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000812304  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  28.46 
 
 		 459 aa  45.8  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5982  glycoside hydrolase family protein  23.38 
 
 		 716 aa  44.3  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.113133 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1396  Endopygalactorunase-like protein  42.17 
 
 		 642 aa  43.9  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230855  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>