75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1570 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1570  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
544 aa  1112    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1628  polygalacturonase precursor  97.79 
 
 
544 aa  1051    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3960  polygalacturonase  56.06 
 
 
532 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0761528  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0880  polygalacturonase precursor (pectinase) signal peptide protein  57.06 
 
 
531 aa  541  9.999999999999999e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.609321  normal  0.0402395 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00376  polygalacturonase  54.26 
 
 
602 aa  525  1e-148  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1489  Polygalacturonase/Pectinase  52.24 
 
 
544 aa  513  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7020  hypothetical protein  37.59 
 
 
449 aa  265  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361507  normal  0.742896 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0989  glycoside hydrolase family 28  40.16 
 
 
402 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3321  glycoside hydrolase family 28  41.95 
 
 
402 aa  253  7e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5982  glycoside hydrolase family protein  30.14 
 
 
716 aa  208  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.113133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3630  glycoside hydrolase family 28  31.29 
 
 
513 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.370863  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3629  glycoside hydrolase family 28  33.57 
 
 
488 aa  200  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6029  glycoside hydrolase family protein  30.2 
 
 
725 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0491802  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5664  glycoside hydrolase family protein  30.2 
 
 
725 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2115  glycoside hydrolase family protein  28.45 
 
 
460 aa  130  5.0000000000000004e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3223  glycoside hydrolase family 28  27.86 
 
 
460 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.362624  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1092  glycoside hydrolase family 28  27.86 
 
 
460 aa  120  9e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3030  glycoside hydrolase family 28  28.15 
 
 
467 aa  115  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6953  glycoside hydrolase family 28  27.69 
 
 
390 aa  110  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2380  Galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  27.27 
 
 
447 aa  105  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3334  galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  25.51 
 
 
478 aa  95.5  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2818  glycoside hydrolase family 28  24.89 
 
 
542 aa  95.9  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2125  glycoside hydrolase family 28  26.82 
 
 
437 aa  93.6  9e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4256  glycoside hydrolase family protein  24.87 
 
 
475 aa  87.8  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4247  glycoside hydrolase family protein  26.17 
 
 
448 aa  87.4  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.783037  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29200  endopolygalacturonase  26.98 
 
 
431 aa  87  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4790  glycoside hydrolase family 28  24.45 
 
 
541 aa  85.5  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0680897  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  26.12 
 
 
865 aa  84  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0700  glycoside hydrolase family 28  25 
 
 
509 aa  81.3  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4088  glycoside hydrolase family protein  23.21 
 
 
522 aa  79.7  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.59776  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2736  glycoside hydrolase family protein  25.68 
 
 
518 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.835022  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2391  glycoside hydrolase family 28  23.54 
 
 
470 aa  75.1  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880928  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4784  glycoside hydrolase family 28  24.14 
 
 
551 aa  73.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.821545  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2457  glycoside hydrolase family 28  24.35 
 
 
508 aa  72.8  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140372  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1410  Fibronectin type III domain protein  25.44 
 
 
659 aa  69.7  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0953  glycoside hydrolase family protein  23.25 
 
 
463 aa  70.1  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.161663  hitchhiker  0.000000205432 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1884  glycoside hydrolase family protein  26.34 
 
 
606 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185674  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0153  glycoside hydrolase family 28  24.04 
 
 
604 aa  68.6  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.90665  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0200  glycoside hydrolase family 28  23.89 
 
 
605 aa  67.8  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0152  glycoside hydrolase family 28  23.09 
 
 
602 aa  67.8  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4115  glycoside hydrolase family protein  24.5 
 
 
560 aa  67.8  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0230  glycoside hydrolase family protein  22.84 
 
 
462 aa  67.4  0.0000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1158  glycoside hydrolase family 28  23.15 
 
 
554 aa  66.2  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2862  Fibronectin type III domain protein  24.81 
 
 
659 aa  64.7  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2567  glycoside hydrolase family protein  21.26 
 
 
474 aa  64.3  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2300  glycoside hydrolase family 28  22.76 
 
 
455 aa  63.5  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2888  glycoside hydrolase family 28  24.85 
 
 
530 aa  62.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.022046  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0824  glycoside hydrolase family 28  22.69 
 
 
444 aa  60.8  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1756  exo-poly-galacturonase signal peptide protein  24.24 
 
 
702 aa  60.1  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0518728  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3114  glycoside hydrolase family protein  25.81 
 
 
479 aa  58.9  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1253  glycoside hydrolase family 28  24.53 
 
 
544 aa  58.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.80507  normal  0.501453 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0610  glycoside hydrolase family 28  22.25 
 
 
528 aa  57  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826253  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03389  xylogalacturonan hydrolase (Eurofung)  26.3 
 
 
399 aa  56.6  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.176918  normal  0.718699 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4285  glycoside hydrolase family protein  21.36 
 
 
543 aa  56.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6920  glycoside hydrolase family protein  23.66 
 
 
458 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5903  glycoside hydrolase family 28  23.72 
 
 
521 aa  56.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.672596 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2532  glycoside hydrolase family 28  23.99 
 
 
459 aa  55.5  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3115  glycoside hydrolase family protein  28.03 
 
 
509 aa  54.7  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4887  glycoside hydrolase family protein  23.41 
 
 
458 aa  54.7  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3277  glycoside hydrolase family protein  23.41 
 
 
458 aa  54.7  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.113275 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0498  glycoside hydrolase family protein  22.25 
 
 
446 aa  53.9  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.446578  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0483  glycoside hydrolase family protein  22.25 
 
 
446 aa  53.9  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4603  glycoside hydrolase family protein  24.02 
 
 
665 aa  51.6  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.039982  hitchhiker  0.000685896 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1579  glycoside hydrolase family 28  19.94 
 
 
492 aa  50.8  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0814382 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4858  glycoside hydrolase family 28  23.51 
 
 
671 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0653045  normal  0.492882 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08327  Endo-polygalacturonasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ATQ3]  31.53 
 
 
380 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.23769  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4904  glycoside hydrolase family protein  23.46 
 
 
665 aa  48.5  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1529  glycoside hydrolase family 28  24.07 
 
 
442 aa  48.5  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.604094  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46668  predicted protein  21.2 
 
 
451 aa  48.5  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000812304  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5453  glycoside hydrolase family protein  23.46 
 
 
664 aa  48.5  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.34591 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4228  glycoside hydrolase family protein  24.67 
 
 
442 aa  47.8  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3977  glycoside hydrolase family 28  34.26 
 
 
543 aa  47.4  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.722531  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1569  glycoside hydrolase family 28  23.08 
 
 
443 aa  47.4  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0717  glycoside hydrolase family 28  27.81 
 
 
559 aa  45.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3221  glycoside hydrolase family protein  22.91 
 
 
665 aa  43.9  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.301284  normal  0.0580699 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>