32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1229 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1229  pectin acetylesterase  100 
 
 
552 aa  1154    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3046  pectin acetylesterase  94.2 
 
 
552 aa  1093    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1088  pectin acetylesterase  62.73 
 
 
551 aa  722    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2765  lipolytic protein G-D-S-L family  63.1 
 
 
546 aa  679    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.198603  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0740  pectinesterase  45.22 
 
 
865 aa  454  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2325  lipolytic protein G-D-S-L family  28.68 
 
 
340 aa  102  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.88 
 
 
831 aa  101  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1522  lipolytic protein G-D-S-L family  30.77 
 
 
252 aa  96.3  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.652703  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4664  lipolytic protein G-D-S-L family  28.85 
 
 
285 aa  95.1  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.106654  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4445  lipolytic protein G-D-S-L family  27.17 
 
 
230 aa  93.2  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.185378  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1156  lipolytic protein G-D-S-L family  25.67 
 
 
266 aa  93.2  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.866129  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3820  Pectinesterase  29.01 
 
 
627 aa  93.2  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1242  lipolytic protein G-D-S-L family  27.97 
 
 
251 aa  92  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0146465  normal  0.0264869 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2735  GDSL family lipase  27.91 
 
 
239 aa  92  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.886563  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05360  fibronectin type 3 domain-containing protein  27.73 
 
 
1880 aa  88.2  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5506  lipolytic protein G-D-S-L family  27.31 
 
 
727 aa  86.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00398864  hitchhiker  0.00322716 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3094  GntR family transcriptional regulator  25.48 
 
 
266 aa  85.9  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000000466752  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4273  pectinesterase  29.15 
 
 
571 aa  84.3  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4246  GDSL family lipase  28.06 
 
 
218 aa  83.6  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50953  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1356  GDSL family lipase  31.61 
 
 
552 aa  76.6  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03283  rhamnogalacturonan acetylesterase  34.25 
 
 
161 aa  73.9  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.826167  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1336  GDSL family lipase  26.25 
 
 
419 aa  68.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.341885 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29260  lysophospholipase L1-like esterase  25 
 
 
230 aa  68.9  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4226  GDSL family lipase  27.33 
 
 
491 aa  67.8  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3313  GDSL family lipase  22.96 
 
 
233 aa  64.7  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0769  lipolytic protein G-D-S-L family  23.16 
 
 
258 aa  63.9  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1231  Lysophospholipase L1 and related esterase-like protein  26.14 
 
 
280 aa  60.1  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0882392 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2824  putative rhamnogalacturonan acetylesterase  27.66 
 
 
165 aa  59.7  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4022  GDSL family lipase  31.85 
 
 
277 aa  58.5  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.604582 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02528  Putative uncharacterized proteinRhamnogalacturonan acetylesterase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BAA2]  36 
 
 
245 aa  55.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3111  lipolytic protein G-D-S-L family  23.62 
 
 
238 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0504  cell wall surface anchor family protein, putative  30.77 
 
 
667 aa  49.3  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>