77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_26920 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_26920  endonuclease I  100 
 
 		 256 aa  523  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1877  Endonuclease I  66.23 
 
 		 388 aa  315  6e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3323  ribonuclease  59.92 
 
 		 275 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.934207  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3124  ribonuclease  59.84 
 
 		 275 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0290634  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3370  ribonuclease  59.84 
 
 		 275 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1907  ribonuclease  59.13 
 
 		 275 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5127  Endonuclease I  57.98 
 
 		 378 aa  301  7.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.745225 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3049  endonuclease I  58.66 
 
 		 275 aa  296  2e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00672798  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1682  Endonuclease I  58.75 
 
 		 267 aa  281  7.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4257  endonuclease I  54.51 
 
 		 558 aa  240  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3289  endonuclease I  55.79 
 
 		 542 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363328  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0097  endonuclease I  54.08 
 
 		 558 aa  239  5e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3021  endonuclease I  55.32 
 
 		 553 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3396  endonuclease I  52.79 
 
 		 539 aa  231  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2634  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  52.49 
 
 		 1310 aa  230  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01224  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  51.88 
 
 		 1346 aa  228  7e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1033  endonuclease I  54.67 
 
 		 1503 aa  217  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.8795  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1948  endonuclease I  39.85 
 
 		 285 aa  149  6e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0543  endonuclease I  36.46 
 
 		 466 aa  142  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06200  YurI  36.26 
 
 		 657 aa  134  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3628  Endonuclease I  36.94 
 
 		 596 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001088  endonuclease I  33.09 
 
 		 538 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6326  Endonuclease I  36.48 
 
 		 442 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1896  Endonuclease I  37.33 
 
 		 272 aa  116  5e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10308  putative secreted ribonuclease  33.21 
 
 		 365 aa  115  7.999999999999999e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04827  ribonuclease  34.8 
 
 		 539 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  33.47 
 
 		 614 aa  112  8.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  36.4 
 
 		 617 aa  109  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48915  predicted protein  32 
 
 		 516 aa  86.3  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4761  Endonuclease I  29.89 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0283458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5532  Endonuclease I  33.51 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0708603 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf874  membrane nuclease  28 
 
 		 314 aa  75.9  0.0000000000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4067  endonuclease I  33.81 
 
 		 219 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0378834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1505  Endonuclease I  31.06 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.12259  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2748  endonuclease I  33.33 
 
 		 211 aa  57  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2661  Endonuclease I  32.5 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3757  deoxyribonuclease I  32.81 
 
 		 323 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.163237  normal  0.488138 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1309  deoxyribonuclease I  35.07 
 
 		 229 aa  52  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.122078  normal  0.128017 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2065  deoxyribonuclease I  36.57 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.014094  normal  0.0314213 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0833  endonuclease I  29.23 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0624  deoxyribonuclease I  27.27 
 
 		 241 aa  49.3  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00856225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2835  deoxyribonuclease I  36.09 
 
 		 229 aa  49.3  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.667244 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4374  deoxyribonuclease I  27.27 
 
 		 288 aa  49.3  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000699204  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3709  Deoxyribonuclease I  29.46 
 
 		 232 aa  48.5  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000796266  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2383  deoxyribonuclease I  31.01 
 
 		 321 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.178356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3907  Deoxyribonuclease I  29.46 
 
 		 232 aa  48.1  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000139034  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3971  deoxyribonuclease I  30.77 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2569  deoxyribonuclease I  31.01 
 
 		 321 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0107726  normal  0.160045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3375  deoxyribonuclease I  31.01 
 
 		 321 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0504  Deoxyribonuclease I  29.46 
 
 		 233 aa  46.6  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000136601  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0691  deoxyribonuclease I  28.36 
 
 		 257 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000438774  normal  0.686603 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0810  deoxyribonuclease I  28.36 
 
 		 258 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000171872  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03571  endonuclease I  29.77 
 
 		 231 aa  46.2  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3443  endonuclease I  28.36 
 
 		 257 aa  45.8  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000111641  hitchhiker  0.00909149 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3525  deoxyribonuclease I  28.36 
 
 		 258 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000100295  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3331  deoxyribonuclease I  28.36 
 
 		 257 aa  45.8  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000877394  normal  0.801712 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0835  Deoxyribonuclease I  28.36 
 
 		 258 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000225063  hitchhiker  0.0000104704 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3160  deoxyribonuclease I  28.46 
 
 		 259 aa  45.8  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000648022  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3288  endonuclease I  28.46 
 
 		 235 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.961762  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3103  endonuclease I  28.46 
 
 		 235 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02775  DNA-specific endonuclease I  28.46 
 
 		 235 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.153052  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02738  hypothetical protein  28.46 
 
 		 235 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.252778  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3377  endonuclease I  28.46 
 
 		 235 aa  45.4  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0769  deoxyribonuclease I  28.46 
 
 		 235 aa  45.4  0.0009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000516595  unclonable  0.0000000197257 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1350  deoxyribonuclease I  25.97 
 
 		 232 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002464  endonuclease I precursor  29.77 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0750  Deoxyribonuclease I  27.69 
 
 		 235 aa  44.3  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00967955  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1915  deoxyribonuclease I  29.66 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.468697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3087  endonuclease I  28.46 
 
 		 235 aa  44.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00686191  hitchhiker  0.0000298257 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0842  deoxyribonuclease I  28.46 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000267909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4133  deoxyribonuclease I  26.87 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0867821 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0576  deoxyribonuclease I  28.12 
 
 		 242 aa  43.5  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000000105466  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3223  deoxyribonuclease I  27.13 
 
 		 251 aa  43.9  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000396495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0547  Deoxyribonuclease I  29.46 
 
 		 232 aa  43.9  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000480912  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4248  endonuclease I  28.68 
 
 		 235 aa  43.9  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.260828 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28570  DNA-specific endonuclease I  27.93 
 
 		 237 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000174219 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2493  DNA-specific endonuclease I  27.93 
 
 		 237 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>