85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0740 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0740  pectinesterase  100 
 
 
865 aa  1799    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3046  pectin acetylesterase  46.02 
 
 
552 aa  463  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1229  pectin acetylesterase  45.22 
 
 
552 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1088  pectin acetylesterase  43.51 
 
 
551 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2765  lipolytic protein G-D-S-L family  42.72 
 
 
546 aa  411  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.198603  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1228  Pectinesterase  58.33 
 
 
368 aa  399  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3047  Pectinesterase  58.33 
 
 
368 aa  392  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1087  Pectinesterase  52.33 
 
 
366 aa  383  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.925496  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2766  Pectinesterase  54.77 
 
 
366 aa  369  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.422306  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3639  pectinesterase  50.42 
 
 
361 aa  357  5e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0844  pectinesterase A  50.42 
 
 
361 aa  357  5e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3511  pectinesterase A  50.14 
 
 
361 aa  354  5e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.12966  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0944  ribosomal protein L30  44.77 
 
 
389 aa  235  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000748406 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2469  Pectinesterase  35.24 
 
 
746 aa  197  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.151342  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0501  pectinesterase  38.1 
 
 
447 aa  177  9e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0433  Pectinesterase  37.88 
 
 
457 aa  171  5e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.825978  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  33.33 
 
 
567 aa  169  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1246  Pectinesterase  32.78 
 
 
560 aa  144  6e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1157  Pectinesterase  30.85 
 
 
322 aa  143  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  30.83 
 
 
644 aa  138  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4438  Pectinesterase  29.77 
 
 
391 aa  135  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0674523  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1301  pectinesterase  30.29 
 
 
345 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1843  Pectate lyase/Amb allergen  29.91 
 
 
730 aa  125  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3049  Pectinesterase  27.49 
 
 
326 aa  125  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3820  Pectinesterase  32.35 
 
 
627 aa  124  8e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  30.5 
 
 
487 aa  119  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  30.23 
 
 
794 aa  119  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1149  Pectinesterase  29.14 
 
 
345 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862833  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0496  Pectinesterase  26.95 
 
 
686 aa  117  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4273  pectinesterase  27.22 
 
 
571 aa  117  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4787  Pectinesterase  28.16 
 
 
337 aa  114  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.669677  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0447  pectinesterase  27.19 
 
 
376 aa  112  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361706  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4096  pectinesterase  28.19 
 
 
338 aa  111  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.557872  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1522  lipolytic protein G-D-S-L family  30.59 
 
 
252 aa  111  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.652703  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4663  Pectinesterase  30.32 
 
 
334 aa  108  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0682309  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1812  Pectinesterase  28.45 
 
 
326 aa  107  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1242  lipolytic protein G-D-S-L family  30.16 
 
 
251 aa  107  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0146465  normal  0.0264869 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2325  lipolytic protein G-D-S-L family  28.78 
 
 
340 aa  106  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1156  lipolytic protein G-D-S-L family  29.46 
 
 
266 aa  106  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.866129  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4248  pectate lyase  29.18 
 
 
666 aa  105  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.38518  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1391  Pectinesterase  28.28 
 
 
347 aa  103  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161325  hitchhiker  0.00169458 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.29 
 
 
831 aa  101  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4664  lipolytic protein G-D-S-L family  28.47 
 
 
285 aa  100  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.106654  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05360  fibronectin type 3 domain-containing protein  29.07 
 
 
1880 aa  97.4  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4445  lipolytic protein G-D-S-L family  27.84 
 
 
230 aa  95.9  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.185378  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3094  GntR family transcriptional regulator  27.41 
 
 
266 aa  91.7  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000000466752  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4246  GDSL family lipase  28.35 
 
 
218 aa  90.9  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50953  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03283  rhamnogalacturonan acetylesterase  36.49 
 
 
161 aa  89.7  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.826167  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5506  lipolytic protein G-D-S-L family  27.91 
 
 
727 aa  87.8  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00398864  hitchhiker  0.00322716 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2735  GDSL family lipase  28.12 
 
 
239 aa  86.7  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.886563  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00373  putative pectinesterase  30.38 
 
 
393 aa  82  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.350288  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1356  GDSL family lipase  31.67 
 
 
552 aa  78.6  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29260  lysophospholipase L1-like esterase  24.71 
 
 
230 aa  76.3  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4226  GDSL family lipase  27.98 
 
 
491 aa  75.5  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0769  lipolytic protein G-D-S-L family  23.47 
 
 
258 aa  74.7  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1336  GDSL family lipase  25.68 
 
 
419 aa  72.8  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.341885 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3313  GDSL family lipase  25.3 
 
 
233 aa  70.9  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0138  putative pectinesterase  28 
 
 
439 aa  67.8  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.356938  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2824  putative rhamnogalacturonan acetylesterase  26.2 
 
 
165 aa  65.5  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03390  Pectinesterase (EC 3.1.1.11) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B7U0]  26.07 
 
 
325 aa  64.3  0.000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0409748  normal  0.798545 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02528  Putative uncharacterized proteinRhamnogalacturonan acetylesterase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BAA2]  38.38 
 
 
245 aa  63.5  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1231  Lysophospholipase L1 and related esterase-like protein  37.18 
 
 
280 aa  62.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0882392 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3111  lipolytic protein G-D-S-L family  24.51 
 
 
238 aa  59.3  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04860  pectin methyl esterase (Eurofung)  25.39 
 
 
389 aa  59.3  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3447  pectin methylesterase-like  25 
 
 
1081 aa  57.8  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000110016  hitchhiker  0.000230846 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4022  GDSL family lipase  24.73 
 
 
277 aa  57.8  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2469  putative pectinesterase  29.38 
 
 
434 aa  57.8  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.895258  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3372  lipolytic protein G-D-S-L family  38.89 
 
 
396 aa  57  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1259  putative pectinesterase  30.13 
 
 
427 aa  52.4  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4090  pectinesterase  27.18 
 
 
469 aa  49.3  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169247  normal  0.786788 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0850  putative pectinesterase  31.78 
 
 
427 aa  48.9  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0795  putative pectinesterase  28.85 
 
 
427 aa  48.5  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00725  predicted pectinesterase  28.85 
 
 
427 aa  47.8  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00760581  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2890  putative pectinesterase  28.85 
 
 
427 aa  47.8  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0446001  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00700  hypothetical protein  28.85 
 
 
427 aa  47.8  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0117403  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0876  putative pectinesterase  28.85 
 
 
427 aa  47.8  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0881  putative pectinesterase  31.78 
 
 
427 aa  47.8  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2580  putative pectinesterase  28.85 
 
 
427 aa  47.8  0.0009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.390355  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0799  putative pectinesterase  28.85 
 
 
427 aa  47.8  0.0009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0826  putative pectinesterase  28.85 
 
 
427 aa  47.8  0.0009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0907325  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2870  Pectinesterase  28.85 
 
 
427 aa  47.8  0.0009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0936  putative pectinesterase  31.78 
 
 
427 aa  47.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0913  putative pectinesterase  31.78 
 
 
427 aa  47.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0822  putative pectinesterase  30.84 
 
 
427 aa  45.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02834  esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17250)  31.2 
 
 
250 aa  44.7  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.417764  normal  0.0230725 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>