34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4664 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4664  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 		 285 aa  568  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.106654  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3820  Pectinesterase  57.92 
 
 		 627 aa  270  2e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2325  lipolytic protein G-D-S-L family  48.46 
 
 		 340 aa  217  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5506  lipolytic protein G-D-S-L family  44.24 
 
 		 727 aa  192  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00398864  hitchhiker  0.00322716 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  46.19 
 
 		 831 aa  187  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2824  putative rhamnogalacturonan acetylesterase  60.56 
 
 		 165 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1522  lipolytic protein G-D-S-L family  42.79 
 
 		 252 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.652703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05360  fibronectin type 3 domain-containing protein  43.33 
 
 		 1880 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4246  GDSL family lipase  41.33 
 
 		 218 aa  171  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50953  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2735  GDSL family lipase  42.33 
 
 		 239 aa  165  8e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.886563  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1242  lipolytic protein G-D-S-L family  39.71 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0146465  normal  0.0264869 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3094  GntR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 266 aa  162  6e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000000466752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0769  lipolytic protein G-D-S-L family  41.55 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1156  lipolytic protein G-D-S-L family  37.91 
 
 		 266 aa  152  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.866129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1336  GDSL family lipase  39.34 
 
 		 419 aa  147  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341885 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4445  lipolytic protein G-D-S-L family  35.38 
 
 		 230 aa  145  9e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.185378  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29260  lysophospholipase L1-like esterase  40 
 
 		 230 aa  138  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3313  GDSL family lipase  40.76 
 
 		 233 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3111  lipolytic protein G-D-S-L family  42.01 
 
 		 238 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4273  pectinesterase  38.53 
 
 		 571 aa  117  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03283  rhamnogalacturonan acetylesterase  42.36 
 
 		 161 aa  115  7.999999999999999e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.826167  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3372  lipolytic protein G-D-S-L family  35.02 
 
 		 396 aa  101  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0740  pectinesterase  28.47 
 
 		 865 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1088  pectin acetylesterase  29.69 
 
 		 551 aa  99.4  7e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3046  pectin acetylesterase  28.85 
 
 		 552 aa  96.3  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1229  pectin acetylesterase  28.85 
 
 		 552 aa  95.1  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2765  lipolytic protein G-D-S-L family  28.23 
 
 		 546 aa  92.4  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.198603  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1356  GDSL family lipase  28.52 
 
 		 552 aa  85.5  9e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02834  esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17250)  28.07 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.417764  normal  0.0230725 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4226  GDSL family lipase  24.36 
 
 		 491 aa  73.6  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4022  GDSL family lipase  34.34 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1231  Lysophospholipase L1 and related esterase-like protein  27.14 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0882392 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02528  Putative uncharacterized proteinRhamnogalacturonan acetylesterase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BAA2]  29.63 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4014  lipolytic protein  27.17 
 
 		 201 aa  42.7  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000555437  normal  0.540801 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>