60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1812 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1812  Pectinesterase  100 
 
 
326 aa  681    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1149  Pectinesterase  58.26 
 
 
345 aa  379  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862833  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4787  Pectinesterase  55.08 
 
 
337 aa  361  1e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.669677  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  52.96 
 
 
644 aa  338  5.9999999999999996e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4096  pectinesterase  51.65 
 
 
338 aa  320  3e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.557872  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1157  Pectinesterase  48 
 
 
322 aa  295  5e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3049  Pectinesterase  48.49 
 
 
326 aa  295  7e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4248  pectate lyase  47.99 
 
 
666 aa  295  7e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.38518  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4438  Pectinesterase  43.85 
 
 
391 aa  266  2.9999999999999995e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0674523  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4273  pectinesterase  42.05 
 
 
571 aa  238  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1301  pectinesterase  39.77 
 
 
345 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  40 
 
 
567 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1246  Pectinesterase  37.09 
 
 
560 aa  189  5e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  37.31 
 
 
794 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1391  Pectinesterase  35.54 
 
 
347 aa  163  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161325  hitchhiker  0.00169458 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  37.78 
 
 
487 aa  163  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0447  pectinesterase  34.49 
 
 
376 aa  155  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361706  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0496  Pectinesterase  32.73 
 
 
686 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0501  pectinesterase  36.88 
 
 
447 aa  150  3e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0138  putative pectinesterase  35.53 
 
 
439 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.356938  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0844  pectinesterase A  35.28 
 
 
361 aa  145  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3639  pectinesterase  35.28 
 
 
361 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3511  pectinesterase A  34.99 
 
 
361 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.12966  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3047  Pectinesterase  34.59 
 
 
368 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03390  Pectinesterase (EC 3.1.1.11) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B7U0]  35.29 
 
 
325 aa  140  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0409748  normal  0.798545 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0433  Pectinesterase  35.55 
 
 
457 aa  139  8.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.825978  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2469  Pectinesterase  32.05 
 
 
746 aa  138  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.151342  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4663  Pectinesterase  34.06 
 
 
334 aa  136  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0682309  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3820  Pectinesterase  33.78 
 
 
627 aa  136  5e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1228  Pectinesterase  33.06 
 
 
368 aa  135  7.000000000000001e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1087  Pectinesterase  33.04 
 
 
366 aa  135  8e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.925496  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1843  Pectate lyase/Amb allergen  35.43 
 
 
730 aa  132  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2766  Pectinesterase  32.94 
 
 
366 aa  125  8.000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.422306  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0740  pectinesterase  28.45 
 
 
865 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2469  putative pectinesterase  30.89 
 
 
434 aa  95.1  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.895258  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00373  putative pectinesterase  29.69 
 
 
393 aa  88.2  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.350288  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4427  putative pectinesterase  29.59 
 
 
400 aa  84.3  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.681186  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4146  putative pectinesterase  28.52 
 
 
400 aa  82  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0944  ribosomal protein L30  28.22 
 
 
389 aa  73.2  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000748406 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1259  putative pectinesterase  26.27 
 
 
427 aa  64.3  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3447  pectin methylesterase-like  29.96 
 
 
1081 aa  63.9  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000110016  hitchhiker  0.000230846 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00700  hypothetical protein  27.15 
 
 
427 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0117403  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2890  putative pectinesterase  27.15 
 
 
427 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0446001  normal  0.0752938 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00725  predicted pectinesterase  27.15 
 
 
427 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00760581  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0795  putative pectinesterase  27.49 
 
 
427 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4090  pectinesterase  30.28 
 
 
469 aa  60.1  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169247  normal  0.786788 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04860  pectin methyl esterase (Eurofung)  28.07 
 
 
389 aa  59.7  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0876  putative pectinesterase  27.15 
 
 
427 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2580  putative pectinesterase  27.15 
 
 
427 aa  59.7  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.390355  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0799  putative pectinesterase  27.15 
 
 
427 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0826  putative pectinesterase  27.15 
 
 
427 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0907325  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2870  Pectinesterase  27.15 
 
 
427 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0881  putative pectinesterase  25.49 
 
 
427 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0822  putative pectinesterase  25.1 
 
 
427 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0850  putative pectinesterase  25.1 
 
 
427 aa  52.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0936  putative pectinesterase  25.1 
 
 
427 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0913  putative pectinesterase  25.1 
 
 
427 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3630  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  26.74 
 
 
500 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0434  Serine/threonine protein kinase  23.76 
 
 
674 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000341904  normal  0.409693 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07966  conserved hypothetical protein  35.29 
 
 
209 aa  44.3  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.488758  normal  0.390044 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>