127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5506 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1158  glycoside hydrolase family 28  69.65 
 
 		 554 aa  671    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5506  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 		 727 aa  1507    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00398864  hitchhiker  0.00322716 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1253  glycoside hydrolase family 28  61.23 
 
 		 544 aa  625  1e-177  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.80507  normal  0.501453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4784  glycoside hydrolase family 28  55.81 
 
 		 551 aa  554  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.821545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4115  glycoside hydrolase family protein  46.53 
 
 		 560 aa  472  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2567  glycoside hydrolase family protein  44.86 
 
 		 474 aa  389  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0230  glycoside hydrolase family protein  39.59 
 
 		 462 aa  345  1e-93  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4088  glycoside hydrolase family protein  38.34 
 
 		 522 aa  302  1e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.59776  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2457  glycoside hydrolase family 28  39.64 
 
 		 508 aa  298  3e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140372  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2818  glycoside hydrolase family 28  38.62 
 
 		 542 aa  298  3e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4790  glycoside hydrolase family 28  32.71 
 
 		 541 aa  264  4e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0680897  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  33.33 
 
 		 865 aa  261  4e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2380  Galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  34.91 
 
 		 447 aa  260  6e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4285  glycoside hydrolase family protein  32.84 
 
 		 543 aa  253  9.000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2391  glycoside hydrolase family 28  33.64 
 
 		 470 aa  244  5e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880928  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29200  endopolygalacturonase  35.66 
 
 		 431 aa  238  3e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0953  glycoside hydrolase family protein  36.26 
 
 		 463 aa  237  6e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.161663  hitchhiker  0.000000205432 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4256  glycoside hydrolase family protein  33.64 
 
 		 475 aa  235  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0700  glycoside hydrolase family 28  32.87 
 
 		 509 aa  231  3e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0483  glycoside hydrolase family protein  31.66 
 
 		 446 aa  229  1e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0498  glycoside hydrolase family protein  31.66 
 
 		 446 aa  228  2e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.446578  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0610  glycoside hydrolase family 28  33.05 
 
 		 528 aa  225  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4247  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 448 aa  223  7e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.783037  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5903  glycoside hydrolase family 28  31.86 
 
 		 521 aa  216  9e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.672596 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2532  glycoside hydrolase family 28  34.64 
 
 		 459 aa  212  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1522  lipolytic protein G-D-S-L family  46.41 
 
 		 252 aa  209  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.652703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2300  glycoside hydrolase family 28  31.01 
 
 		 455 aa  202  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4664  lipolytic protein G-D-S-L family  44.24 
 
 		 285 aa  192  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.106654  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1242  lipolytic protein G-D-S-L family  43.51 
 
 		 251 aa  188  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0146465  normal  0.0264869 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2325  lipolytic protein G-D-S-L family  44.25 
 
 		 340 aa  187  7e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2736  glycoside hydrolase family protein  28.38 
 
 		 518 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.835022  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3334  galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  31.46 
 
 		 478 aa  185  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4246  GDSL family lipase  47.29 
 
 		 218 aa  182  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50953  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1156  lipolytic protein G-D-S-L family  42.45 
 
 		 266 aa  174  5e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.866129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3094  GntR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 266 aa  171  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000000466752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0769  lipolytic protein G-D-S-L family  39.68 
 
 		 258 aa  170  7e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4445  lipolytic protein G-D-S-L family  42.47 
 
 		 230 aa  169  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.185378  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3820  Pectinesterase  40.27 
 
 		 627 aa  167  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05360  fibronectin type 3 domain-containing protein  40.54 
 
 		 1880 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2735  GDSL family lipase  41.71 
 
 		 239 aa  166  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.886563  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2125  glycoside hydrolase family 28  26.68 
 
 		 437 aa  158  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1092  glycoside hydrolase family 28  29.21 
 
 		 460 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3223  glycoside hydrolase family 28  28.64 
 
 		 460 aa  155  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.362624  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1336  GDSL family lipase  36.51 
 
 		 419 aa  155  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341885 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3030  glycoside hydrolase family 28  27.35 
 
 		 467 aa  155  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2115  glycoside hydrolase family protein  27.87 
 
 		 460 aa  152  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3313  GDSL family lipase  41.55 
 
 		 233 aa  151  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  35.29 
 
 		 831 aa  144  6e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5453  glycoside hydrolase family protein  29.19 
 
 		 664 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.34591 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3221  glycoside hydrolase family protein  28.8 
 
 		 665 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.301284  normal  0.0580699 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4904  glycoside hydrolase family protein  28.53 
 
