76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3221 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp0833  polygalacturonase transmembrane protein  70.95 
 
 		 680 aa  916    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00798361 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4603  glycoside hydrolase family protein  89.98 
 
 		 665 aa  1168    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.039982  hitchhiker  0.000685896 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3221  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 665 aa  1355    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.301284  normal  0.0580699 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4904  glycoside hydrolase family protein  89.88 
 
 		 665 aa  1141    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5453  glycoside hydrolase family protein  89.35 
 
 		 664 aa  1171    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.34591 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4858  glycoside hydrolase family 28  71.49 
 
 		 671 aa  972    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0653045  normal  0.492882 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2391  glycoside hydrolase family 28  36.59 
 
 		 470 aa  266  1e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880928  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4256  glycoside hydrolase family protein  36.29 
 
 		 475 aa  253  7e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0953  glycoside hydrolase family protein  38.01 
 
 		 463 aa  243  6e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.161663  hitchhiker  0.000000205432 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  31.53 
 
 		 865 aa  224  3e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0483  glycoside hydrolase family protein  35.29 
 
 		 446 aa  220  7.999999999999999e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0498  glycoside hydrolase family protein  32.8 
 
 		 446 aa  217  5.9999999999999996e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.446578  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4247  glycoside hydrolase family protein  30.11 
 
 		 448 aa  191  4e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.783037  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2300  glycoside hydrolase family 28  31.77 
 
 		 455 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4285  glycoside hydrolase family protein  27.25 
 
 		 543 aa  177  4e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4115  glycoside hydrolase family protein  30.17 
 
 		 560 aa  164  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1253  glycoside hydrolase family 28  29.89 
 
 		 544 aa  164  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.80507  normal  0.501453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2818  glycoside hydrolase family 28  30.38 
 
 		 542 aa  161  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5903  glycoside hydrolase family 28  28.25 
 
 		 521 aa  157  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.672596 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4784  glycoside hydrolase family 28  29.78 
 
 		 551 aa  157  6e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.821545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4088  glycoside hydrolase family protein  26.4 
 
 		 522 aa  156  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.59776  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1158  glycoside hydrolase family 28  26.56 
 
 		 554 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0610  glycoside hydrolase family 28  28.81 
 
 		 528 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2567  glycoside hydrolase family protein  27.79 
 
 		 474 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5506  lipolytic protein G-D-S-L family  27.99 
 
 		 727 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00398864  hitchhiker  0.00322716 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2532  glycoside hydrolase family 28  28.08 
 
 		 459 aa  120  7e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2380  Galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  25.93 
 
 		 447 aa  117  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4790  glycoside hydrolase family 28  26.48 
 
 		 541 aa  114  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0680897  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29200  endopolygalacturonase  32.93 
 
 		 431 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46668  predicted protein  37.02 
 
 		 451 aa  112  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000812304  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0230  glycoside hydrolase family protein  25.06 
 
 		 462 aa  107  7e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0700  glycoside hydrolase family 28  32.56 
 
 		 509 aa  97.8  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2457  glycoside hydrolase family 28  27.02 
 
 		 508 aa  97.4  7e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140372  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2736  glycoside hydrolase family protein  33.73 
 
 		 518 aa  93.6  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.835022  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6953  glycoside hydrolase family 28  30.24 
 
 		 390 aa  86.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3217  glycoside hydrolase family protein  28.48 
 
 		 491 aa  84  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3114  glycoside hydrolase family protein  34.59 
 
 		 479 aa  83.2  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5759  polygalacturonase  31.74 
 
 		 416 aa  78.2  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0972  glycoside hydrolase family 28  28.47 
 
 		 448 aa  77.8  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5359  putative polygalacturonase protein  30.37 
 
 		 454 aa  73.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071082  normal  0.281824 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5079  Parallel beta-helix repeat protein  31.11 
 
 		 454 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416725  normal  0.142328 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3113  glycoside hydrolase family 28  28.57 
 
 		 524 aa  71.6  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00001805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2888  glycoside hydrolase family 28  23.81 
 
 		 530 aa  70.5  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.022046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3371  glycoside hydrolase family 28  24.06 
 
 		 444 aa  70.5  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0824  glycoside hydrolase family 28  24.31 
 
 		 444 aa  68.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0200  glycoside hydrolase family 28  24.79 
 
 		 605 aa  69.3  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1579  glycoside hydrolase family 28  28.46 
 
 		 492 aa  67  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0814382 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3334  galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  26.04 
 
 		 478 aa  66.2  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1569  glycoside hydrolase family 28  24.06 
 
 		 443 aa  65.1  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5374  glycoside hydrolase family 28  30 
 
 		 442 aa  64.7  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.558216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7020  hypothetical protein  30.06 
 
 		 449 aa  64.7  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361507  normal  0.742896 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0153  glycoside hydrolase family 28  25.54 
 
 		 604 aa  63.9  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.90665  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3630  glycoside hydrolase family 28  30.59 
 
 		 513 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.370863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1529  glycoside hydrolase family 28  29.75 
 
 		 442 aa  62.4  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.604094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3977  glycoside hydrolase family 28  27.14 
 
 		 543 aa  62.4  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.722531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4228  glycoside hydrolase family protein  29.75 
 
 		 442 aa  62.4  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1489  Polygalacturonase/Pectinase  27.89 
 
 		 544 aa  60.5  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1710  glycoside hydrolase family 28  28.87 
 
 		 518 aa  59.3  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190203  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2125  glycoside hydrolase family 28  23.96 
 
 		 437 aa  59.3  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0880  polygalacturonase precursor (pectinase) signal peptide protein  31.62 
 
 		 531 aa  58.9  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.609321  normal  0.0402395 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3115  glycoside hydrolase family protein  25.56 
 
 		 509 aa  58.5  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3629  glycoside hydrolase family 28  29.49 
 
 		 488 aa  58.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3960  polygalacturonase  24.15 
 
 		 532 aa  57.4  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0761528  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3030  glycoside hydrolase family 28  24.69 
 
 		 467 aa  57  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1884  glycoside hydrolase family protein  22.26 
 
 		 606 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0717  glycoside hydrolase family 28  33.33 
 
 		 559 aa  54.7  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0152  glycoside hydrolase family 28  23.55 
 
 		 602 aa  52.8  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00376  polygalacturonase  22.2 
 
 		 602 aa  51.6  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2115  glycoside hydrolase family protein  24.29 
 
 		 460 aa  50.8  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3223  glycoside hydrolase family 28  23.58 
 
 		 460 aa  50.1  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.362624  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1092  glycoside hydrolase family 28  23.58 
 
 		 460 aa  50.1  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1581  glycoside hydrolase family 28  27.82 
 
 		 489 aa  49.7  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0871574 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1756  exo-poly-galacturonase signal peptide protein  24.84 
 
 		 702 aa  46.2  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0518728  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0989  glycoside hydrolase family 28  28.8 
 
 		 402 aa  45.8  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06656  endopolygalacturonase (Eurofung)  27.42 
 
 		 514 aa  45.1  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1170  glycoside hydrolase family protein  26.81 
 
 		 548 aa  43.9  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>