57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1391 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1391  Pectinesterase  100 
 
 		 347 aa  689    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161325  hitchhiker  0.00169458 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1843  Pectate lyase/Amb allergen  55.24 
 
 		 730 aa  314  9.999999999999999e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0447  pectinesterase  50.76 
 
 		 376 aa  300  2e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0496  Pectinesterase  50.47 
 
 		 686 aa  300  2e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3820  Pectinesterase  50.63 
 
 		 627 aa  280  2e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1246  Pectinesterase  43.34 
 
 		 560 aa  264  2e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4663  Pectinesterase  44.69 
 
 		 334 aa  239  5e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0682309  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  40.84 
 
 		 567 aa  237  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3049  Pectinesterase  42.61 
 
 		 326 aa  228  1e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  44.18 
 
 		 794 aa  223  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  44.75 
 
 		 487 aa  218  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0501  pectinesterase  37.76 
 
 		 447 aa  207  2e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4438  Pectinesterase  39.26 
 
 		 391 aa  200  3.9999999999999996e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0674523  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0433  Pectinesterase  40.33 
 
 		 457 aa  194  3e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.825978  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1301  pectinesterase  33.24 
 
 		 345 aa  190  4e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1157  Pectinesterase  36.39 
 
 		 322 aa  189  4e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1149  Pectinesterase  36.56 
 
 		 345 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4248  pectate lyase  34.77 
 
 		 666 aa  176  4e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.38518  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1812  Pectinesterase  36.04 
 
 		 326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0138  putative pectinesterase  34.91 
 
 		 439 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.356938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  33.8 
 
 		 644 aa  172  7.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4787  Pectinesterase  31.38 
 
 		 337 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.669677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4096  pectinesterase  30.97 
 
 		 338 aa  154  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.557872  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4273  pectinesterase  38.12 
 
 		 571 aa  152  5.9999999999999996e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00373  putative pectinesterase  36.59 
 
 		 393 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.350288  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2766  Pectinesterase  32.34 
 
 		 366 aa  139  7.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.422306  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2469  Pectinesterase  33.8 
 
 		 746 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.151342  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1087  Pectinesterase  32.87 
 
 		 366 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.925496  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3047  Pectinesterase  32.38 
 
 		 368 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1228  Pectinesterase  31.61 
 
 		 368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2469  putative pectinesterase  35.34 
 
 		 434 aa  129  8.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.895258  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4146  putative pectinesterase  35.85 
 
 		 400 aa  123  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3511  pectinesterase A  33.23 
 
 		 361 aa  120  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.12966  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3639  pectinesterase  33.23 
 
 		 361 aa  120  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0844  pectinesterase A  33.23 
 
 		 361 aa  120  4.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4427  putative pectinesterase  33.22 
 
 		 400 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.681186  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0740  pectinesterase  28.28 
 
 		 865 aa  115  7.999999999999999e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03390  Pectinesterase (EC 3.1.1.11) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B7U0]  31.46 
 
 		 325 aa  100  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0409748  normal  0.798545 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0881  putative pectinesterase  28.61 
 
 		 427 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0795  putative pectinesterase  29.74 
 
 		 427 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0876  putative pectinesterase  29.45 
 
 		 427 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1259  putative pectinesterase  28.78 
 
 		 427 aa  90.9  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2580  putative pectinesterase  29.74 
 
 		 427 aa  90.5  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.390355  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0799  putative pectinesterase  29.74 
 
 		 427 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0826  putative pectinesterase  29.74 
 
 		 427 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0907325  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2870  Pectinesterase  29.74 
 
 		 427 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2890  putative pectinesterase  29.74 
 
 		 427 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0446001  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00700  hypothetical protein  29.74 
 
 		 427 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0117403  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00725  predicted pectinesterase  29.74 
 
 		 427 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00760581  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0936  putative pectinesterase  27.75 
 
 		 427 aa  89.7  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0850  putative pectinesterase  28.32 
 
 		 427 aa  89.7  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0913  putative pectinesterase  28.32 
 
 		 427 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0822  putative pectinesterase  28.03 
 
 		 427 aa  86.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0944  ribosomal protein L30  28.77 
 
 		 389 aa  82.8  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000748406 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3447  pectin methylesterase-like  23.85 
 
 		 1081 aa  64.7  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000110016  hitchhiker  0.000230846 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4090  pectinesterase  29.41 
 
 		 469 aa  54.7  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169247  normal  0.786788 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04860  pectin methyl esterase (Eurofung)  25.07 
 
 		 389 aa  47.8  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>