51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C0913 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2870  Pectinesterase  87.12 
 
 		 427 aa  778    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00700  hypothetical protein  86.89 
 
 		 427 aa  777    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0117403  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0876  putative pectinesterase  87.12 
 
 		 427 aa  779    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0881  putative pectinesterase  99.53 
 
 		 427 aa  874    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0822  putative pectinesterase  99.3 
 
 		 427 aa  872    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0936  putative pectinesterase  99.06 
 
 		 427 aa  868    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0913  putative pectinesterase  100 
 
 		 427 aa  877    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0850  putative pectinesterase  99.53 
 
 		 427 aa  874    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2580  putative pectinesterase  87.12 
 
 		 427 aa  778    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.390355  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0795  putative pectinesterase  87.82 
 
 		 427 aa  782    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2890  putative pectinesterase  86.89 
 
 		 427 aa  777    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0446001  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0799  putative pectinesterase  87.12 
 
 		 427 aa  778    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0826  putative pectinesterase  87.12 
 
 		 427 aa  778    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0907325  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00725  predicted pectinesterase  86.89 
 
 		 427 aa  777    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00760581  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1259  putative pectinesterase  80.33 
 
 		 427 aa  725    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2469  putative pectinesterase  47.02 
 
 		 434 aa  378  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.895258  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4146  putative pectinesterase  46.75 
 
 		 400 aa  354  2e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4427  putative pectinesterase  46.75 
 
 		 400 aa  346  4e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.681186  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0138  putative pectinesterase  30.62 
 
 		 439 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.356938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00373  putative pectinesterase  33.33 
 
 		 393 aa  139  7.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.350288  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  29.93 
 
 		 487 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  29.93 
 
 		 794 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0496  Pectinesterase  32.06 
 
 		 686 aa  100  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4663  Pectinesterase  29.37 
 
 		 334 aa  86.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0682309  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1843  Pectate lyase/Amb allergen  28.8 
 
 		 730 aa  84.3  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1391  Pectinesterase  27.46 
 
 		 347 aa  82.8  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161325  hitchhiker  0.00169458 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3820  Pectinesterase  29.02 
 
 		 627 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0447  pectinesterase  25.26 
 
 		 376 aa  69.7  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  26.12 
 
 		 644 aa  69.7  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  27.73 
 
 		 567 aa  64.3  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4096  pectinesterase  25.94 
 
 		 338 aa  61.2  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.557872  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0501  pectinesterase  27.38 
 
 		 447 aa  60.8  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0944  ribosomal protein L30  25.16 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000748406 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4787  Pectinesterase  26.67 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.669677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4273  pectinesterase  25 
 
 		 571 aa  57.4  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1246  Pectinesterase  25.94 
 
 		 560 aa  56.6  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4438  Pectinesterase  25.83 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0674523  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3049  Pectinesterase  24.6 
 
 		 326 aa  55.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1149  Pectinesterase  30.06 
 
 		 345 aa  54.7  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0433  Pectinesterase  26.96 
 
 		 457 aa  53.9  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.825978  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1812  Pectinesterase  25.1 
 
 		 326 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4248  pectate lyase  26.57 
 
 		 666 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.38518  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3047  Pectinesterase  32.41 
 
 		 368 aa  50.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3639  pectinesterase  28.47 
 
 		 361 aa  48.9  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0844  pectinesterase A  28.47 
 
 		 361 aa  48.9  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3511  pectinesterase A  28.47 
 
 		 361 aa  47.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.12966  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0740  pectinesterase  31.78 
 
 		 865 aa  47.8  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1228  Pectinesterase  26.62 
 
 		 368 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1087  Pectinesterase  27.89 
 
 		 366 aa  45.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.925496  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1301  pectinesterase  25 
 
 		 345 aa  44.7  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2469  Pectinesterase  23.72 
 
 		 746 aa  43.9  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.151342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>