145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3129 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2515  vibriolysin  67.6 
 
 		 500 aa  658    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.67369  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2583  vibriolysin  67.6 
 
 		 500 aa  674    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.940274  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2681  vibriolysin  69.4 
 
 		 500 aa  709    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161889 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1201  peptidase M4, thermolysin  67.14 
 
 		 485 aa  681    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.913619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3129  peptidase M4 thermolysin  100 
 
 		 499 aa  1039    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0428  peptidase M4, thermolysin  51.12 
 
 		 775 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0557  peptidase M4 thermolysin  49.41 
 
 		 774 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05515  zinc metalloprotease  49.12 
 
 		 780 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3015  peptidase M4, thermolysin  53.22 
 
 		 777 aa  457  1e-127  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3874  peptidase M4 thermolysin  50.39 
 
 		 778 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0439  peptidase M4 thermolysin  50.39 
 
 		 778 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0456  peptidase M4 thermolysin  50.39 
 
 		 778 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0465  peptidase M4 thermolysin  50.39 
 
 		 778 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16250  elastase LasB  49.37 
 
 		 498 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1397  elastase LasB  48.74 
 
 		 498 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6312  peptidase M4 thermolysin  49.68 
 
 		 759 aa  433  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000274  neutral protease precursor  50.53 
 
 		 701 aa  430  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0371  hemagglutinin/protease  46.91 
 
 		 609 aa  420  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1667  peptidase M4 thermolysin  45.93 
 
 		 791 aa  416  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123445  normal  0.274412 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02509  protease  43.75 
 
 		 673 aa  357  1.9999999999999998e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0532  zinc metalloproteinase precursor  38.54 
 
 		 543 aa  309  1.0000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0508  zinc metalloproteinase precursor  38.43 
 
 		 543 aa  308  1.0000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0019  hypothetical protein  37.95 
 
 		 558 aa  277  3e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0020  hypothetical protein  37.95 
 
 		 558 aa  277  3e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3049  hypothetical protein  32.54 
 
 		 553 aa  223  4.9999999999999996e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2906  hypothetical protein  32.35 
 
 		 553 aa  219  8.999999999999998e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1626  hypothetical protein  29.35 
 
 		 557 aa  208  2e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1620  hypothetical protein  30.14 
 
 		 557 aa  201  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3645  thermolysin  31.25 
 
 		 532 aa  169  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0278352  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3166  griselysin  31.92 
 
 		 527 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0670  Thermolysin  31.6 
 
 		 546 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1408  neutral zinc metallopeptidase M4 family protein  31.21 
 
 		 721 aa  135  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0448524  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0515  thermolysin  26.73 
 
 		 565 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000166027  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0567  neutral protease  27.73 
 
 		 566 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0599  neutral protease  27.73 
 
 		 566 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0656  neutral protease Npr599  27.51 
 
 		 566 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.833790000000001e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0667  neutral protease  28.57 
 
 		 566 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.238285  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0509  bacillolysin (thermolysin-like metalloprotease, peptidase M4)  28.17 
 
 		 566 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00722387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0511  bacillolysin (thermolysin-like metalloprotease, peptidase M4)  28.17 
 
 		 566 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000111009  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4700  neutral protease Npr599  28.35 
 
 		 566 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0638  neutral protease Npr599  28.35 
 
 		 566 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.368383  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0514  thermolysin  28.05 
 
 		 566 aa  128  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0727  neutral protease Npr599  27.92 
 
 		 566 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04205  neutral protease A  38.21 
 
 		 221 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1523  extracellular metalloprotease precursor protein  43.31 
 
 		 351 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.103754  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2213  peptidase M4 thermolysin  26.42 
 
 		 556 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000134163  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  31.33 
 
 		 1154 aa  108  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2947  peptidase M4, thermolysin  29.35 
 
 		 360 aa  106  9e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1208  metalloprotease  37.57 
 
 		 1031 aa  106  9e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.226468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1623  peptidase M4, thermolysin  42.24 
 
 		 375 aa  106  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0375  neutral protease  26.36 
 
 		 556 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1599  peptidase M4 thermolysin  27.19 
 
 		 556 aa  105  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000990098  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2045  peptidase M4 thermolysin  42.5 
 
 		 353 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.912259 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1188  peptidase M4 thermolysin  34.6 
 
