144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1523 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_1523  extracellular metalloprotease precursor protein  100 
 
 
351 aa  740    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.103754  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3233  peptidase M4 thermolysin  40.67 
 
 
342 aa  245  8e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.029325  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2947  peptidase M4, thermolysin  40.22 
 
 
360 aa  229  7e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0599  peptidase M4 thermolysin  39.2 
 
 
354 aa  228  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.410805 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1188  peptidase M4 thermolysin  39.61 
 
 
403 aa  226  4e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3601  peptidase M4 thermolysin  42.35 
 
 
341 aa  226  4e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.238334  normal  0.290182 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1623  peptidase M4, thermolysin  38.29 
 
 
375 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2362  peptidase M4 thermolysin  36.77 
 
 
350 aa  216  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000736237 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2537  peptidase M4, thermolysin  39.57 
 
 
348 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7042  peptidase M4 thermolysin  39.14 
 
 
351 aa  214  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4056  peptidase M4, thermolysin  43.21 
 
 
430 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3006  peptidase M4 thermolysin  37.68 
 
 
347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00558937  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5252  peptidase M4 thermolysin  36.65 
 
 
356 aa  214  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0068319  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1266  peptidase M4 thermolysin  37.68 
 
 
347 aa  212  7e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248028  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2629  peptidase M4, thermolysin  36.26 
 
 
347 aa  208  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.235261  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2045  peptidase M4 thermolysin  36.65 
 
 
353 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.912259 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30670  Zinc metalloprotease (elastase)  40.82 
 
 
547 aa  202  5e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1125  peptidase M4 thermolysin  39.51 
 
 
349 aa  202  7e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00938174  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2731  peptidase M4 thermolysin  39.46 
 
 
357 aa  192  9e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00336587  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3041  bacillolysin  36.4 
 
 
356 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0173986  normal  0.0722993 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3176  thermolysin metallopeptidase, putative  39.66 
 
 
356 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107926  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03436  neutral protease A  47.94 
 
 
207 aa  179  5.999999999999999e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1599  peptidase M4 thermolysin  41.43 
 
 
556 aa  161  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000990098  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0042  neutral protease  41.83 
 
 
556 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000223504  normal  0.0464534 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0375  neutral protease  41.04 
 
 
556 aa  159  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0670  Thermolysin  38.68 
 
 
546 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3645  thermolysin  40.33 
 
 
532 aa  157  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0278352  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2213  peptidase M4 thermolysin  40.16 
 
 
556 aa  155  9e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000134163  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0656  neutral protease Npr599  38.52 
 
 
566 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.833790000000001e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0567  neutral protease  38.52 
 
 
566 aa  152  8e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0100  neutral protease, N-terminal region  41.43 
 
 
274 aa  152  8e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0090986  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0599  neutral protease  38.52 
 
 
566 aa  152  8e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0515  thermolysin  37.14 
 
 
565 aa  150  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000166027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0509  bacillolysin (thermolysin-like metalloprotease, peptidase M4)  37.34 
 
 
566 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00722387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0511  bacillolysin (thermolysin-like metalloprotease, peptidase M4)  37.34 
 
 
566 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000111009  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0667  neutral protease  36.51 
 
 
566 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.238285  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0514  thermolysin  40.61 
 
 
566 aa  144  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0727  neutral protease Npr599  36.51 
 
 
566 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0638  neutral protease Npr599  40.61 
 
 
566 aa  143  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.368383  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4700  neutral protease Npr599  40.61 
 
 
566 aa  142  7e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2661  zinc metalloproteinase aureolysin  39.51 
 
 
509 aa  140  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.502618  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2717  zinc metalloproteinase aureolysin  39.51 
 
 
509 aa  140  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3622  peptidase M4 thermolysin  34.39 
 
 
478 aa  139  7e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5183  neutral protease B, bacillolysin  33.99 
 
 
591 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00705702  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0061  neutral protease B  33.99 
 
 
556 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0235216  hitchhiker  0.000405406 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4752  neutral protease B  34.39 
 
