88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4273 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4273  pectinesterase  100 
 
 		 571 aa  1164    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3049  Pectinesterase  46.67 
 
 		 326 aa  265  2e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1157  Pectinesterase  40.37 
 
 		 322 aa  257  3e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1149  Pectinesterase  42.38 
 
 		 345 aa  254  3e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4248  pectate lyase  42.51 
 
 		 666 aa  247  4e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.38518  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4787  Pectinesterase  40.06 
 
 		 337 aa  244  3e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.669677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  42.46 
 
 		 644 aa  244  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4096  pectinesterase  40.66 
 
 		 338 aa  244  3.9999999999999997e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.557872  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1301  pectinesterase  40 
 
 		 345 aa  241  2.9999999999999997e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1812  Pectinesterase  40.99 
 
 		 326 aa  238  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4438  Pectinesterase  41.53 
 
 		 391 aa  236  9e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0674523  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  39.02 
 
 		 567 aa  220  3.9999999999999997e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1246  Pectinesterase  36.53 
 
 		 560 aa  184  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  38.63 
 
 		 794 aa  173  7.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  38.36 
 
 		 487 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0501  pectinesterase  35.4 
 
 		 447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0433  Pectinesterase  37.04 
 
 		 457 aa  147  7.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.825978  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3047  Pectinesterase  31.2 
 
 		 368 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0496  Pectinesterase  35.67 
 
 		 686 aa  141  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03390  Pectinesterase (EC 3.1.1.11) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B7U0]  33 
 
 		 325 aa  140  4.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0409748  normal  0.798545 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0447  pectinesterase  33.74 
 
 		 376 aa  139  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1843  Pectate lyase/Amb allergen  34.46 
 
 		 730 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1391  Pectinesterase  38.12 
 
 		 347 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161325  hitchhiker  0.00169458 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0844  pectinesterase A  31.92 
 
 		 361 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3639  pectinesterase  31.92 
 
 		 361 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3511  pectinesterase A  31.92 
 
 		 361 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.12966  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1228  Pectinesterase  29.6 
 
 		 368 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1087  Pectinesterase  31.97 
 
 		 366 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.925496  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0769  lipolytic protein G-D-S-L family  39.58 
 
 		 258 aa  130  7.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4022  GDSL family lipase  36.84 
 
 		 277 aa  130  9.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2469  Pectinesterase  33.14 
 
 		 746 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.151342  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3820  Pectinesterase  32.43 
 
 		 627 aa  128  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1242  lipolytic protein G-D-S-L family  35.9 
 
 		 251 aa  126  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0146465  normal  0.0264869 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2766  Pectinesterase  30.38 
 
 		 366 aa  125  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.422306  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4246  GDSL family lipase  35 
 
 		 218 aa  124  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50953  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1522  lipolytic protein G-D-S-L family  36.82 
 
 		 252 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.652703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2325  lipolytic protein G-D-S-L family  39.53 
 
 		 340 aa  121  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1156  lipolytic protein G-D-S-L family  35.29 
 
 		 266 aa  120  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.866129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  34.91 
 
 		 831 aa  118  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5506  lipolytic protein G-D-S-L family  34.82 
 
 		 727 aa  118  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00398864  hitchhiker  0.00322716 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4445  lipolytic protein G-D-S-L family  35.87 
 
 		 230 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.185378  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0740  pectinesterase  27.22 
 
 		 865 aa  117  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4664  lipolytic protein G-D-S-L family  38.53 
 
 		 285 aa  117  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.106654  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1336  GDSL family lipase  37.02 
 
 		 419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341885 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4663  Pectinesterase  30.79 
 
 		 334 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0682309  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3094  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 266 aa  110  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000000466752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1356  GDSL family lipase  30.38 
 
 		 552 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2735  GDSL family lipase  34.58 
 
 		 239 aa  97.1  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.886563  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29260  lysophospholipase L1-like esterase  33.64 
 
 		 230 aa  96.7  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3313  GDSL family lipase  35.68 
 
 		 233 aa  95.5  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05360  fibronectin type 3 domain-containing protein  31.62 
 
 		 1880 aa  91.3  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2824  putative rhamnogalacturonan acetylesterase  41.26 
 
 		 165 aa  90.9  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3447  pectin methylesterase-like  29.39 
 
 		 1081 aa  88.2  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000110016  hitchhiker  0.000230846 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0944  ribosomal protein L30  27.78 
 
 		 389 aa  87.4  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000748406 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3111  lipolytic protein G-D-S-L family  35.91 
 
 		 238 aa  86.7  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1229  pectin acetylesterase  29.15 
 
 		 552 aa  84.7  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3046  pectin acetylesterase  28.78 
 
 		 552 aa  84  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04860  pectin methyl esterase (Eurofung)  26.72 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4427  putative pectinesterase  30.58 
 
 		 400 aa  82  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.681186  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2469  putative pectinesterase  27.94 
 
 		 434 aa  80.5  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.895258  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00373  putative pectinesterase  30.59 
 
 		 393 aa  80.5  0.00000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.350288  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02834  esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17250)  33.17 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.417764  normal  0.0230725 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0138  putative pectinesterase  27.69 
 
 		 439 aa  79.3  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.356938  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1088  pectin acetylesterase  29.32 
 
 		 551 aa  78.2  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4226  GDSL family lipase  25.5 
 
 		 491 aa  78.2  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4146  putative pectinesterase  29.61 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2765  lipolytic protein G-D-S-L family  28.46 
 
 		 546 aa  69.3  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.198603  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3372  lipolytic protein G-D-S-L family  30.67 
 
 		 396 aa  68.6  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1259  putative pectinesterase  25.28 
 
 		 427 aa  67.8  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03283  rhamnogalacturonan acetylesterase  37.6 
 
 		 161 aa  67.4  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.826167  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0795  putative pectinesterase  24.44 
 
 		 427 aa  62  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0876  putative pectinesterase  24.44 
 
 		 427 aa  61.2  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0881  putative pectinesterase  25.37 
 
 		 427 aa  60.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02528  Putative uncharacterized proteinRhamnogalacturonan acetylesterase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BAA2]  28.71 
 
 		 245 aa  60.1  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1231  Lysophospholipase L1 and related esterase-like protein  30 
 
 		 280 aa  59.7  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0882392 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2580  putative pectinesterase  25 
 
 		 427 aa  60.1  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.390355  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0826  putative pectinesterase  25 
 
 		 427 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0907325  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2870  Pectinesterase  25 
 
 		 427 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0799  putative pectinesterase  25 
 
 		 427 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0850  putative pectinesterase  25 
 
 		 427 aa  58.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2890  putative pectinesterase  25.3 
 
 		 427 aa  58.5  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0446001  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00700  hypothetical protein  25.3 
 
 		 427 aa  58.5  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0117403  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00725  predicted pectinesterase  25.3 
 
 		 427 aa  58.5  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00760581  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0913  putative pectinesterase  25 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0936  putative pectinesterase  25 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0822  putative pectinesterase  25 
 
 		 427 aa  57.4  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07966  conserved hypothetical protein  40.74 
 
 		 209 aa  48.1  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.488758  normal  0.390044 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4090  pectinesterase  28.38 
 
 		 469 aa  47.8  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169247  normal  0.786788 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>