68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4248 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4248  pectate lyase  100 
 
 		 666 aa  1371    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.38518  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3049  Pectinesterase  46.53 
 
 		 326 aa  301  2e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3779  pectate lyase  42.73 
 
 		 350 aa  297  5e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  50.16 
 
 		 644 aa  296  7e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1812  Pectinesterase  47.99 
 
 		 326 aa  295  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1157  Pectinesterase  47.71 
 
 		 322 aa  291  3e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1149  Pectinesterase  45.37 
 
 		 345 aa  291  4e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4438  Pectinesterase  45.21 
 
 		 391 aa  285  2.0000000000000002e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0674523  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4116  pectate lyase  41.74 
 
 		 396 aa  278  3e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4787  Pectinesterase  44.52 
 
 		 337 aa  267  5e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.669677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4096  pectinesterase  45.93 
 
 		 338 aa  260  6e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.557872  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1159  pectate lyase  41.72 
 
 		 354 aa  252  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1245  pectate lyase  38.42 
 
 		 552 aa  248  2e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4273  pectinesterase  42.51 
 
 		 571 aa  248  3e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1301  pectinesterase  41.03 
 
 		 345 aa  245  1.9999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0380  pectate lyase  35.15 
 
 		 416 aa  229  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  42.05 
 
 		 567 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1051  Serine O-acetyltransferase  36.89 
 
 		 700 aa  202  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1246  Pectinesterase  36.12 
 
 		 560 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1391  Pectinesterase  35.02 
 
 		 347 aa  172  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161325  hitchhiker  0.00169458 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1434  pectate lyase  30.86 
 
 		 460 aa  171  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2947  hypothetical protein  31.58 
 
 		 574 aa  147  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00368039  normal  0.813372 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0433  Pectinesterase  36.03 
 
 		 457 aa  146  9e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.825978  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0496  Pectinesterase  33.54 
 
 		 686 aa  145  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  32.08 
 
 		 794 aa  142  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  32.08 
 
 		 487 aa  142  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3820  Pectinesterase  33.21 
 
 		 627 aa  140  7.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1843  Pectate lyase/Amb allergen  31.72 
 
 		 730 aa  139  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0501  pectinesterase  35.27 
 
 		 447 aa  137  8e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1087  Pectinesterase  34.19 
 
 		 366 aa  136  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.925496  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0447  pectinesterase  28.66 
 
 		 376 aa  135  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2469  Pectinesterase  30.07 
 
 		 746 aa  130  8.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.151342  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03390  Pectinesterase (EC 3.1.1.11) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B7U0]  30.92 
 
 		 325 aa  129  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0409748  normal  0.798545 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2766  Pectinesterase  33.54 
 
 		 366 aa  125  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.422306  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0138  putative pectinesterase  31.73 
 
 		 439 aa  123  9e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.356938  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3047  Pectinesterase  30.56 
 
 		 368 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1228  Pectinesterase  30.46 
 
 		 368 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4663  Pectinesterase  30.8 
 
 		 334 aa  110  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0682309  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3639  pectinesterase  30.7 
 
 		 361 aa  109  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0844  pectinesterase A  30.7 
 
 		 361 aa  109  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3511  pectinesterase A  30.7 
 
 		 361 aa  108  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.12966  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0740  pectinesterase  29.61 
 
 		 865 aa  105  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3447  pectin methylesterase-like  32.06 
 
 		 1081 aa  95.9  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000110016  hitchhiker  0.000230846 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00373  putative pectinesterase  29.17 
 
 		 393 aa  88.6  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.350288  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2469  putative pectinesterase  28.41 
 
 		 434 aa  84.7  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.895258  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1698  hypothetical protein  24 
 
 		 547 aa  81.3  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.498115  normal  0.0888224 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4146  putative pectinesterase  29.94 
 
 		 400 aa  80.5  0.00000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4427  putative pectinesterase  28.03 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.681186  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1353  secreted pectate lyase-family protein  23.94 
 
 		 603 aa  71.2  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.633554  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0944  ribosomal protein L30  26.59 
 
 		 389 aa  70.9  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000748406 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04860  pectin methyl esterase (Eurofung)  25.55 
 
 		 389 aa  68.9  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4090  pectinesterase  29.22 
 
 		 469 aa  67.4  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169247  normal  0.786788 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1259  putative pectinesterase  27.27 
 
 		 427 aa  55.8  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0795  putative pectinesterase  27.27 
 
 		 427 aa  55.1  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0876  putative pectinesterase  27.27 
 
 		 427 aa  54.7  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0850  putative pectinesterase  26.57 
 
 		 427 aa  53.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2580  putative pectinesterase  27.27 
 
 		 427 aa  53.1  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.390355  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0881  putative pectinesterase  26.57 
 
 		 427 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2890  putative pectinesterase  27.27 
 
 		 427 aa  53.1  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0446001  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0799  putative pectinesterase  27.27 
 
 		 427 aa  53.1  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0826  putative pectinesterase  27.27 
 
 		 427 aa  53.1  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0907325  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00700  hypothetical protein  27.27 
 
 		 427 aa  53.1  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0117403  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2870  Pectinesterase  27.27 
 
 		 427 aa  53.1  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00725  predicted pectinesterase  27.27 
 
 		 427 aa  53.1  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00760581  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0936  putative pectinesterase  26.57 
 
 		 427 aa  52.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0913  putative pectinesterase  26.57 
 
 		 427 aa  52.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0822  putative pectinesterase  26.57 
 
 		 427 aa  51.2  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07966  conserved hypothetical protein  40.85 
 
 		 209 aa  51.6  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.488758  normal  0.390044 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>