136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3289 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3289  endonuclease I  100 
 
 		 542 aa  1114    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363328  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4257  endonuclease I  69 
 
 		 558 aa  799    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3021  endonuclease I  64.66 
 
 		 553 aa  707    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0097  endonuclease I  68.82 
 
 		 558 aa  794    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3396  endonuclease I  69.14 
 
 		 539 aa  765    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2634  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  54.47 
 
 		 1310 aa  266  5.999999999999999e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01224  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  52.23 
 
 		 1346 aa  257  5e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1877  Endonuclease I  55.17 
 
 		 388 aa  254  4.0000000000000004e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1033  endonuclease I  52.08 
 
 		 1503 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.8795  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3124  ribonuclease  54.08 
 
 		 275 aa  242  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0290634  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3370  ribonuclease  54.08 
 
 		 275 aa  242  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1907  ribonuclease  53.65 
 
 		 275 aa  241  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3049  endonuclease I  53.65 
 
 		 275 aa  241  4e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00672798  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3323  ribonuclease  53.22 
 
 		 275 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.934207  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26920  endonuclease I  52.71 
 
 		 256 aa  239  8e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1682  Endonuclease I  47.84 
 
 		 267 aa  205  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5127  Endonuclease I  45.89 
 
 		 378 aa  191  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.745225 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1948  endonuclease I  38.89 
 
 		 285 aa  180  7e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3628  Endonuclease I  34.22 
 
 		 596 aa  155  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0543  endonuclease I  38.89 
 
 		 466 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1409  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  52.67 
 
 		 803 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000345823  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1611  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  59.63 
 
 		 802 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0326681 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6326  Endonuclease I  36.08 
 
 		 442 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06200  YurI  35.02 
 
 		 657 aa  130  8.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2185  cold-active serine alkaline protease  61.62 
 
 		 803 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000390899  decreased coverage  0.00433013 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1578  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  52.76 
 
 		 819 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000462777  hitchhiker  0.00000000445269 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50 
 
 		 807 aa  128  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000415164  unclonable  0.00000378434 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2779  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  51.18 
 
 		 819 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000279348  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2799  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  51.18 
 
 		 819 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000118341  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2874  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  51.18 
 
 		 819 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000394785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1390  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  51.18 
 
 		 805 aa  127  5e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000278441  hitchhiker  0.0000000134181 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1455  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  51.18 
 
 		 805 aa  127  5e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00029067  hitchhiker  0.000623133 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  51.18 
 
 		 809 aa  127  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000125277  hitchhiker  0.0000000821824 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3106  cold-active serine alkaline protease  49.64 
 
 		 807 aa  126  9e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3041  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  53.78 
 
 		 807 aa  125  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.022997  normal  0.0310863 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2477  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.82 
 
 		 823 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000447493  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0427  peptidase domain-containing protein  50.85 
 
 		 553 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001088  endonuclease I  34.77 
 
 		 538 aa  118  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2692  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  52.1 
 
 		 818 aa  117  6e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0751  cold-active alkaline serine protease  55 
 
 		 789 aa  115  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0556  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  55.56 
 
 		 494 aa  111  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0947915  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10308  putative secreted ribonuclease  32.82 
 
 		 365 aa  111  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2871  cold-active alkaline serine protease  48.31 
 
 		 789 aa  109  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  33.86 
 
 		 614 aa  109  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0712  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  52 
 
 		 579 aa  109  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.482553 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4623  peptidase domain-containing protein  49.57 
 
 		 658 aa  108  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.272632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04827  ribonuclease  33.46 
 
 		 539 aa  107  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3874  peptidase M4 thermolysin  51.52 
 
 		 778 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0456  peptidase M4 thermolysin  50.51 
 
 		 778 aa  107  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0439  peptidase M4 thermolysin  51.52 
 
 		 778 aa  107  7e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0428  peptidase M4, thermolysin  47.62 
 
