138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1246 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1246  Pectinesterase  100 
 
 		 560 aa  1139    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  50 
 
 		 567 aa  524  1e-147  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1245  pectate lyase  60.81 
 
 		 552 aa  268  2e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1391  Pectinesterase  43.34 
 
 		 347 aa  251  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161325  hitchhiker  0.00169458 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4438  Pectinesterase  41.34 
 
 		 391 aa  249  8e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0674523  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0417  cellulosome protein dockerin type I  56.56 
 
 		 848 aa  239  6.999999999999999e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000135998  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0496  Pectinesterase  42.99 
 
 		 686 aa  234  3e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3049  Pectinesterase  38.49 
 
 		 326 aa  233  6e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0501  pectinesterase  42.98 
 
 		 447 aa  232  1e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0433  Pectinesterase  47.62 
 
 		 457 aa  228  2e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.825978  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1157  Pectinesterase  44.3 
 
 		 322 aa  226  6e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  42.95 
 
 		 794 aa  220  7e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  42.95 
 
 		 487 aa  219  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3820  Pectinesterase  40.56 
 
 		 627 aa  211  4e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1843  Pectate lyase/Amb allergen  39.32 
 
 		 730 aa  210  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1149  Pectinesterase  40.06 
 
 		 345 aa  210  7e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1301  pectinesterase  36.97 
 
 		 345 aa  200  6e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  38.08 
 
 		 644 aa  196  8.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0447  pectinesterase  37.65 
 
 		 376 aa  196  8.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4787  Pectinesterase  36.55 
 
 		 337 aa  196  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.669677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1812  Pectinesterase  37.09 
 
 		 326 aa  189  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2469  Pectinesterase  33.13 
 
 		 746 aa  187  6e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.151342  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4273  pectinesterase  36.53 
 
 		 571 aa  184  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4248  pectate lyase  36.12 
 
 		 666 aa  177  7e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.38518  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2766  Pectinesterase  38.32 
 
 		 366 aa  171  4e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.422306  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1087  Pectinesterase  35.36 
 
 		 366 aa  168  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.925496  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4663  Pectinesterase  38.22 
 
 		 334 aa  167  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0682309  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3047  Pectinesterase  35.94 
 
 		 368 aa  167  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1228  Pectinesterase  35.07 
 
 		 368 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4096  pectinesterase  40.78 
 
 		 338 aa  161  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.557872  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0844  pectinesterase A  32.74 
 
 		 361 aa  152  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3639  pectinesterase  32.74 
 
 		 361 aa  152  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3511  pectinesterase A  32.74 
 
 		 361 aa  150  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.12966  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0740  pectinesterase  32.78 
 
 		 865 aa  144  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03390  Pectinesterase (EC 3.1.1.11) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B7U0]  36.51 
 
 		 325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0409748  normal  0.798545 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0138  putative pectinesterase  35.38 
 
 		 439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.356938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00373  putative pectinesterase  35.19 
 
 		 393 aa  125  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.350288  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0944  ribosomal protein L30  30.8 
 
 		 389 aa  103  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000748406 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7222  hypothetical protein  33.33 
 
 		 839 aa  83.6  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2469  putative pectinesterase  27.41 
 
 		 434 aa  82.4  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.895258  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3447  pectin methylesterase-like  28.15 
 
 		 1081 aa  80.5  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000110016  hitchhiker  0.000230846 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4146  putative pectinesterase  28.03 
 
 		 400 aa  78.6  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04860  pectin methyl esterase (Eurofung)  27.91 
 
 		 389 aa  72.8  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4427  putative pectinesterase  25.6 
 
 		 400 aa  72.4  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.681186  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4090  pectinesterase  30.53 
 
 		 469 aa  71.6  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169247  normal  0.786788 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1259  putative pectinesterase  25.38 
 
