81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00376 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00376  polygalacturonase  100 
 
 		 602 aa  1229    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0880  polygalacturonase precursor (pectinase) signal peptide protein  52.42 
 
 		 531 aa  525  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.609321  normal  0.0402395 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1570  glycoside hydrolase family protein  54.26 
 
 		 544 aa  498  1e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3960  polygalacturonase  49.61 
 
 		 532 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0761528  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1628  polygalacturonase precursor  53.49 
 
 		 544 aa  492  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1489  Polygalacturonase/Pectinase  49.43 
 
 		 544 aa  463  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7020  hypothetical protein  35.96 
 
 		 449 aa  250  5e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361507  normal  0.742896 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3321  glycoside hydrolase family 28  36.41 
 
 		 402 aa  223  6e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0989  glycoside hydrolase family 28  36.66 
 
 		 402 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3630  glycoside hydrolase family 28  34.87 
 
 		 513 aa  207  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.370863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3629  glycoside hydrolase family 28  32.45 
 
 		 488 aa  196  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5664  glycoside hydrolase family protein  30.91 
 
 		 725 aa  193  9e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6029  glycoside hydrolase family protein  30.91 
 
 		 725 aa  193  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0491802  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5982  glycoside hydrolase family protein  30.77 
 
 		 716 aa  192  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.113133 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2115  glycoside hydrolase family protein  30.75 
 
 		 460 aa  127  5e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3223  glycoside hydrolase family 28  27.41 
 
 		 460 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.362624  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1092  glycoside hydrolase family 28  27.41 
 
 		 460 aa  118  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3030  glycoside hydrolase family 28  28.43 
 
 		 467 aa  117  7.999999999999999e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6953  glycoside hydrolase family 28  29.21 
 
 		 390 aa  108  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3334  galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  28.35 
 
 		 478 aa  106  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2380  Galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  28.08 
 
 		 447 aa  101  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4088  glycoside hydrolase family protein  25.75 
 
 		 522 aa  88.6  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.59776  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2532  glycoside hydrolase family 28  26.12 
 
 		 459 aa  89  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29200  endopolygalacturonase  25.98 
 
 		 431 aa  88.2  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2818  glycoside hydrolase family 28  26.6 
 
 		 542 aa  86.3  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4247  glycoside hydrolase family protein  25.26 
 
 		 448 aa  84.7  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.783037  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2125  glycoside hydrolase family 28  25.79 
 
 		 437 aa  83.6  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4790  glycoside hydrolase family 28  25.63 
 
 		 541 aa  83.6  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0680897  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2736  glycoside hydrolase family protein  24.7 
 
 		 518 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.835022  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2457  glycoside hydrolase family 28  30.62 
 
 		 508 aa  79.3  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140372  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0700  glycoside hydrolase family 28  24.32 
 
 		 509 aa  77.8  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1158  glycoside hydrolase family 28  25.7 
 
 		 554 aa  74.7  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  24.8 
 
 		 865 aa  74.3  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1253  glycoside hydrolase family 28  26.94 
 
 		 544 aa  73.6  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.80507  normal  0.501453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4784  glycoside hydrolase family 28  25.19 
 
 		 551 aa  72  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.821545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4256  glycoside hydrolase family protein  25.7 
 
 		 475 aa  72  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1579  glycoside hydrolase family 28  24.51 
 
 		 492 aa  70.9  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0814382 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2567  glycoside hydrolase family protein  23.08 
 
 		 474 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0953  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 463 aa  67.8  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.161663  hitchhiker  0.000000205432 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0152  glycoside hydrolase family 28  25.88 
 
 		 602 aa  67.8  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3977  glycoside hydrolase family 28  23.08 
 
 		 543 aa  67.4  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.722531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1410  Fibronectin type III domain protein  27.48 
 
 		 659 aa  66.2  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1884  glycoside hydrolase family protein  27.06 
 
 		 606 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2862  Fibronectin type III domain protein  28.01 
 
 		 659 aa  65.9  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0153  glycoside hydrolase family 28  27.08 
 
 		 604 aa  65.5  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.90665  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4115  glycoside hydrolase family protein  23.83 
 
 		 560 aa  63.5  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3114  glycoside hydrolase family protein  23.87 
 
 		 479 aa  62.8  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0230  glycoside hydrolase family protein  23.6 
 
 		 462 aa  62.8  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46668  predicted protein  23.28 
 
 		 451 aa  59.7  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000812304  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5506  lipolytic protein G-D-S-L family  31.43 
 
 		 727 aa  58.5  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00398864  hitchhiker  0.00322716 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4285  glycoside hydrolase family protein  27.88 
 
 		 543 aa  58.2  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0498  glycoside hydrolase family protein  22.81 
 
 		 446 aa  57.8  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.446578  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0483  glycoside hydrolase family protein  23.54 
 
 		 446 aa  57.8  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0200  glycoside hydrolase family 28  25.19 
 
 		 605 aa  57.4  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4603  glycoside hydrolase family protein  22.77 
 
 		 665 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.039982  hitchhiker  0.000685896 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06656  endopolygalacturonase (Eurofung)  33.12 
 
 		 514 aa  55.1  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2888  glycoside hydrolase family 28  22.25 
 
 		 530 aa  53.9  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.022046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0610  glycoside hydrolase family 28  31.78 
 
 		 528 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4904  glycoside hydrolase family protein  22.62 
 
 		 665 aa  52.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2300  glycoside hydrolase family 28  23.25 
 
 		 455 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5453  glycoside hydrolase family protein  22.84 
 
 		 664 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.34591 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5903  glycoside hydrolase family 28  30.13 
 
 		 521 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.672596 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3221  glycoside hydrolase family protein  22.2 
 
 		 665 aa  51.2  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.301284  normal  0.0580699 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6920  glycoside hydrolase family protein  25.87 
 
 		 458 aa  50.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3277  glycoside hydrolase family protein  27.27 
 
 		 458 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.113275 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2391  glycoside hydrolase family 28  24.68 
 
 		 470 aa  50.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880928  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4887  glycoside hydrolase family protein  27.27 
 
 		 458 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08327  Endo-polygalacturonasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ATQ3]  24.71 
 
 		 380 aa  49.7  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.23769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0972  glycoside hydrolase family 28  21.54 
 
 		 448 aa  48.9  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0833  polygalacturonase transmembrane protein  30 
 
 		 680 aa  49.3  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00798361 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0824  glycoside hydrolase family 28  22.31 
 
 		 444 aa  49.7  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16052  predicted protein  24.23 
 
 		 271 aa  48.9  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.032394  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3217  glycoside hydrolase family protein  24.2 
 
 		 491 aa  48.5  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3113  glycoside hydrolase family 28  22.32 
 
 		 524 aa  47.8  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00001805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0717  glycoside hydrolase family 28  24.78 
 
 		 559 aa  47.4  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4858  glycoside hydrolase family 28  30.08 
 
 		 671 aa  47.4  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0653045  normal  0.492882 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04372  Endo-polygalacturonase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT2]  29.63 
 
 		 361 aa  47.4  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.217421 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1200  hypothetical protein  26.8 
 
 		 2159 aa  47.4  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.932976 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1529  glycoside hydrolase family 28  25.68 
 
 		 442 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.604094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04250  endopolygalacturonase  31.43 
 
 		 135 aa  45.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3371  glycoside hydrolase family 28  22.64 
 
 		 444 aa  43.9  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>