 
554 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000177713  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3166  griselysin  38.28 
 
 
527 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4771  neutral protease B  34.39 
 
 
554 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5152  neutral protease B  34.39 
 
 
549 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000564161 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5188  neutral protease B  33.99 
 
 
591 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.32835  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5197  neutral protease B  33.6 
 
 
591 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2252  extracellular elastase precursor  39.51 
 
 
507 aa  130  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5282  neutral protease B  34 
 
 
547 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.346731  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4867  peptidase M4 thermolysin  32.81 
 
 
549 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4907  neutral protease B  34 
 
 
552 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1208  metalloprotease  38.61 
 
 
1031 aa  121  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.226468  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1201  peptidase M4, thermolysin  42.68 
 
 
485 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.913619  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6312  peptidase M4 thermolysin  44.74 
 
 
759 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0437  peptidase M4 thermolysin  35.47 
 
 
1017 aa  118  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00224619  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0428  peptidase M4, thermolysin  43.95 
 
 
775 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3015  peptidase M4, thermolysin  43.31 
 
 
777 aa  116  6e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05515  zinc metalloprotease  40.99 
 
 
780 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3129  peptidase M4 thermolysin  43.31 
 
 
499 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2583  vibriolysin  41.45 
 
 
500 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.940274  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2681  vibriolysin  41.4 
 
 
500 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.161889 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1667  peptidase M4 thermolysin  40.93 
 
 
791 aa  112  9e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123445  normal  0.274412 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2515  vibriolysin  41.45 
 
 
500 aa  112  9e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.67369  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1233  propeptide, peptidase M4 and M36  30.7 
 
 
565 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6599  propeptide, peptidase M4 and M36  30.7 
 
 
565 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3874  peptidase M4 thermolysin  39.53 
 
 
778 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0439  peptidase M4 thermolysin  39.53 
 
 
778 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0456  peptidase M4 thermolysin  39.53 
 
 
778 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6203  peptidase M4 thermolysin  30.7 
 
 
565 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231867  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0465  peptidase M4 thermolysin  39.53 
 
 
778 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  31.85 
 
 
1154 aa  109  8.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16250  elastase LasB  40.48 
 
 
498 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02509  protease  35.35 
 
 
673 aa  109  8.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7164  ZmpA peptidase  30.06 
 
 
565 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1397  elastase LasB  39.88 
 
 
498 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000274  neutral protease precursor  42 
 
 
701 aa  106  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0816  thermolysin metallopeptidase  29.84 
 
 
565 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.273503  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0557  peptidase M4 thermolysin  41.45 
 
 
774 aa  104  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25076  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3836  propeptide, peptidase M4 and M36  30.38 
 
 
565 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.827362  normal  0.318438 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4301  peptidase M4 thermolysin  30.38 
 
 
565 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0532  zinc metalloproteinase precursor  35.87 
 
 
543 aa  102  8e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0508  zinc metalloproteinase precursor  35.87 
 
 
543 aa  102  8e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1559  thermolysin metallopeptidase  29.84 
 
 
565 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.837695  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0599  thermolysin metallopeptidase  29.84 
 
 
565 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.443077  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2046  thermolysin metallopeptidase  29.84 
 
 
585 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2191  thermolysin metallopeptidase  29.84 
 
 
585 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.201777  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2104  thermolysin metallopeptidase  29.84 
 
 
585 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.339655  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0724  thermolysin metallopeptidase  29.84 
 
 
565 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.28714  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0371  hemagglutinin/protease  38.16 
 
 
609 aa  101  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09051  thermolysin  29.03 
 
 
984 aa  99.8  6e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04205  neutral protease A  35.57 
 
 
221 aa  97.8  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0886  peptidase M4, thermolysin  32.1 
 
 
924 aa  96.7  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3408  bacillolysin  29.33 
 
 
565 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3170  neutral protease (bacillolysin)  29.33 
 
 
565 aa  96.3  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000070765  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0380  neutral protease  28.98 
 
 
568 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000306257  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3189  neutral protease  28.98 
 
 
565 aa  93.6  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000741792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>