57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1228 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3047  Pectinesterase  91.85 
 
 		 368 aa  700    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1228  Pectinesterase  100 
 
 		 368 aa  761    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1087  Pectinesterase  73.26 
 
 		 366 aa  538  9.999999999999999e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.925496  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2766  Pectinesterase  73.91 
 
 		 366 aa  523  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.422306  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3511  pectinesterase A  61.11 
 
 		 361 aa  445  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.12966  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3639  pectinesterase  61.11 
 
 		 361 aa  446  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0844  pectinesterase A  61.11 
 
 		 361 aa  446  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0740  pectinesterase  58.33 
 
 		 865 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2469  Pectinesterase  39.59 
 
 		 746 aa  233  5e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.151342  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0944  ribosomal protein L30  39.82 
 
 		 389 aa  231  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000748406 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0501  pectinesterase  41.31 
 
 		 447 aa  203  5e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  37.29 
 
 		 567 aa  202  6e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0433  Pectinesterase  37.76 
 
 		 457 aa  194  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.825978  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1301  pectinesterase  32.98 
 
 		 345 aa  172  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1246  Pectinesterase  35.07 
 
 		 560 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3820  Pectinesterase  34.72 
 
 		 627 aa  159  6e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1843  Pectate lyase/Amb allergen  34.23 
 
 		 730 aa  156  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0496  Pectinesterase  33.63 
 
 		 686 aa  152  8.999999999999999e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4787  Pectinesterase  32.84 
 
 		 337 aa  147  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.669677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4438  Pectinesterase  32.75 
 
 		 391 aa  147  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0674523  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  34.22 
 
 		 644 aa  146  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1157  Pectinesterase  31.87 
 
 		 322 aa  146  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0447  pectinesterase  32.84 
 
 		 376 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1149  Pectinesterase  31.91 
 
 		 345 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1812  Pectinesterase  33.06 
 
 		 326 aa  135  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3049  Pectinesterase  30.91 
 
 		 326 aa  135  9e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4273  pectinesterase  29.6 
 
 		 571 aa  133  6e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4096  pectinesterase  32.38 
 
 		 338 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.557872  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  33.53 
 
 		 794 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  33.23 
 
 		 487 aa  125  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4663  Pectinesterase  32.94 
 
 		 334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0682309  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4248  pectate lyase  30.46 
 
 		 666 aa  119  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.38518  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1391  Pectinesterase  31.61 
 
 		 347 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161325  hitchhiker  0.00169458 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00373  putative pectinesterase  32.22 
 
 		 393 aa  97.1  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.350288  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0138  putative pectinesterase  30.34 
 
 		 439 aa  96.3  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.356938  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03390  Pectinesterase (EC 3.1.1.11) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B7U0]  27.39 
 
 		 325 aa  91.7  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0409748  normal  0.798545 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04860  pectin methyl esterase (Eurofung)  28.47 
 
 		 389 aa  67  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3447  pectin methylesterase-like  26.49 
 
 		 1081 aa  66.6  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000110016  hitchhiker  0.000230846 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4090  pectinesterase  29.38 
 
 		 469 aa  60.1  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169247  normal  0.786788 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2469  putative pectinesterase  27.8 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.895258  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1259  putative pectinesterase  28.57 
 
 		 427 aa  48.9  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4427  putative pectinesterase  26.92 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.681186  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0850  putative pectinesterase  26.62 
 
 		 427 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0795  putative pectinesterase  25.97 
 
 		 427 aa  47  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0876  putative pectinesterase  25.97 
 
 		 427 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0936  putative pectinesterase  24.54 
 
 		 427 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0913  putative pectinesterase  26.62 
 
 		 427 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0881  putative pectinesterase  26.62 
 
 		 427 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2890  putative pectinesterase  25.97 
 
 		 427 aa  45.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0446001  normal  0.0752938 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00725  predicted pectinesterase  25.97 
 
 		 427 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00760581  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2870  Pectinesterase  25.97 
 
 		 427 aa  45.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0826  putative pectinesterase  25.97 
 
 		 427 aa  45.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0907325  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0799  putative pectinesterase  25.97 
 
 		 427 aa  45.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00700  hypothetical protein  25.97 
 
 		 427 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0117403  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2580  putative pectinesterase  25.97 
 
 		 427 aa  45.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.390355  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4146  putative pectinesterase  24.61 
 
 		 400 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0822  putative pectinesterase  25.97 
 
 		 427 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>