34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7222 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7222  hypothetical protein  100 
 
 		 839 aa  1696    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6626  parallel beta-helix repeat protein  39.44 
 
 		 1011 aa  334  3e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442384  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  32.83 
 
 		 801 aa  264  4.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0539  hypothetical protein  32.99 
 
 		 648 aa  252  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.280042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6726  hypothetical protein  32.02 
 
 		 580 aa  221  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5089  Parallel beta-helix repeat protein  31.38 
 
 		 791 aa  205  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.46946 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  27.57 
 
 		 951 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2405  hypothetical protein  28.05 
 
 		 722 aa  199  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.55716  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  27.32 
 
 		 965 aa  198  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5426  hypothetical protein  33.18 
 
 		 563 aa  197  8.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5098  hypothetical protein  30.52 
 
 		 788 aa  196  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.381891 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4114  hypothetical protein  25.66 
 
 		 832 aa  193  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0478518  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2736  hypothetical protein  27.82 
 
 		 627 aa  189  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00161414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2776  hypothetical protein  27.61 
 
 		 838 aa  181  7e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4874  Ricin B lectin  35.07 
 
 		 1049 aa  156  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524665  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  23.9 
 
 		 2286 aa  134  6e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  43.14 
 
 		 567 aa  99.4  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0417  cellulosome protein dockerin type I  41.03 
 
 		 848 aa  98.6  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000135998  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1246  Pectinesterase  35.38 
 
 		 560 aa  97.4  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4475  hypothetical protein  26.45 
 
 		 1121 aa  94  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161774 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1245  pectate lyase  41.55 
 
 		 552 aa  91.3  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1130  PDZ/DHR/GLGF domain protein  24.69 
 
 		 789 aa  86.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453504  normal  0.447933 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6231  hypothetical protein  23.06 
 
 		 709 aa  71.2  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126959 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2668  hypothetical protein  23.13 
 
 		 677 aa  65.1  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6426  hypothetical protein  21.92 
 
 		 708 aa  63.9  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1237  hypothetical protein  32.14 
 
 		 689 aa  51.6  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.157954 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0468  protein of unknown function DUF1565  33.04 
 
 		 653 aa  50.4  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.672167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  33.61 
 
 		 1171 aa  49.3  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  20.64 
 
 		 1024 aa  47.8  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2913  hypothetical protein  26.51 
 
 		 752 aa  47.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.706776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4027  parallel beta-helix repeat-containing protein  22.22 
 
 		 644 aa  47.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.644383  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1931  Pectate lyase  31.53 
 
 		 458 aa  45.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.24321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0233  putative outer membrane protein  28.97 
 
 		 638 aa  45.1  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.317467  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2936  hypothetical protein  25.26 
 
 		 1022 aa  44.7  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.897534 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>