64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4663 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4663  Pectinesterase  100 
 
 		 334 aa  669    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0682309  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1843  Pectate lyase/Amb allergen  45.16 
 
 		 730 aa  245  9e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1391  Pectinesterase  43.77 
 
 		 347 aa  236  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161325  hitchhiker  0.00169458 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0496  Pectinesterase  44.55 
 
 		 686 aa  230  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3820  Pectinesterase  39.22 
 
 		 627 aa  216  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  44.03 
 
 		 487 aa  216  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  44.03 
 
 		 794 aa  216  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0447  pectinesterase  34.66 
 
 		 376 aa  181  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1246  Pectinesterase  38.22 
 
 		 560 aa  168  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  34.25 
 
 		 567 aa  152  5e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1149  Pectinesterase  33.85 
 
 		 345 aa  136  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1812  Pectinesterase  34.06 
 
 		 326 aa  136  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0138  putative pectinesterase  34.29 
 
 		 439 aa  136  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.356938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4438  Pectinesterase  31.65 
 
 		 391 aa  135  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0674523  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3047  Pectinesterase  33.97 
 
 		 368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3049  Pectinesterase  31.13 
 
 		 326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00373  putative pectinesterase  36.31 
 
 		 393 aa  129  9.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.350288  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1087  Pectinesterase  32.89 
 
 		 366 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.925496  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4787  Pectinesterase  32.46 
 
 		 337 aa  126  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.669677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2766  Pectinesterase  31.86 
 
 		 366 aa  125  8.000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.422306  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1228  Pectinesterase  32.7 
 
 		 368 aa  125  9e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  32.92 
 
 		 644 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1157  Pectinesterase  30.97 
 
 		 322 aa  122  9e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1301  pectinesterase  29.68 
 
 		 345 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4096  pectinesterase  31.49 
 
 		 338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.557872  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3511  pectinesterase A  31.36 
 
 		 361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.12966  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0844  pectinesterase A  31.36 
 
 		 361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3639  pectinesterase  31.36 
 
 		 361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0501  pectinesterase  30.18 
 
 		 447 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4273  pectinesterase  30.42 
 
 		 571 aa  114  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4248  pectate lyase  30 
 
 		 666 aa  112  8.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.38518  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0740  pectinesterase  30.32 
 
 		 865 aa  110  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2469  Pectinesterase  29.38 
 
 		 746 aa  106  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.151342  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2469  putative pectinesterase  29.49 
 
 		 434 aa  103  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.895258  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0433  Pectinesterase  30.82 
 
 		 457 aa  104  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.825978  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1259  putative pectinesterase  29.11 
 
 		 427 aa  93.2  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0850  putative pectinesterase  28.98 
 
 		 427 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0795  putative pectinesterase  29.6 
 
 		 427 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4146  putative pectinesterase  27.41 
 
 		 400 aa  90.1  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03390  Pectinesterase (EC 3.1.1.11) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B7U0]  32.07 
 
 		 325 aa  90.5  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0409748  normal  0.798545 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0913  putative pectinesterase  28.98 
 
 		 427 aa  89.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0822  putative pectinesterase  28.98 
 
 		 427 aa  89.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0936  putative pectinesterase  28.98 
 
 		 427 aa  89.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0876  putative pectinesterase  29.6 
 
 		 427 aa  89.4  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2890  putative pectinesterase  29.72 
 
 		 427 aa  89  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0446001  normal  0.0752938 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00725  predicted pectinesterase  29.72 
 
 		 427 aa  89  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00760581  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00700  hypothetical protein  29.72 
 
 		 427 aa  89  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0117403  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2580  putative pectinesterase  29.72 
 
 		 427 aa  88.2  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.390355  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0799  putative pectinesterase  29.72 
 
 		 427 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0826  putative pectinesterase  29.72 
 
 		 427 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0907325  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2870  Pectinesterase  29.72 
 
 		 427 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0881  putative pectinesterase  28.66 
 
 		 427 aa  86.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0944  ribosomal protein L30  32.17 
 
 		 389 aa  86.3  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000748406 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4427  putative pectinesterase  26.97 
 
 		 400 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.681186  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3447  pectin methylesterase-like  25.8 
 
 		 1081 aa  51.2  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000110016  hitchhiker  0.000230846 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4090  pectinesterase  26.32 
 
 		 469 aa  48.9  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169247  normal  0.786788 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0067  cell surface protein  38.36 
 
 		 302 aa  48.5  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04860  pectin methyl esterase (Eurofung)  28.57 
 
 		 389 aa  47.8  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3372  cell surface protein  31.76 
 
 		 352 aa  47.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00468301  hitchhiker  0.00958354 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  32.91 
 
 		 871 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1001 aa  43.9  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  26.24 
 
 		 810 aa  43.1  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1478  histidinol dehydrogenase  24.89 
 
 		 431 aa  43.1  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  30.95 
 
 		 375 aa  43.1  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.195558 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>