 		 403 aa  104  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3006  peptidase M4 thermolysin  34.65 
 
 		 347 aa  102  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00558937  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2362  peptidase M4 thermolysin  38.37 
 
 		 350 aa  101  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000736237 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2629  peptidase M4, thermolysin  38.73 
 
 		 347 aa  100  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.235261  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1266  peptidase M4 thermolysin  34.74 
 
 		 347 aa  99.4  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248028  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0042  neutral protease  34.08 
 
 		 556 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000223504  normal  0.0464534 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2191  thermolysin metallopeptidase  29.06 
 
 		 585 aa  98.6  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.201777  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1233  propeptide, peptidase M4 and M36  27.84 
 
 		 565 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6599  propeptide, peptidase M4 and M36  27.84 
 
 		 565 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7042  peptidase M4 thermolysin  39.39 
 
 		 351 aa  97.8  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1559  thermolysin metallopeptidase  28.48 
 
 		 565 aa  97.8  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.837695  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0599  thermolysin metallopeptidase  28.48 
 
 		 565 aa  97.8  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.443077  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2046  thermolysin metallopeptidase  28.48 
 
 		 585 aa  97.8  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2104  thermolysin metallopeptidase  28.48 
 
 		 585 aa  97.8  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.339655  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0724  thermolysin metallopeptidase  28.48 
 
 		 565 aa  97.8  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.28714  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4752  neutral protease B  27.37 
 
 		 554 aa  96.7  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000177713  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5152  neutral protease B  27.37 
 
 		 549 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000564161 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0816  thermolysin metallopeptidase  28.36 
 
 		 565 aa  95.9  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.273503  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2537  peptidase M4, thermolysin  41.56 
 
 		 348 aa  96.3  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0599  peptidase M4 thermolysin  35.64 
 
 		 354 aa  96.3  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.410805 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4867  peptidase M4 thermolysin  27.65 
 
 		 549 aa  95.9  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5188  neutral protease B  27.37 
 
 		 591 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.32835  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5197  neutral protease B  27.31 
 
 		 591 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4907  neutral protease B  27.53 
 
 		 552 aa  95.5  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5282  neutral protease B  27.53 
 
 		 547 aa  95.9  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.346731  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4771  neutral protease B  26.94 
 
 		 554 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6203  peptidase M4 thermolysin  27.42 
 
 		 565 aa  94.7  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231867  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09051  thermolysin  26.39 
 
 		 984 aa  94  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3601  peptidase M4 thermolysin  37.21 
 
 		 341 aa  94.4  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.238334  normal  0.290182 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5183  neutral protease B, bacillolysin  26.69 
 
 		 591 aa  93.6  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00705702  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2661  zinc metalloproteinase aureolysin  33.03 
 
 		 509 aa  93.2  9e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.502618  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2717  zinc metalloproteinase aureolysin  33.03 
 
 		 509 aa  93.2  9e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2252  extracellular elastase precursor  32.58 
 
 		 507 aa  92.8  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5252  peptidase M4 thermolysin  29.49 
 
 		 356 aa  92.4  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0068319  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1125  peptidase M4 thermolysin  38.04 
 
 		 349 aa  92.4  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00938174  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3233  peptidase M4 thermolysin  35.14 
 
 		 342 aa  92  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.029325  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4056  peptidase M4, thermolysin  37.5 
 
 		 430 aa  92.4  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3091  neutral protease (bacillolysin)  25.63 
 
 		 565 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000299935  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0380  neutral protease  25.26 
 
 		 568 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000306257  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07565  thermolysin  31.51 
 
 		 1251 aa  91.3  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2731  peptidase M4 thermolysin  33.33 
 
 		 357 aa  90.9  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00336587  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0100  neutral protease, N-terminal region  36.7 
 
 		 274 aa  90.9  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0090986  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3836  propeptide, peptidase M4 and M36  43.48 
 
 		 565 aa  90.9  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.827362  normal  0.318438 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4301  peptidase M4 thermolysin  43.48 
 
 		 565 aa  90.9  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0886  peptidase M4, thermolysin  34.01 
 
 		 924 aa  90.5  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0061  neutral protease B  26.94 
 
 		 556 aa  90.1  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0235216  hitchhiker  0.000405406 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07560  thermolysin precursor  29.81 
 
 		 1250 aa  90.1  8e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>