More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0429 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0429  PKD domain containing protein  100 
 
 		 861 aa  1763    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  59.18 
 
 		 1601 aa  998    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1859  glycoside hydrolase family 5  55.2 
 
 		 1294 aa  597  1e-169  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0097  beta-mannanase/endoglucanase A  54.32 
 
 		 563 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0700472  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4304  hypothetical protein  46.86 
 
 		 920 aa  500  1e-140  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3062  hypothetical protein  28.75 
 
 		 711 aa  196  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0227805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1503  hypothetical protein  27.04 
 
 		 761 aa  138  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4317  hypothetical protein  22.54 
 
 		 620 aa  89.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0690853 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  40.4 
 
 		 816 aa  85.5  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2017  lipolytic protein G-D-S-L family  52.86 
 
 		 303 aa  82.8  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1570  hypothetical protein  21.77 
 
 		 632 aa  82  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475185  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  40.19 
 
 		 1150 aa  81.3  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1015  PKD domain containing protein  39.66 
 
 		 943 aa  80.9  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2844  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.96 
 
 		 639 aa  80.1  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0124345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  42.86 
 
 		 1057 aa  79  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  40.4 
 
 		 623 aa  79.3  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  44.44 
 
 		 1565 aa  77.8  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0223  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  50 
 
 		 596 aa  76.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1255  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  46.07 
 
 		 601 aa  76.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2162  lipolytic protein G-D-S-L family  45.24 
 
 		 436 aa  75.5  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1060  cellulosome protein dockerin type I  47.06 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  46.48 
 
 		 412 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  30.95 
 
 		 532 aa  73.2  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3229  collagenase  44.71 
 
 		 971 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  43.48 
 
 		 712 aa  71.2  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  43.02 
 
 		 1916 aa  71.2  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  40.22 
 
 		 734 aa  71.2  0.00000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  43.68 
 
 		 2066 aa  70.1  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1099  glycoside hydrolase family 5  39.05 
 
 		 475 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1890  cellulosome enzyme, dockerin type I  31.28 
 
 		 710 aa  70.1  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  33.81 
 
 		 677 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  44.74 
 
 		 884 aa  68.9  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0115  lysyl endopeptidase  41.3 
 
 		 823 aa  68.2  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.585546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  40.23 
 
 		 792 aa  68.2  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3165  Ricin B lectin  29.59 
 
 		 2031 aa  67.8  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144153 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  32.09 
 
 		 955 aa  67  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003663  microbial collagenase secreted  34.02 
 
 		 814 aa  66.6  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  41.86 
 
 		 873 aa  66.6  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05515  zinc metalloprotease  37 
 
 		 780 aa  66.2  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1644  PKD domain containing protein  38.1 
 
 		 820 aa  65.9  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0428  peptidase M4, thermolysin  42.35 
 
 		 775 aa  65.9  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0573  PKD domain containing protein  40 
 
 		 1084 aa  65.5  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.179888  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.53 
 
 		 940 aa  65.1  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3429  MAM protein  39.8 
 
 		 1027 aa  64.3  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0162  collagenase  38.37 
 
 		 1104 aa  64.3  0.000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2209  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.19 
 
 		 1158 aa  63.9  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00262816  normal  0.214533 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3874  peptidase M4 thermolysin  42.35 
 
 		 778 aa  63.9  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0439  peptidase M4 thermolysin  42.35 
 
 		 778 aa  63.9  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0166  collagenase  38.37 
 
 		 1104 aa  64.3  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0465  peptidase M4 thermolysin  42.35 
 
 		 778 aa  63.9  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  43.9 
 
 		 732 aa  63.2  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1680  putative microbial collagenase  45.33 
 
 		 971 aa  62.8  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0340823  hitchhiker  1.3122e-17 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0486  collagenase  40.7 
 
 		 967 aa  62.8  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.008095  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3323  collagenase  44 
 
 		 971 aa  62.4  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3286  collagenase  44 
 
 		 971 aa  62.4  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238892  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0456  peptidase M4 thermolysin  47.3 
 
 		 778 aa  62.4  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3538  putative microbial collagenase  44 
 
 		 971 aa  62  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.60161e-19 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3584  collagenase  44 
 
 		 971 aa  62.4  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.629747  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  38.37 
 
 		 6885 aa  62  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  45.83 
 
 		 524 aa  62  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3015  peptidase M4, thermolysin  42.31 
 
 		 777 aa  62  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3542  putative microbial collagenase  45.33 
 
 		 971 aa  61.6  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3805  PKD domain-containing protein  34.17 
 
 		 917 aa  61.6  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0227113  normal  0.200491 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3915  PKD domain-containing protein  37.93 
 
 		 713 aa  61.6  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1399  PKD domain containing protein  40.7 
 
 		 669 aa  61.6  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0468  collagenase  34.62 
 
 		 965 aa  61.2  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3636  putative microbial collagenase  44 
 
 		 971 aa  61.2  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3539  collagenase, putative  44 
 
 		 971 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3238  collagenase  42.67 
 
 		 1018 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.69 
 
 		 945 aa  60.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3903  PKD domain containing protein  32.5 
 
 		 644 aa  60.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.36 
 
 		 942 aa  60.5  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  48.65 
 
 		 646 aa  60.5  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  40 
 
 		 948 aa  60.1  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  35.96 
 
 		 634 aa  60.1  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2953  peptidase M14 carboxypeptidase A  38.3 
 
 		 773 aa  60.1  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1249  glycoside hydrolase family 9  50.77 
 
 		 686 aa  59.7  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000227885  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  41.3 
 
 		 3197 aa  59.7  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1143  PKD domain containing protein  38.57 
 
 		 1309 aa  59.7  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0417  cellulosome protein dockerin type I  42.86 
 
 		 848 aa  59.7  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000135998  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  38.96 
 
 		 2176 aa  60.1  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0729  glycoside hydrolase family 48  46.38 
 
 		 722 aa  59.7  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000900741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  50.79 
 
 		 725 aa  59.3  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  38.82 
 
 		 3197 aa  58.9  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0286  polysaccharide deacetylase  38.89 
 
 		 308 aa  58.9  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.350747  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0135  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  43.75 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.73051  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  29.35 
 
 		 541 aa  58.5  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  25.68 
 
 		 1011 aa  58.5  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0909  PKD domain-containing protein  33.72 
 
 		 517 aa  58.5  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0741281  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  50.82 
 
 		 536 aa  58.2  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1477  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.36 
 
 		 947 aa  58.2  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0616  collagenase,putative  31.73 
 
 		 965 aa  57.8  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0466  microbial collagenase  31.73 
 
 		 965 aa  57.8  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0113001  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3026  PKD domain-containing protein  47.69 
 
 		 552 aa  57.8  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0523  collagenase,putative  31.73 
 
 		 965 aa  57.4  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.415307  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0127  PKD domain containing protein  31.36 
 
 		 931 aa  57.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00188311 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  38.37 
 
 		 944 aa  57.4  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0684  putative microbial collagenase  31.73 
 
 		 965 aa  57  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000922762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  38.37 
 
 		 944 aa  57.4  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0555  collagenase,putative  31.73 
 
 		 965 aa  57.4  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>