 		 665 aa  137  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6953  glycoside hydrolase family 28  27.02 
 
 		 390 aa  137  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4603  glycoside hydrolase family protein  28.65 
 
 		 665 aa  137  9e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.039982  hitchhiker  0.000685896 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29260  lysophospholipase L1-like esterase  38.03 
 
 		 230 aa  136  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4858  glycoside hydrolase family 28  29.65 
 
 		 671 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0653045  normal  0.492882 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3111  lipolytic protein G-D-S-L family  38.64 
 
 		 238 aa  129  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0200  glycoside hydrolase family 28  27.25 
 
 		 605 aa  128  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3115  glycoside hydrolase family protein  28.53 
 
 		 509 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46668  predicted protein  24.57 
 
 		 451 aa  125  4e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000812304  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2888  glycoside hydrolase family 28  28.48 
 
 		 530 aa  124  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.022046  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0833  polygalacturonase transmembrane protein  28.77 
 
 		 680 aa  124  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00798361 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1569  glycoside hydrolase family 28  25.71 
 
 		 443 aa  120  7.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2824  putative rhamnogalacturonan acetylesterase  37.91 
 
 		 165 aa  118  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1710  glycoside hydrolase family 28  25.4 
 
 		 518 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190203  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4273  pectinesterase  34.38 
 
 		 571 aa  118  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3217  glycoside hydrolase family protein  26.86 
 
 		 491 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3371  glycoside hydrolase family 28  23.76 
 
 		 444 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1579  glycoside hydrolase family 28  28.61 
 
 		 492 aa  114  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0814382 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5374  glycoside hydrolase family 28  24.78 
 
 		 442 aa  110  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.558216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5759  polygalacturonase  28.94 
 
 		 416 aa  110  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0972  glycoside hydrolase family 28  24.16 
 
 		 448 aa  109  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0152  glycoside hydrolase family 28  25.96 
 
 		 602 aa  110  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4228  glycoside hydrolase family protein  24.69 
 
 		 442 aa  109  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1884  glycoside hydrolase family protein  26.56 
 
 		 606 aa  108  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03283  rhamnogalacturonan acetylesterase  43.48 
 
 		 161 aa  107  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.826167  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0824  glycoside hydrolase family 28  22.41 
 
 		 444 aa  107  8e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0153  glycoside hydrolase family 28  27.03 
 
 		 604 aa  105  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.90665  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3114  glycoside hydrolase family protein  24.71 
 
 		 479 aa  103  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3719  exo-poly-alpha-D-galacturonosidase precursor  25.16 
 
 		 537 aa  103  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3113  glycoside hydrolase family 28  24.77 
 
 		 524 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00001805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5079  Parallel beta-helix repeat protein  27.09 
 
 		 454 aa  98.6  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416725  normal  0.142328 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5359  putative polygalacturonase protein  25.85 
 
 		 454 aa  97.4  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071082  normal  0.281824 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0717  glycoside hydrolase family 28  26.68 
 
 		 559 aa  97.1  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1581  glycoside hydrolase family 28  24.64 
 
 		 489 aa  96.3  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0871574 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1529  glycoside hydrolase family 28  24.18 
 
 		 442 aa  94.7  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.604094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1410  Fibronectin type III domain protein  22.9 
 
 		 659 aa  94.4  7e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4226  GDSL family lipase  29.76 
 
 		 491 aa  93.2  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2862  Fibronectin type III domain protein  22.38 
 
 		 659 aa  93.6  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4022  GDSL family lipase  29 
 
 		 277 aa  92.8  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1356  GDSL family lipase  28.97 
 
 		 552 aa  90.9  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1170  glycoside hydrolase family protein  26.82 
 
 		 548 aa  89  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1088  pectin acetylesterase  29.84 
 
 		 551 aa  89  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02834  esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17250)  30.8 
 
 		 250 aa  88.2  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.417764  normal  0.0230725 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0740  pectinesterase  27.91 
 
 		 865 aa  87.8  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1229  pectin acetylesterase  27.31 
 
 		 552 aa  86.3  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3046  pectin acetylesterase  28.9 
 
 		 552 aa  85.5  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6877  hypothetical protein  22.37 
 
 		 543 aa  85.5  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0249011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1231  Lysophospholipase L1 and related esterase-like protein  29.51 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0882392 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3977  glycoside hydrolase family 28  31.72 
 
 		 543 aa  81.6  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.722531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3372  lipolytic protein G-D-S-L family  29.74 
 
 		 396 aa  79  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>