53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4427 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4427  putative pectinesterase  100 
 
 
400 aa  828    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.681186  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4146  putative pectinesterase  85.71 
 
 
400 aa  719    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2469  putative pectinesterase  69.57 
 
 
434 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.895258  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0876  putative pectinesterase  47.25 
 
 
427 aa  350  4e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0936  putative pectinesterase  47 
 
 
427 aa  349  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0795  putative pectinesterase  47 
 
 
427 aa  348  1e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1259  putative pectinesterase  46.23 
 
 
427 aa  346  4e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0913  putative pectinesterase  46.75 
 
 
427 aa  346  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00725  predicted pectinesterase  47 
 
 
427 aa  345  7e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00760581  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00700  hypothetical protein  47 
 
 
427 aa  345  7e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0117403  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2890  putative pectinesterase  47 
 
 
427 aa  345  7e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0446001  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0850  putative pectinesterase  46.75 
 
 
427 aa  345  8e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0799  putative pectinesterase  47 
 
 
427 aa  345  8.999999999999999e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0826  putative pectinesterase  47 
 
 
427 aa  345  8.999999999999999e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0907325  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2870  Pectinesterase  47 
 
 
427 aa  345  8.999999999999999e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2580  putative pectinesterase  47 
 
 
427 aa  345  8.999999999999999e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.390355  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0881  putative pectinesterase  46.5 
 
 
427 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0822  putative pectinesterase  46.5 
 
 
427 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0138  putative pectinesterase  34.52 
 
 
439 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.356938  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00373  putative pectinesterase  34 
 
 
393 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.350288  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  32.13 
 
 
794 aa  119  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  32.13 
 
 
487 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1391  Pectinesterase  31.82 
 
 
347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161325  hitchhiker  0.00169458 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0496  Pectinesterase  30.19 
 
 
686 aa  102  9e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3820  Pectinesterase  27.68 
 
 
627 aa  99  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0447  pectinesterase  29.9 
 
 
376 aa  97.1  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361706  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1149  Pectinesterase  27.51 
 
 
345 aa  90.5  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862833  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1843  Pectate lyase/Amb allergen  28.52 
 
 
730 aa  90.5  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  29.01 
 
 
644 aa  88.6  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1812  Pectinesterase  29.59 
 
 
326 aa  84.3  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4663  Pectinesterase  26.97 
 
 
334 aa  84.7  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0682309  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4273  pectinesterase  30.58 
 
 
571 aa  81.6  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4096  pectinesterase  26.46 
 
 
338 aa  79.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.557872  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3049  Pectinesterase  26.58 
 
 
326 aa  77.4  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4787  Pectinesterase  26.72 
 
 
337 aa  76.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.669677  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4248  pectate lyase  28.03 
 
 
666 aa  74.3  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.38518  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4438  Pectinesterase  33.14 
 
 
391 aa  72.8  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0674523  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1246  Pectinesterase  25.6 
 
 
560 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  29.31 
 
 
567 aa  70.1  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1157  Pectinesterase  27.51 
 
 
322 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0433  Pectinesterase  27.5 
 
 
457 aa  67  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.825978  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3511  pectinesterase A  29.21 
 
 
361 aa  67  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.12966  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0501  pectinesterase  31.13 
 
 
447 aa  66.2  0.0000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3639  pectinesterase  29.21 
 
 
361 aa  65.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0844  pectinesterase A  29.21 
 
 
361 aa  65.5  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1301  pectinesterase  28.02 
 
 
345 aa  63.2  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03390  Pectinesterase (EC 3.1.1.11) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B7U0]  31.29 
 
 
325 aa  58.9  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0409748  normal  0.798545 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3047  Pectinesterase  27.67 
 
 
368 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2469  Pectinesterase  25.96 
 
 
746 aa  52.4  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.151342  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0944  ribosomal protein L30  23.93 
 
 
389 aa  51.6  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000748406 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1087  Pectinesterase  26.67 
 
 
366 aa  51.2  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.925496  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1228  Pectinesterase  26.92 
 
 
368 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2766  Pectinesterase  26.19 
 
 
366 aa  47.4  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.422306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>