More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3015 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0456  peptidase M4 thermolysin  79.95 
 
 		 778 aa  1279    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0557  peptidase M4 thermolysin  65.04 
 
 		 774 aa  1020    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0428  peptidase M4, thermolysin  65.42 
 
 		 775 aa  1025    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05515  zinc metalloprotease  49.94 
 
 		 780 aa  734    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0439  peptidase M4 thermolysin  80.08 
 
 		 778 aa  1280    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3874  peptidase M4 thermolysin  80.21 
 
 		 778 aa  1283    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0465  peptidase M4 thermolysin  79.95 
 
 		 778 aa  1278    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3015  peptidase M4, thermolysin  100 
 
 		 777 aa  1603    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0371  hemagglutinin/protease  51.88 
 
 		 609 aa  612  9.999999999999999e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000274  neutral protease precursor  48.55 
 
 		 701 aa  525  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6312  peptidase M4 thermolysin  55.71 
 
 		 759 aa  517  1.0000000000000001e-145  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1667  peptidase M4 thermolysin  56.35 
 
 		 791 aa  505  1e-141  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123445  normal  0.274412 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1201  peptidase M4, thermolysin  53.65 
 
 		 485 aa  482  1e-134  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.913619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16250  elastase LasB  50.3 
 
 		 498 aa  475  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1397  elastase LasB  49.8 
 
 		 498 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3129  peptidase M4 thermolysin  53 
 
 		 499 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2681  vibriolysin  50.84 
 
 		 500 aa  444  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161889 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2583  vibriolysin  50.72 
 
 		 500 aa  432  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.940274  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2515  vibriolysin  49.29 
 
 		 500 aa  421  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.67369  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02509  protease  40.32 
 
 		 673 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0532  zinc metalloproteinase precursor  38.1 
 
 		 543 aa  325  3e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0508  zinc metalloproteinase precursor  38.1 
 
 		 543 aa  325  3e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0019  hypothetical protein  37.7 
 
 		 558 aa  294  3e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0020  hypothetical protein  37.67 
 
 		 558 aa  293  1e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  45.71 
 
 		 677 aa  248  4e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0115  lysyl endopeptidase  46.49 
 
 		 823 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.585546  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1626  hypothetical protein  31.74 
 
 		 557 aa  224  7e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2906  hypothetical protein  32.47 
 
 		 553 aa  220  7.999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3049  hypothetical protein  32.27 
 
 		 553 aa  218  2.9999999999999998e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1620  hypothetical protein  31.95 
 
 		 557 aa  210  7e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0515  thermolysin  30.99 
 
 		 565 aa  171  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000166027  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0670  Thermolysin  30.97 
 
 		 546 aa  167  8e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0656  neutral protease Npr599  31.05 
 
 		 566 aa  157  7e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.833790000000001e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0567  neutral protease  30.41 
 
 		 566 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3645  thermolysin  31.17 
 
 		 532 aa  156  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0278352  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0599  neutral protease  30.41 
 
 		 566 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0667  neutral protease  31.69 
 
 		 566 aa  152  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.238285  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0638  neutral protease Npr599  31.05 
 
 		 566 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.368383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0509  bacillolysin (thermolysin-like metalloprotease, peptidase M4)  30.62 
 
 		 566 aa  149  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00722387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0511  bacillolysin (thermolysin-like metalloprotease, peptidase M4)  30.62 
 
 		 566 aa  149  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000111009  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0727  neutral protease Npr599  31.05 
 
 		 566 aa  149  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3166  griselysin  30.64 
 
 		 527 aa  148  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0514  thermolysin  30.62 
 
 		 566 aa  148  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3106  cold-active serine alkaline protease  39.92 
 
 		 807 aa  146  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4700  neutral protease Npr599  30.62 
 
 		 566 aa  145  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1611  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.38 
 
 		 802 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0326681 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1390  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.75 
 
 		 805 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000278441  hitchhiker  0.0000000134181 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1455  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.75 
 
 		 805 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00029067  hitchhiker  0.000623133 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.33 
 
