32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2765 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1229  pectin acetylesterase  63.1 
 
 
552 aa  699    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3046  pectin acetylesterase  63.67 
 
 
552 aa  707    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1088  pectin acetylesterase  68.43 
 
 
551 aa  770    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2765  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
546 aa  1140    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.198603  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0740  pectinesterase  42.72 
 
 
865 aa  426  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.68 
 
 
831 aa  109  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4664  lipolytic protein G-D-S-L family  29.23 
 
 
285 aa  101  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.106654  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1522  lipolytic protein G-D-S-L family  28.85 
 
 
252 aa  97.4  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.652703  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3820  Pectinesterase  28.57 
 
 
627 aa  97.4  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2735  GDSL family lipase  26.74 
 
 
239 aa  96.7  9e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.886563  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2325  lipolytic protein G-D-S-L family  28.03 
 
 
340 aa  91.7  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4445  lipolytic protein G-D-S-L family  28.57 
 
 
230 aa  91.3  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.185378  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1156  lipolytic protein G-D-S-L family  27.03 
 
 
266 aa  91.3  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.866129  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5506  lipolytic protein G-D-S-L family  28.96 
 
 
727 aa  89.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00398864  hitchhiker  0.00322716 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1242  lipolytic protein G-D-S-L family  26.44 
 
 
251 aa  88.2  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0146465  normal  0.0264869 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3094  GntR family transcriptional regulator  28.26 
 
 
266 aa  87  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000000466752  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4246  GDSL family lipase  28.51 
 
 
218 aa  84.7  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50953  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29260  lysophospholipase L1-like esterase  25.29 
 
 
230 aa  80.9  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1356  GDSL family lipase  32.63 
 
 
552 aa  79  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4273  pectinesterase  28.57 
 
 
571 aa  75.5  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05360  fibronectin type 3 domain-containing protein  24.23 
 
 
1880 aa  75.1  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4226  GDSL family lipase  29.35 
 
 
491 aa  73.2  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03283  rhamnogalacturonan acetylesterase  35.62 
 
 
161 aa  72.4  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.826167  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0769  lipolytic protein G-D-S-L family  25.35 
 
 
258 aa  71.2  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1336  GDSL family lipase  25.64 
 
 
419 aa  67  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.341885 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4022  GDSL family lipase  32.05 
 
 
277 aa  63.5  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1231  Lysophospholipase L1 and related esterase-like protein  24.86 
 
 
280 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0882392 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3313  GDSL family lipase  23.14 
 
 
233 aa  55.1  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02528  Putative uncharacterized proteinRhamnogalacturonan acetylesterase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BAA2]  35.05 
 
 
245 aa  52.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2824  putative rhamnogalacturonan acetylesterase  26.6 
 
 
165 aa  50.8  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3372  lipolytic protein G-D-S-L family  26.11 
 
 
396 aa  48.1  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3111  lipolytic protein G-D-S-L family  25.88 
 
 
238 aa  47  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>