31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2824 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2824  putative rhamnogalacturonan acetylesterase  100 
 
 
165 aa  342  1e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4664  lipolytic protein G-D-S-L family  60.56 
 
 
285 aa  179  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.106654  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2325  lipolytic protein G-D-S-L family  52.9 
 
 
340 aa  166  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3820  Pectinesterase  56.34 
 
 
627 aa  162  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1242  lipolytic protein G-D-S-L family  43.87 
 
 
251 aa  142  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0146465  normal  0.0264869 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2735  GDSL family lipase  51.37 
 
 
239 aa  142  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.886563  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4445  lipolytic protein G-D-S-L family  43.95 
 
 
230 aa  141  5e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.185378  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0769  lipolytic protein G-D-S-L family  43.79 
 
 
258 aa  133  9e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1522  lipolytic protein G-D-S-L family  42.68 
 
 
252 aa  131  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.652703  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1156  lipolytic protein G-D-S-L family  43.23 
 
 
266 aa  130  6e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.866129  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  41.18 
 
 
831 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5506  lipolytic protein G-D-S-L family  37.91 
 
 
727 aa  117  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00398864  hitchhiker  0.00322716 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4246  GDSL family lipase  40.14 
 
 
218 aa  117  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50953  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05360  fibronectin type 3 domain-containing protein  37.66 
 
 
1880 aa  116  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1336  GDSL family lipase  39.87 
 
 
419 aa  112  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.341885 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3094  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 
266 aa  112  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000000466752  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29260  lysophospholipase L1-like esterase  42.14 
 
 
230 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3313  GDSL family lipase  42.96 
 
 
233 aa  107  9.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3111  lipolytic protein G-D-S-L family  40.52 
 
 
238 aa  105  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4273  pectinesterase  41.26 
 
 
571 aa  91.3  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0740  pectinesterase  26.2 
 
 
865 aa  65.5  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4022  GDSL family lipase  39.42 
 
 
277 aa  65.5  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03283  rhamnogalacturonan acetylesterase  50 
 
 
161 aa  65.5  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.826167  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1356  GDSL family lipase  29.27 
 
 
552 aa  63.9  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3372  lipolytic protein G-D-S-L family  28.78 
 
 
396 aa  60.5  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1229  pectin acetylesterase  27.66 
 
 
552 aa  59.7  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3046  pectin acetylesterase  27.13 
 
 
552 aa  58.9  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4226  GDSL family lipase  24.44 
 
 
491 aa  55.1  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1088  pectin acetylesterase  25.53 
 
 
551 aa  53.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2765  lipolytic protein G-D-S-L family  26.14 
 
 
546 aa  43.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.198603  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02834  esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17250)  24.41 
 
 
250 aa  41.2  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.417764  normal  0.0230725 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>