 		 809 aa  138  5e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000125277  hitchhiker  0.0000000821824 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2185  cold-active serine alkaline protease  60 
 
 		 803 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000390899  decreased coverage  0.00433013 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2692  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.63 
 
 		 818 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2477  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.57 
 
 		 823 aa  134  7.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000447493  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3041  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.71 
 
 		 807 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.022997  normal  0.0310863 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1578  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.22 
 
 		 819 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000462777  hitchhiker  0.00000000445269 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2874  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.57 
 
 		 819 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000394785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2799  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.57 
 
 		 819 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000118341  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2779  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.57 
 
 		 819 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000279348  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.59 
 
 		 807 aa  128  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000415164  unclonable  0.00000378434 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1408  neutral zinc metallopeptidase M4 family protein  27.76 
 
 		 721 aa  127  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0448524  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1409  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50.82 
 
 		 803 aa  125  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000345823  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0751  cold-active alkaline serine protease  46.94 
 
 		 789 aa  120  7.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0427  peptidase domain-containing protein  43.62 
 
 		 553 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1523  extracellular metalloprotease precursor protein  43.31 
 
 		 351 aa  116  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.103754  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2209  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.01 
 
 		 1158 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00262816  normal  0.214533 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0439  subtilisin-like serine protease-like protein  39.38 
 
 		 1151 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0564398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2213  peptidase M4 thermolysin  27.2 
 
 		 556 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000134163  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0375  neutral protease  27.8 
 
 		 556 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09051  thermolysin  27.35 
 
 		 984 aa  111  5e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3289  endonuclease I  46.55 
 
 		 542 aa  111  6e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363328  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0647  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.37 
 
 		 836 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000368401 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1623  peptidase M4, thermolysin  37.38 
 
 		 375 aa  110  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4623  peptidase domain-containing protein  43.94 
 
 		 658 aa  109  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.272632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0042  neutral protease  29.85 
 
 		 556 aa  109  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000223504  normal  0.0464534 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3200  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  52.53 
 
 		 629 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3338  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  52.53 
 
 		 629 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2045  peptidase M4 thermolysin  42.86 
 
 		 353 aa  109  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.912259 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07565  thermolysin  33.62 
 
 		 1251 aa  108  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001489  alkaline serine exoprotease A precursor  46.02 
 
 		 534 aa  108  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1599  peptidase M4 thermolysin  29.59 
 
 		 556 aa  108  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000990098  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0886  peptidase M4, thermolysin  26.6 
 
 		 924 aa  108  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0556  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  49.02 
 
 		 494 aa  108  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0947915  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1173  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  51.52 
 
 		 629 aa  107  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3194  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  51.52 
 
 		 629 aa  107  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04205  neutral protease A  44.22 
 
 		 221 aa  107  8e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2373  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50.51 
 
 		 628 aa  106  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.200632  normal  0.503534 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0867  serine protease  40.59 
 
 		 818 aa  105  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02449  hypothetical protein  45.13 
 
 		 489 aa  105  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3006  peptidase M4 thermolysin  37.5 
 
 		 347 aa  104  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00558937  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5197  neutral protease B  25.82 
 
 		 591 aa  104  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2661  zinc metalloproteinase aureolysin  28.38 
 
 		 509 aa  103  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.502618  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5252  peptidase M4 thermolysin  32.17 
 
 		 356 aa  103  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0068319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4752  neutral protease B  26.64 
 
 		 554 aa  103  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000177713  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4771  neutral protease B  26.34 
 
 		 554 aa  103  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2717  zinc metalloproteinase aureolysin  28.38 
 
 		 509 aa  103  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2871  cold-active alkaline serine protease  49.49 
 
 		 789 aa  103  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5152  neutral protease B  26.64 
 
 		 549 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000564161 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0437  peptidase M4 thermolysin  27.66 
 
 		 1017 aa  103  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00224619  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01501  putative secreted serine protease, subtilisin family, possibly excreted  39.2 
 
 		 840 aa  102  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1266  peptidase M4 thermolysin  41.14 
 
 		 347 aa  102  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248028  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3093  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.42 
 
 		 835 aa  102  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.479186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>