33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2735 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2735  GDSL family lipase  100 
 
 
239 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.886563  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2325  lipolytic protein G-D-S-L family  45.79 
 
 
340 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1242  lipolytic protein G-D-S-L family  39.73 
 
 
251 aa  171  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0146465  normal  0.0264869 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5506  lipolytic protein G-D-S-L family  41.71 
 
 
727 aa  166  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00398864  hitchhiker  0.00322716 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4664  lipolytic protein G-D-S-L family  42.33 
 
 
285 aa  165  5.9999999999999996e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.106654  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1522  lipolytic protein G-D-S-L family  38.03 
 
 
252 aa  156  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.652703  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3820  Pectinesterase  41.12 
 
 
627 aa  155  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0769  lipolytic protein G-D-S-L family  38.53 
 
 
258 aa  154  9e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1156  lipolytic protein G-D-S-L family  41.67 
 
 
266 aa  154  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.866129  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3094  GntR family transcriptional regulator  38.97 
 
 
266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000000466752  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4445  lipolytic protein G-D-S-L family  36.15 
 
 
230 aa  150  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.185378  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2824  putative rhamnogalacturonan acetylesterase  51.37 
 
 
165 aa  142  5e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4246  GDSL family lipase  41.75 
 
 
218 aa  142  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50953  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29260  lysophospholipase L1-like esterase  38.6 
 
 
230 aa  141  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05360  fibronectin type 3 domain-containing protein  34.22 
 
 
1880 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3111  lipolytic protein G-D-S-L family  35.62 
 
 
238 aa  129  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  38.99 
 
 
831 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3313  GDSL family lipase  35.68 
 
 
233 aa  124  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1336  GDSL family lipase  32.86 
 
 
419 aa  103  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.341885 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03283  rhamnogalacturonan acetylesterase  45.07 
 
 
161 aa  99.4  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.826167  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4022  GDSL family lipase  33.08 
 
 
277 aa  98.6  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4273  pectinesterase  34.58 
 
 
571 aa  97.1  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3046  pectin acetylesterase  27.91 
 
 
552 aa  93.2  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1088  pectin acetylesterase  26.87 
 
 
551 aa  92  8e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1229  pectin acetylesterase  27.91 
 
 
552 aa  92  8e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0740  pectinesterase  28.12 
 
 
865 aa  86.7  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2765  lipolytic protein G-D-S-L family  25.82 
 
 
546 aa  84.3  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.198603  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1356  GDSL family lipase  26.61 
 
 
552 aa  69.3  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3372  lipolytic protein G-D-S-L family  26.91 
 
 
396 aa  68.9  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02834  esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17250)  29.06 
 
 
250 aa  66.6  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.417764  normal  0.0230725 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1231  Lysophospholipase L1 and related esterase-like protein  40.48 
 
 
280 aa  65.1  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0882392 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4226  GDSL family lipase  26.89 
 
 
491 aa  64.3  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02528  Putative uncharacterized proteinRhamnogalacturonan acetylesterase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BAA2]  41.25 
 
 
245 aa  59.7  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>