84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4623 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4623  peptidase domain-containing protein  100 
 
 		 658 aa  1356    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.272632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0556  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  52.22 
 
 		 494 aa  223  7e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0947915  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0751  cold-active alkaline serine protease  52.66 
 
 		 789 aa  216  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12193  hypothetical protein  32.88 
 
 		 509 aa  209  1e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0427  peptidase domain-containing protein  45.68 
 
 		 553 aa  207  4e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2871  cold-active alkaline serine protease  47 
 
 		 789 aa  198  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3200  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.55 
 
 		 629 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3194  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.06 
 
 		 629 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3338  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.96 
 
 		 629 aa  178  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1173  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.06 
 
 		 629 aa  178  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2373  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.94 
 
 		 628 aa  167  5e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.200632  normal  0.503534 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1016  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.09 
 
 		 630 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  54.17 
 
 		 807 aa  151  5e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000415164  unclonable  0.00000378434 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2692  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  58.91 
 
 		 818 aa  150  8e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1578  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  57.25 
 
 		 819 aa  147  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000462777  hitchhiker  0.00000000445269 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3106  cold-active serine alkaline protease  59.84 
 
 		 807 aa  145  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2799  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  55.8 
 
 		 819 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000118341  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2874  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  55.8 
 
 		 819 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000394785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2477  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  60.98 
 
 		 823 aa  145  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000447493  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2779  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  55.8 
 
 		 819 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000279348  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1409  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  54.81 
 
 		 803 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000345823  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3041  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  59.13 
 
 		 807 aa  140  6e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.022997  normal  0.0310863 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.31 
 
 		 809 aa  140  7e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000125277  hitchhiker  0.0000000821824 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1455  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  53.9 
 
 		 805 aa  139  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00029067  hitchhiker  0.000623133 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1390  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  55.38 
 
 		 805 aa  139  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000278441  hitchhiker  0.0000000134181 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1611  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.81 
 
 		 802 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0326681 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2185  cold-active serine alkaline protease  59.6 
 
 		 803 aa  128  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000390899  decreased coverage  0.00433013 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4257  endonuclease I  42.2 
 
 		 558 aa  118  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4109  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50.51 
 
 		 520 aa  117  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.941558 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03458  cold-active serine alkaline protease  52.75 
 
 		 533 aa  117  6.9999999999999995e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0416206  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3874  peptidase M4 thermolysin  58.33 
 
 		 778 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0097  endonuclease I  42.2 
 
 		 558 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0465  peptidase M4 thermolysin  58.33 
 
 		 778 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0456  peptidase M4 thermolysin  57.29 
 
 		 778 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0439  peptidase M4 thermolysin  58.33 
 
 		 778 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0428  peptidase M4, thermolysin  50.47 
 
 		 775 aa  115  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3021  endonuclease I  53.1 
 
 		 553 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04872  cold-active alkaline serine protease  46.46 
 
 		 794 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3396  endonuclease I  55 
 
 		 539 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3289  endonuclease I  51.89 
 
 		 542 aa  108  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363328  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  48.65 
 
 		 677 aa  106  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0557  peptidase M4 thermolysin  46.67 
 
 		 774 aa  104  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0712  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48 
 
 		 579 aa  104  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.482553 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0371  hemagglutinin/protease  46.77 
 
 		 609 aa  104  7e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02449  hypothetical protein  48.25 
 
 		 489 aa  103  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3015  peptidase M4, thermolysin  43.9 
 
 		 777 aa  103  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  42.11 
 
 		 501 aa  101  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001489  alkaline serine exoprotease A precursor  44.74 
 
 		 534 aa  99.4  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0115  lysyl endopeptidase  45.3 
 
 		 823 aa  99  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.585546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04561  extracellular protease  46.46 
 
 		 560 aa  91.3  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.550722  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000274  neutral protease precursor  42.7 
 
 		 701 aa  87.8  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0422  hypothetical protein  43.27 
 
 		 476 aa  82  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0260128  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5708  peptidase domain protein  28.76 
 
 		 492 aa  77  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02448  protease  40 
 
 		 482 aa  73.9  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2341  alkaline serine protease  38.38 
 
 		 535 aa  72.8  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00532226  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02674  protease  35.65 
 
 		 176 aa  68.9  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05516  aminopeptidase  35.58 
 
 		 504 aa  68.9  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0542  metallophosphoesterase  26.51 
 
 		 429 aa  68.2  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.411442  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2754  collagenase  26.64 
 
 		 972 aa  62  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0657  collagenase  26.81 
 
 		 1070 aa  61.6  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001372  microbial collagenase secreted  25.67 
 
 		 808 aa  61.6  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00032964  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0653  Microbial collagenase  26.81 
 
 		 1041 aa  61.6  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0630  collagenase  26.81 
 
 		 1070 aa  61.2  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3732  collagenase  26.81 
 
 		 1041 aa  61.2  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  46.15 
 
 		 523 aa  58.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7152  Peptidase M9A collagenase domain protein  33.55 
 
 		 855 aa  57.4  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.766617  normal  0.500432 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3551  metallophosphoesterase  24.61 
 
 		 440 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120328  normal  0.020827 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01786  hypothetical protein  24.09 
 
 		 785 aa  55.5  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0639  collagenase family protein  25.53 
 
 		 1037 aa  55.1  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3516  Microbial collagenase  33.11 
 
 		 852 aa  54.7  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0648  collagenase  27.54 
 
 		 1005 aa  54.7  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000132044  unclonable  0.0000000383591 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  27.54 
 
 		 1194 aa  53.9  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05515  zinc metalloprotease  34.18 
 
 		 780 aa  53.5  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1685  collagenase  25 
 
 		 968 aa  52.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000629981  unclonable  0.00000468189 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03059  protease  39.24 
 
 		 620 aa  52.8  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0545  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.95 
 
 		 617 aa  52.4  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0878069 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8349  metallophosphoesterase  23.8 
 
 		 540 aa  50.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1256  collagenase  23.94 
 
 		 539 aa  50.1  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000029967  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2049  metallophosphoesterase  22.3 
 
 		 422 aa  48.5  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3838  metallophosphoesterase  28.15 
 
 		 442 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.58711 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1219  metallophosphoesterase  30.08 
 
 		 759 aa  45.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3480  metallophosphoesterase  21.13 
 
 		 532 aa  45.1  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12597  hypothetical protein  26.55 
 
 		 529 aa  44.7  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28282  predicted protein  32.53 
 
 		 3288 aa  43.9  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>