 		 427 aa  69.3  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  40 
 
 		 646 aa  66.6  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  46.15 
 
 		 732 aa  63.9  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1207  cellulosome protein dockerin type I  32.5 
 
 		 873 aa  62  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  44.74 
 
 		 951 aa  61.6  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0936  putative pectinesterase  26.36 
 
 		 427 aa  60.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  46.55 
 
 		 949 aa  60.5  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  30.83 
 
 		 1171 aa  58.9  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0795  putative pectinesterase  24.78 
 
 		 427 aa  59.3  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0881  putative pectinesterase  23.55 
 
 		 427 aa  59.3  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0850  putative pectinesterase  25.94 
 
 		 427 aa  58.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0750  glycoside hydrolase family 11  47.37 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0876  putative pectinesterase  23.92 
 
 		 427 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  47.54 
 
 		 532 aa  57.8  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0913  putative pectinesterase  25.94 
 
 		 427 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  49.12 
 
 		 477 aa  56.6  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  45.76 
 
 		 683 aa  55.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0822  putative pectinesterase  25.94 
 
 		 427 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0735  glycoside hydrolase family 9  48.28 
 
 		 757 aa  56.2  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15204  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  43.33 
 
 		 554 aa  55.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  49.15 
 
 		 482 aa  55.5  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2870  Pectinesterase  24.5 
 
 		 427 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0826  putative pectinesterase  24.5 
 
 		 427 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0907325  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0799  putative pectinesterase  24.5 
 
 		 427 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2580  putative pectinesterase  24.5 
 
 		 427 aa  54.7  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.390355  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0286  polysaccharide deacetylase  40 
 
 		 308 aa  55.1  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.350747  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  44.26 
 
 		 524 aa  55.1  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0729  glycoside hydrolase family 48  44.29 
 
 		 722 aa  54.7  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000900741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  39.51 
 
 		 490 aa  54.3  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  44.44 
 
 		 961 aa  54.3  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00725  predicted pectinesterase  24.55 
 
 		 427 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00760581  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2890  putative pectinesterase  24.55 
 
 		 427 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0446001  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0920  cellulosome protein dockerin type I  41.38 
 
 		 391 aa  53.9  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00700  hypothetical protein  24.55 
 
 		 427 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0117403  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2621  glycoside hydrolase family 9 domain protein Ig domain protein  43.55 
 
 		 833 aa  53.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2123  glycosyl hydrolase 53 domain protein  46.77 
 
 		 425 aa  53.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.052262  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  34.57 
 
 		 948 aa  52.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2017  lipolytic protein G-D-S-L family  42.11 
 
 		 303 aa  52.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2392  glycoside hydrolase family 9  44.83 
 
 		 874 aa  52.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00520307  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1101  Spore coat protein CotH  46.43 
 
 		 621 aa  51.6  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2395  lipolytic protein G-D-S-L family  42.62 
 
 		 311 aa  51.6  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00016801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  37.5 
 
 		 423 aa  51.2  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  44.26 
 
 		 509 aa  51.2  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  37.5 
 
 		 928 aa  50.8  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2243  Pectate lyase/Amb allergen  44.83 
 
 		 462 aa  49.7  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0247929  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  38.89 
 
 		 965 aa  50.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0429  PKD domain containing protein  40.58 
 
 		 861 aa  49.7  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  46.55 
 
 		 885 aa  50.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0734  glycoside hydrolase family 9  46.55 
 
 		 737 aa  50.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0740  glycoside hydrolase family 5  36.67 
 
 		 534 aa  49.7  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.209978  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1809  cellulosome protein dockerin type I  40.68 
 
 		 316 aa  49.3  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.320363  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1400  glycosyl hydrolase 53  38.75 
 
 		 415 aa  49.3  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195161  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  45.9 
 
 		 725 aa  49.3  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0736  cellulosome protein dockerin type I  38.33 
 
 		 424 aa  48.5  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00031925  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  43.1 
 
 		 536 aa  48.5  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>