87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3820 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3820  Pectinesterase  100 
 
 
627 aa  1268    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1843  Pectate lyase/Amb allergen  52.7 
 
 
730 aa  302  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4664  lipolytic protein G-D-S-L family  52.94 
 
 
285 aa  281  3e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.106654  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1391  Pectinesterase  49.69 
 
 
347 aa  276  9e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161325  hitchhiker  0.00169458 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0496  Pectinesterase  46.33 
 
 
686 aa  258  2e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0447  pectinesterase  44.89 
 
 
376 aa  256  6e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361706  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  39.27 
 
 
567 aa  237  5.0000000000000005e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  44 
 
 
794 aa  235  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  43.75 
 
 
487 aa  231  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1246  Pectinesterase  40.56 
 
 
560 aa  226  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4663  Pectinesterase  42.58 
 
 
334 aa  222  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0682309  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0501  pectinesterase  39.13 
 
 
447 aa  211  4e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0433  Pectinesterase  42.21 
 
 
457 aa  201  3.9999999999999996e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.825978  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4438  Pectinesterase  37.61 
 
 
391 aa  186  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0674523  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2325  lipolytic protein G-D-S-L family  42.54 
 
 
340 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3049  Pectinesterase  37.16 
 
 
326 aa  180  7e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3047  Pectinesterase  35.38 
 
 
368 aa  177  6e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2766  Pectinesterase  34.6 
 
 
366 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.422306  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1228  Pectinesterase  35.31 
 
 
368 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5506  lipolytic protein G-D-S-L family  40.27 
 
 
727 aa  174  5.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00398864  hitchhiker  0.00322716 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2824  putative rhamnogalacturonan acetylesterase  56.34 
 
 
165 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1087  Pectinesterase  35.94 
 
 
366 aa  171  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.925496  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1149  Pectinesterase  34.15 
 
 
345 aa  170  9e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862833  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3639  pectinesterase  36.04 
 
 
361 aa  165  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3511  pectinesterase A  36.04 
 
 
361 aa  164  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.12966  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0844  pectinesterase A  36.04 
 
 
361 aa  165  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  34.64 
 
 
644 aa  164  5.0000000000000005e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0138  putative pectinesterase  36.69 
 
 
439 aa  164  6e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.356938  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2735  GDSL family lipase  41.12 
 
 
239 aa  160  6e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.886563  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1242  lipolytic protein G-D-S-L family  36.45 
 
 
251 aa  158  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0146465  normal  0.0264869 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4445  lipolytic protein G-D-S-L family  37.04 
 
 
230 aa  157  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.185378  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4096  pectinesterase  34.14 
 
 
338 aa  157  7e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.557872  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1157  Pectinesterase  35.59 
 
 
322 aa  156  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1156  lipolytic protein G-D-S-L family  39.25 
 
 
266 aa  155  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.866129  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1301  pectinesterase  31.12 
 
 
345 aa  155  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1522  lipolytic protein G-D-S-L family  37.1 
 
 
252 aa  154  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.652703  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05360  fibronectin type 3 domain-containing protein  41.35 
 
 
1880 aa  152  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00373  putative pectinesterase  36.36 
 
 
393 aa  150  5e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.350288  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2469  Pectinesterase  34.5 
 
 
746 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.151342  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1812  Pectinesterase  34.46 
 
 
326 aa  146  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3094  GntR family transcriptional regulator  33.92 
 
 
266 aa  145  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000000466752  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  36.11 
 
 
831 aa  145  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4248  pectate lyase  32.33 
 
 
666 aa  145  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.38518  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4246  GDSL family lipase  36.41 
 
 
218 aa  145  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50953  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0769  lipolytic protein G-D-S-L family  34.76 
 
 
258 aa  143  8e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4787  Pectinesterase  30.21 
 
 
337 aa  141  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.669677  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4273  pectinesterase  32.94 
 
 
571 aa  135  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0740  pectinesterase  32.35 
 
 
865 aa  133  9e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3313  GDSL family lipase  38.12 
 
 
233 aa  131  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29260  lysophospholipase L1-like esterase  39.07 
 
 
230 aa  130  6e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1336  GDSL family lipase  35.38 
 
 
419 aa  127  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.341885 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3111  lipolytic protein G-D-S-L family  36.87 
 
 
238 aa  127  8.000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0944  ribosomal protein L30  29.85 
 
 
389 aa  115  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000748406 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2469  putative pectinesterase  29.23 
 
 
434 aa  110  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.895258  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4146  putative pectinesterase  30.03 
 
 
400 aa  107  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4427  putative pectinesterase  27.68 
 
 
400 aa  102  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.681186  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03283  rhamnogalacturonan acetylesterase  41.43 
 
 
161 aa  99.4  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.826167  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1088  pectin acetylesterase  29.82 
 
 
551 aa  97.1  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1259  putative pectinesterase  28.57 
 
 
427 aa  96.3  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1229  pectin acetylesterase  29.01 
 
 
552 aa  95.1  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3046  pectin acetylesterase  28.41 
 
 
552 aa  94  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0795  putative pectinesterase  28.78 
 
 
427 aa  92.8  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0876  putative pectinesterase  28.53 
 
 
427 aa  91.3  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00725  predicted pectinesterase  28.53 
 
 
427 aa  91.3  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00760581  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00700  hypothetical protein  28.53 
 
 
427 aa  91.3  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0117403  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2890  putative pectinesterase  28.53 
 
 
427 aa  91.3  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0446001  normal  0.0752938 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2870  Pectinesterase  28.78 
 
 
427 aa  90.9  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0826  putative pectinesterase  28.78 
 
 
427 aa  90.9  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0907325  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0799  putative pectinesterase  28.78 
 
 
427 aa  90.9  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2580  putative pectinesterase  28.78 
 
 
427 aa  90.9  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.390355  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0881  putative pectinesterase  26.65 
 
 
427 aa  89  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03390  Pectinesterase (EC 3.1.1.11) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B7U0]  29.76 
 
 
325 aa  87.8  6e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0409748  normal  0.798545 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2765  lipolytic protein G-D-S-L family  27.64 
 
 
546 aa  87  8e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.198603  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0850  putative pectinesterase  26.36 
 
 
427 aa  86.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0913  putative pectinesterase  26.36 
 
 
427 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0936  putative pectinesterase  26.36 
 
 
427 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0822  putative pectinesterase  26.07 
 
 
427 aa  83.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3372  lipolytic protein G-D-S-L family  30.09 
 
 
396 aa  82.4  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4226  GDSL family lipase  24.07 
 
 
491 aa  73.9  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02834  esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17250)  28.76 
 
 
250 aa  73.6  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.417764  normal  0.0230725 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1356  GDSL family lipase  27.19 
 
 
552 aa  72.4  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4022  GDSL family lipase  35.5 
 
 
277 aa  66.2  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3447  pectin methylesterase-like  25.27 
 
 
1081 aa  58.9  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000110016  hitchhiker  0.000230846 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1231  Lysophospholipase L1 and related esterase-like protein  25.4 
 
 
280 aa  54.3  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0882392 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02528  Putative uncharacterized proteinRhamnogalacturonan acetylesterase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BAA2]  27.9 
 
 
245 aa  49.3  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04860  pectin methyl esterase (Eurofung)  27.91 
 
 
389 aa  46.6  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1034  Sialate O-acetylesterase  25.78 
 
 
689 aa  43.9  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>