41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3628 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3628  Endonuclease I  100 
 
 
596 aa  1212    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0543  endonuclease I  48.74 
 
 
466 aa  267  4e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6326  Endonuclease I  45.05 
 
 
442 aa  238  3e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3396  endonuclease I  39.1 
 
 
539 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1000  hypothetical protein  48.81 
 
 
1076 aa  147  5e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3289  endonuclease I  34.39 
 
 
542 aa  147  6e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363328  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0398  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.79 
 
 
1073 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1907  ribonuclease  36.9 
 
 
275 aa  144  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3124  ribonuclease  36.57 
 
 
275 aa  142  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0290634  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3323  ribonuclease  36.16 
 
 
275 aa  142  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.934207  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3370  ribonuclease  36.57 
 
 
275 aa  142  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3021  endonuclease I  38.38 
 
 
553 aa  141  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00455766  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01224  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  34.89 
 
 
1346 aa  140  7e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1033  endonuclease I  36.33 
 
 
1503 aa  139  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.8795  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3049  endonuclease I  36.9 
 
 
275 aa  139  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00672798  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4257  endonuclease I  36.84 
 
 
558 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0097  endonuclease I  36.84 
 
 
558 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2634  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  36.07 
 
 
1310 aa  139  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1877  Endonuclease I  36.57 
 
 
388 aa  134  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1568  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.5 
 
 
942 aa  134  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.10217  normal  0.0647375 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001088  endonuclease I  35.69 
 
 
538 aa  130  7.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26920  endonuclease I  37.31 
 
 
256 aa  130  9.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04827  ribonuclease  34.92 
 
 
539 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5127  Endonuclease I  33.45 
 
 
378 aa  121  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.745225 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1948  endonuclease I  34.62 
 
 
285 aa  115  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1682  Endonuclease I  33.09 
 
 
267 aa  114  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06200  YurI  28.14 
 
 
657 aa  104  5e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10308  putative secreted ribonuclease  31.29 
 
 
365 aa  103  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  33.69 
 
 
614 aa  100  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  32.03 
 
 
617 aa  98.2  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0976  hypothetical protein  40.94 
 
 
844 aa  94.4  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.495512  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3615  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.14 
 
 
868 aa  87.4  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.705484  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf874  membrane nuclease  28.47 
 
 
314 aa  80.1  0.0000000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4761  Endonuclease I  32.98 
 
 
341 aa  77  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0283458  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1896  Endonuclease I  31.98 
 
 
272 aa  72  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48915  predicted protein  26.77 
 
 
516 aa  62.4  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2661  Endonuclease I  28.57 
 
 
308 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04036  hypothetical protein  81.82 
 
 
37 aa  58.5  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4067  endonuclease I  35.96 
 
 
219 aa  58.2  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0378834  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5532  Endonuclease I  29.45 
 
 
232 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0708603 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1505  Endonuclease I  28.06 
 
 
311 aa  53.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.12259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>