 		 775 aa  107  8e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0465  peptidase M4 thermolysin  51.52 
 
 		 778 aa  107  8e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  32.81 
 
 		 617 aa  106  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3015  peptidase M4, thermolysin  48 
 
 		 777 aa  103  7e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1016  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.22 
 
 		 630 aa  101  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02449  hypothetical protein  44.7 
 
 		 489 aa  101  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1896  Endonuclease I  35.02 
 
 		 272 aa  101  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3200  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.01 
 
 		 629 aa  97.4  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1173  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.01 
 
 		 629 aa  97.8  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3194  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.01 
 
 		 629 aa  97.4  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04872  cold-active alkaline serine protease  48.04 
 
 		 794 aa  97.1  8e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3338  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.55 
 
 		 629 aa  97.1  8e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001489  alkaline serine exoprotease A precursor  42.06 
 
 		 534 aa  92.4  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2373  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.48 
 
 		 628 aa  90.9  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.200632  normal  0.503534 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0557  peptidase M4 thermolysin  45 
 
 		 774 aa  90.1  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0422  hypothetical protein  41.28 
 
 		 476 aa  89  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0260128  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0115  lysyl endopeptidase  40.78 
 
 		 823 aa  88.6  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.585546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48915  predicted protein  35.38 
 
 		 516 aa  88.2  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4109  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.32 
 
 		 520 aa  87.8  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.941558 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0371  hemagglutinin/protease  40.91 
 
 		 609 aa  87.8  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04561  extracellular protease  41.35 
 
 		 560 aa  82.8  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.550722  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03458  cold-active serine alkaline protease  43.21 
 
 		 533 aa  82  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0416206  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  41.41 
 
 		 677 aa  82  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000274  neutral protease precursor  37.27 
 
 		 701 aa  79  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4761  Endonuclease I  32.52 
 
 		 341 aa  79  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0283458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5532  Endonuclease I  30.77 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0708603 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2341  alkaline serine protease  39.39 
 
 		 535 aa  75.9  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00532226  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf874  membrane nuclease  33.54 
 
 		 314 aa  73.2  0.00000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02448  protease  35.92 
 
 		 482 aa  70.1  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5708  peptidase domain protein  33.64 
 
 		 492 aa  68.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  37.62 
 
 		 501 aa  69.3  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1505  Endonuclease I  30.73 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.12259  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3907  Deoxyribonuclease I  33.59 
 
 		 232 aa  60.1  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000139034  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05516  aminopeptidase  34 
 
 		 504 aa  59.7  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4067  endonuclease I  30 
 
 		 219 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0378834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3757  deoxyribonuclease I  34.38 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.163237  normal  0.488138 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0547  Deoxyribonuclease I  32.82 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000480912  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3709  Deoxyribonuclease I  32.82 
 
 		 232 aa  57  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000796266  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1309  deoxyribonuclease I  37.98 
 
 		 229 aa  56.6  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.122078  normal  0.128017 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3349  deoxyribonuclease I  32.12 
 
 		 235 aa  56.6  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000315843  decreased coverage  0.00212113 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  49.23 
 
 		 523 aa  56.2  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2569  deoxyribonuclease I  32.81 
 
 		 321 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0107726  normal  0.160045 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0504  Deoxyribonuclease I  32.06 
 
 		 233 aa  55.5  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000136601  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2835  deoxyribonuclease I  37.98 
 
 		 229 aa  55.1  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.667244 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3375  deoxyribonuclease I  32.03 
 
 		 321 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2748  endonuclease I  30.22 
 
 		 211 aa  54.3  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2383  deoxyribonuclease I  32.03 
 
 		 321 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.178356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2065  deoxyribonuclease I  36.92 
 
 		 243 aa  53.5  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.014094  normal  0.0314213 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2661  Endonuclease I  29.41 
 
 		 308 aa  53.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02674  protease  33.93 
 
 		 176 aa  52.4  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>