145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3021 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3289  endonuclease I  64.85 
 
 		 542 aa  719    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363328  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4257  endonuclease I  64.58 
 
 		 558 aa  720    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3021  endonuclease I  100 
 
 		 553 aa  1122    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0097  endonuclease I  64.59 
 
 		 558 aa  718    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3396  endonuclease I  76.62 
 
 		 539 aa  837    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01224  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  54.25 
 
 		 1346 aa  265  2e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2634  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  52.85 
 
 		 1310 aa  264  3e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1877  Endonuclease I  56.9 
 
 		 388 aa  257  3e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1033  endonuclease I  54.3 
 
 		 1503 aa  242  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.8795  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3124  ribonuclease  54.55 
 
 		 275 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0290634  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3370  ribonuclease  54.55 
 
 		 275 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1907  ribonuclease  54.11 
 
 		 275 aa  241  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3049  endonuclease I  54.55 
 
 		 275 aa  241  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00672798  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3323  ribonuclease  53.68 
 
 		 275 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.934207  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26920  endonuclease I  55.32 
 
 		 256 aa  234  4.0000000000000004e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1682  Endonuclease I  50.87 
 
 		 267 aa  228  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5127  Endonuclease I  47.84 
 
 		 378 aa  212  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.745225 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1948  endonuclease I  41.11 
 
 		 285 aa  179  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0543  endonuclease I  38.81 
 
 		 466 aa  152  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6326  Endonuclease I  37.25 
 
 		 442 aa  142  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3628  Endonuclease I  37.32 
 
 		 596 aa  141  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001088  endonuclease I  34.85 
 
 		 538 aa  129  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06200  YurI  35.55 
 
 		 657 aa  125  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04827  ribonuclease  36.36 
 
 		 539 aa  117  7.999999999999999e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4623  peptidase domain-containing protein  47.14 
 
 		 658 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.272632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50 
 
 		 807 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000415164  unclonable  0.00000378434 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10308  putative secreted ribonuclease  34.88 
 
 		 365 aa  114  5e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1611  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  49.09 
 
 		 802 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0326681 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1390  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.62 
 
 		 805 aa  109  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000278441  hitchhiker  0.0000000134181 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1455  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.62 
 
 		 805 aa  109  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00029067  hitchhiker  0.000623133 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.62 
 
 		 809 aa  109  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000125277  hitchhiker  0.0000000821824 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0712  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  49.49 
 
 		 579 aa  108  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.482553 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2779  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.62 
 
 		 819 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000279348  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1578  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.72 
 
 		 819 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000462777  hitchhiker  0.00000000445269 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2799  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.62 
 
 		 819 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000118341  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2874  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.62 
 
 		 819 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000394785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3041  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.28 
 
 		 807 aa  108  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.022997  normal  0.0310863 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2185  cold-active serine alkaline protease  49.51 
 
 		 803 aa  106  9e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000390899  decreased coverage  0.00433013 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  35.97 
 
 		 617 aa  106  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  33.33 
 
 		 614 aa  106  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3106  cold-active serine alkaline protease  46.96 
 
 		 807 aa  105  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1409  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.71 
 
 		 803 aa  104  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000345823  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2477  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.45 
 
 		 823 aa  103  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000447493  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2692  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.31 
 
 		 818 aa  103  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1896  Endonuclease I  34.19 
 
 		 272 aa  103  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0556  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.06 
 
 		 494 aa  100  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0947915  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0427  peptidase domain-containing protein  48 
 
 		 553 aa  100  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0115  lysyl endopeptidase  38.97 
 
 		 823 aa  98.2  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.585546  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0751  cold-active alkaline serine protease  46.46 
 
 		 789 aa  94  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0428  peptidase M4, thermolysin  43 
 
 		 775 aa  94  6e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2373  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.46 
 
 		 628 aa  94  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.200632  normal  0.503534 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3200  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.53 
 
 		 629 aa  92.8  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3194  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.53 
 
 		 629 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3338  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.53 
 
 		 629 aa  92.8  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1173  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.53 
 
 		 629 aa  92.4  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3015  peptidase M4, thermolysin  44 
 
 		 777 aa  91.7  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1016  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.22 
 
 		 630 aa  90.9  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2871  cold-active alkaline serine protease  45.45 
 
 		 789 aa  90.9  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3874  peptidase M4 thermolysin  37.58 
 
 		 778 aa  90.9  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0456  peptidase M4 thermolysin  36.94 
 
 		 778 aa  90.9  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0371  hemagglutinin/protease  44.04 
 
 		 609 aa  90.1  9e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02449  hypothetical protein  45.1 
 
 		 489 aa  90.1  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001489  alkaline serine exoprotease A precursor  43.1 
 
 		 534 aa  89.4  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0465  peptidase M4 thermolysin  36.94 
 
 		 778 aa  87.8  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4109  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40 
 
 		 520 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.941558 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0439  peptidase M4 thermolysin  36.94 
 
 		 778 aa  87.8  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04872  cold-active alkaline serine protease  42.86 
 
 		 794 aa  87.4  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03458  cold-active serine alkaline protease  45 
 
 		 533 aa  87  8e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0416206  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4761  Endonuclease I  37.72 
 
 		 341 aa  85.5  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0283458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48915  predicted protein  34.5 
 
 		 516 aa  84.7  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000274  neutral protease precursor  39.39 
 
 		 701 aa  81.3  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0557  peptidase M4 thermolysin  48.75 
 
 		 774 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04561  extracellular protease  39.78 
 
 		 560 aa  77  0.0000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.550722  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4067  endonuclease I  33.11 
 
 		 219 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0378834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5532  Endonuclease I  30.15 
 
 		 232 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0708603 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0422  hypothetical protein  36.73 
 
 		 476 aa  72.8  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0260128  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02448  protease  44.94 
 
 		 482 aa  72.8  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  36.63 
 
 		 501 aa  72  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf874  membrane nuclease  33.53 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2341  alkaline serine protease  35.29 
 
 		 535 aa  68.9  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00532226  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  32.11 
 
 		 677 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5708  peptidase domain protein  37.35 
 
 		 492 aa  67.4  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3375  deoxyribonuclease I  34.38 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2383  deoxyribonuclease I  34.38 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.178356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05516  aminopeptidase  33.66 
 
 		 504 aa  61.6  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2835  deoxyribonuclease I  37.98 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.667244 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2569  deoxyribonuclease I  33.59 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0107726  normal  0.160045 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1309  deoxyribonuclease I  37.21 
 
 		 229 aa  60.1  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.122078  normal  0.128017 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3757  deoxyribonuclease I  33.33 
 
 		 323 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.163237  normal  0.488138 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2065  deoxyribonuclease I  36.92 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.014094  normal  0.0314213 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1505  Endonuclease I  32.86 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.12259  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0545  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 		 617 aa  57.4  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0878069 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2748  endonuclease I  30.37 
 
 		 211 aa  57  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02674  protease  32.43 
 
 		 176 aa  55.8  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1477  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.96 
 
 		 947 aa  54.7  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4374  deoxyribonuclease I  27.08 
 
 		 288 aa  54.7  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000699204  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1066  extracellular nuclease  33.94 
 
 		 871 aa  53.5  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0624  deoxyribonuclease I  27.08 
 
 		 241 aa  53.5  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00856225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  42.65 
 
 		 523 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3516  Microbial collagenase  32.09 
 
 		 852 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>