57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3047 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3047  Pectinesterase  100 
 
 		 368 aa  761    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1228  Pectinesterase  91.85 
 
 		 368 aa  700    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1087  Pectinesterase  73.1 
 
 		 366 aa  546  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.925496  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2766  Pectinesterase  73.33 
 
 		 366 aa  518  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.422306  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3639  pectinesterase  60 
 
 		 361 aa  438  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0844  pectinesterase A  60 
 
 		 361 aa  438  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3511  pectinesterase A  60 
 
 		 361 aa  437  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.12966  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0740  pectinesterase  58.33 
 
 		 865 aa  392  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0944  ribosomal protein L30  41.52 
 
 		 389 aa  242  7e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000748406 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2469  Pectinesterase  40.05 
 
 		 746 aa  233  6e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.151342  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  37.85 
 
 		 567 aa  210  4e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0433  Pectinesterase  37.95 
 
 		 457 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.825978  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0501  pectinesterase  39.34 
 
 		 447 aa  190  4e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1301  pectinesterase  32.98 
 
 		 345 aa  176  7e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1246  Pectinesterase  35.94 
 
 		 560 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3820  Pectinesterase  34.8 
 
 		 627 aa  162  8.000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1843  Pectate lyase/Amb allergen  34.23 
 
 		 730 aa  157  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4787  Pectinesterase  33.43 
 
 		 337 aa  152  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.669677  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0447  pectinesterase  32.66 
 
 		 376 aa  152  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0496  Pectinesterase  33.93 
 
 		 686 aa  151  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  35.22 
 
 		 644 aa  150  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1157  Pectinesterase  32.44 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4438  Pectinesterase  31.49 
 
 		 391 aa  147  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0674523  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1149  Pectinesterase  32.35 
 
 		 345 aa  145  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3049  Pectinesterase  30.14 
 
 		 326 aa  143  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4273  pectinesterase  31.2 
 
 		 571 aa  141  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1812  Pectinesterase  34.59 
 
 		 326 aa  141  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  33.43 
 
 		 794 aa  129  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  33.13 
 
 		 487 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4663  Pectinesterase  34.32 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0682309  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4096  pectinesterase  32.64 
 
 		 338 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.557872  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4248  pectate lyase  30.56 
 
 		 666 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.38518  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1391  Pectinesterase  32.38 
 
 		 347 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161325  hitchhiker  0.00169458 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00373  putative pectinesterase  31.13 
 
 		 393 aa  101  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.350288  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03390  Pectinesterase (EC 3.1.1.11) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B7U0]  28.13 
 
 		 325 aa  93.6  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0409748  normal  0.798545 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0138  putative pectinesterase  30.34 
 
 		 439 aa  92  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.356938  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04860  pectin methyl esterase (Eurofung)  26.23 
 
 		 389 aa  68.9  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2469  putative pectinesterase  28.76 
 
 		 434 aa  65.5  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.895258  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3447  pectin methylesterase-like  27.04 
 
 		 1081 aa  64.7  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000110016  hitchhiker  0.000230846 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4090  pectinesterase  30.05 
 
 		 469 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169247  normal  0.786788 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4427  putative pectinesterase  27.67 
 
 		 400 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.681186  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1259  putative pectinesterase  31.62 
 
 		 427 aa  54.7  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0850  putative pectinesterase  32.41 
 
 		 427 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4146  putative pectinesterase  26.38 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0881  putative pectinesterase  32.41 
 
 		 427 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0795  putative pectinesterase  31.48 
 
 		 427 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0913  putative pectinesterase  32.41 
 
 		 427 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0936  putative pectinesterase  32.41 
 
 		 427 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0876  putative pectinesterase  31.48 
 
 		 427 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2890  putative pectinesterase  31.48 
 
 		 427 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0446001  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0799  putative pectinesterase  31.48 
 
 		 427 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0826  putative pectinesterase  31.48 
 
 		 427 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0907325  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2580  putative pectinesterase  31.48 
 
 		 427 aa  50.4  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.390355  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2870  Pectinesterase  31.48 
 
 		 427 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00725  predicted pectinesterase  31.48 
 
 		 427 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00760581  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00700  hypothetical protein  31.48 
 
 		 427 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0117403  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0822  putative pectinesterase  31.48 
 
 		 427 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>